RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491859.5

USP19-215, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, humanhuman

TSL 3

Gene USP19, Length 919 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19-215ENST00000491859 STRCP1A6NGW2 1772 aa27.62■■■□□ 2.01
USP19-215ENST00000491859 IQSEC2Q5JU85 1478 aa27.62■■■□□ 2.01
USP19-215ENST00000491859 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.61■■■□□ 2.01
USP19-215ENST00000491859 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
USP19-215ENST00000491859 BCANQ96GW7 911 aa27.57■■■□□ 2
USP19-215ENST00000491859 HDGFP51858 240 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
USP19-215ENST00000491859 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
USP19-215ENST00000491859 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
USP19-215ENST00000491859 FOXD1Q16676 465 aa27.55■■■□□ 2
USP19-215ENST00000491859 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.55■■■□□ 2
USP19-215ENST00000491859 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP27.54■■■□□ 2
USP19-215ENST00000491859 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa27.54■■■□□ 2
USP19-215ENST00000491859 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
USP19-215ENST00000491859 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
USP19-215ENST00000491859 SLC26A8Q96RN1 970 aa27.53■■■□□ 2
USP19-215ENST00000491859 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa27.47■■□□□ 1.99
USP19-215ENST00000491859 CCDC144AA2RUR9 1427 aa27.46■■□□□ 1.99
USP19-215ENST00000491859 LRRC7Q96NW7 1537 aa27.46■■□□□ 1.99
USP19-215ENST00000491859 DIP2AQ14689 1571 aa27.45■■□□□ 1.99
USP19-215ENST00000491859 NWD1Q149M9 1564 aa27.43■■□□□ 1.98
USP19-215ENST00000491859 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
USP19-215ENST00000491859 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
USP19-215ENST00000491859 PPLO60437 1756 aa27.41■■□□□ 1.98
USP19-215ENST00000491859 UBAP1LF5GYI3 381 aa27.41■■□□□ 1.98
USP19-215ENST00000491859 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa27.41■■□□□ 1.98
USP19-215ENST00000491859 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa27.41■■□□□ 1.98
USP19-215ENST00000491859 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa27.39■■□□□ 1.98
USP19-215ENST00000491859 KCNA6P17658 529 aa27.39■■□□□ 1.98
USP19-215ENST00000491859 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
USP19-215ENST00000491859 TBX22Q9Y458 520 aa27.36■■□□□ 1.97
USP19-215ENST00000491859 HRCP23327 699 aa27.35■■□□□ 1.97
USP19-215ENST00000491859 IFT172Q9UG01 1749 aa27.33■■□□□ 1.96
USP19-215ENST00000491859 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa27.32■■□□□ 1.96
USP19-215ENST00000491859 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa27.31■■□□□ 1.96
USP19-215ENST00000491859 TOM1O60784 492 aa27.3■■□□□ 1.96
USP19-215ENST00000491859 TMEM94Q12767 1356 aa27.3■■□□□ 1.96
USP19-215ENST00000491859 PIK3R4Q99570 1358 aa27.3■■□□□ 1.96
USP19-215ENST00000491859 RGL3Q3MIN7 710 aa27.29■■□□□ 1.96
USP19-215ENST00000491859 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
USP19-215ENST00000491859 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
USP19-215ENST00000491859 ALKQ9UM73 1620 aa27.28■■□□□ 1.96
USP19-215ENST00000491859 VGFO15240 615 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
USP19-215ENST00000491859 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
USP19-215ENST00000491859 PIP4K2BP78356 416 aa27.26■■□□□ 1.95
USP19-215ENST00000491859 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
USP19-215ENST00000491859 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
USP19-215ENST00000491859 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa27.24■■□□□ 1.95
USP19-215ENST00000491859 PTPRUQ92729 1446 aa27.24■■□□□ 1.95
USP19-215ENST00000491859 METP08581 1390 aa27.22■■□□□ 1.95
USP19-215ENST00000491859 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa27.2■■□□□ 1.94
USP19-215ENST00000491859 MSH6P52701 1360 aa27.18■■□□□ 1.94
USP19-215ENST00000491859 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa27.17■■□□□ 1.94
USP19-215ENST00000491859 C14orf37Q86TY3 774 aa27.16■■□□□ 1.94
USP19-215ENST00000491859 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa27.12■■□□□ 1.93
USP19-215ENST00000491859 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
USP19-215ENST00000491859 MYOM2P54296 1465 aa27.12■■□□□ 1.93
USP19-215ENST00000491859 PIK3C2GO75747 1445 aa27.11■■□□□ 1.93
USP19-215ENST00000491859 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
USP19-215ENST00000491859 LAMC1P11047 1609 aa27.08■■□□□ 1.93
USP19-215ENST00000491859 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa27.07■■□□□ 1.92
USP19-215ENST00000491859 NALCNQ8IZF0 1738 aa27.07■■□□□ 1.92
USP19-215ENST00000491859 PTCH1Q13635 1447 aa27.07■■□□□ 1.92
USP19-215ENST00000491859 NRXN1Q9ULB1 1477 aa27.06■■□□□ 1.92
USP19-215ENST00000491859 HSPA1LP34931 641 aa27.06■■□□□ 1.92
USP19-215ENST00000491859 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa27.06■■□□□ 1.92
USP19-215ENST00000491859 KNDC1Q76NI1 1749 aa27.02■■□□□ 1.92
USP19-215ENST00000491859 PRAG1Q86YV5 1406 aa27.02■■□□□ 1.92
USP19-215ENST00000491859 C19orf44Q9H6X5 657 aa27.02■■□□□ 1.92
USP19-215ENST00000491859 ROBO2Q9HCK4 1378 aa27.01■■□□□ 1.91
USP19-215ENST00000491859 ATF3P18847 181 aa27.01■■□□□ 1.91
USP19-215ENST00000491859 FAM135BQ49AJ0 1406 aa27■■□□□ 1.91
USP19-215ENST00000491859 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa27■■□□□ 1.91
USP19-215ENST00000491859 DCCP43146 1447 aa26.99■■□□□ 1.91
USP19-215ENST00000491859 CADPS2Q86UW7 1296 aa26.99■■□□□ 1.91
USP19-215ENST00000491859 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.99■■□□□ 1.91
USP19-215ENST00000491859 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.99■■□□□ 1.91
USP19-215ENST00000491859 SLAIN2Q9P270 581 aa26.98■■□□□ 1.91
USP19-215ENST00000491859 TMEM132EQ6IEE7 984 aa26.97■■□□□ 1.91
USP19-215ENST00000491859 STK26Q9P289 416 aa26.97■■□□□ 1.91
USP19-215ENST00000491859 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
USP19-215ENST00000491859 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
USP19-215ENST00000491859 CFAP70Q5T0N1 1121 aa26.95■■□□□ 1.9
USP19-215ENST00000491859 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
USP19-215ENST00000491859 TECPR2O15040 1411 aa26.94■■□□□ 1.9
USP19-215ENST00000491859 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
USP19-215ENST00000491859 PHLPP1O60346 1717 aa26.92■■□□□ 1.9
USP19-215ENST00000491859 ABCC11Q96J66 1382 aa26.9■■□□□ 1.9
USP19-215ENST00000491859 STAC3Q96MF2 364 aa26.9■■□□□ 1.9
USP19-215ENST00000491859 MST1RQ04912 1400 aa26.89■■□□□ 1.89
USP19-215ENST00000491859 ADGRB1O14514 1584 aa26.88■■□□□ 1.89
USP19-215ENST00000491859 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa26.86■■□□□ 1.89
USP19-215ENST00000491859 WAPLQ7Z5K2 1190 aa26.85■■□□□ 1.89
USP19-215ENST00000491859 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.84■■□□□ 1.89
USP19-215ENST00000491859 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa26.84■■□□□ 1.89
USP19-215ENST00000491859 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.88
USP19-215ENST00000491859 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa26.82■■□□□ 1.88
USP19-215ENST00000491859 NEUROD1Q13562 356 aa26.82■■□□□ 1.88
USP19-215ENST00000491859 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
USP19-215ENST00000491859 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
USP19-215ENST00000491859 BRINP3Q76B58 766 aa26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms