RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491293.1

C1orf35-206, Transcript of chromosome 1 open reading frame 35, humanhuman

TSL 2

Gene C1orf35, Length 854 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf35-206ENST00000491293 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP36.6■■■■□ 3.45
C1orf35-206ENST00000491293 TRPM2O94759 1503 aa36.59■■■■□ 3.45
C1orf35-206ENST00000491293 CPS1P31327 1500 aa36.59■■■■□ 3.45
C1orf35-206ENST00000491293 CLTCL1P53675 1640 aa36.59■■■■□ 3.45
C1orf35-206ENST00000491293 ZFYVE9O95405 1425 aa36.58■■■■□ 3.45
C1orf35-206ENST00000491293 RIMS2Q9UQ26 1411 aa36.58■■■■□ 3.45
C1orf35-206ENST00000491293 IQGAP1P46940 1657 aa36.57■■■■□ 3.44
C1orf35-206ENST00000491293 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP36.56■■■■□ 3.44
C1orf35-206ENST00000491293 PIP4K2BP78356 416 aa36.53■■■■□ 3.44
C1orf35-206ENST00000491293 HRCP23327 699 aa36.51■■■■□ 3.44
C1orf35-206ENST00000491293 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP36.51■■■■□ 3.43
C1orf35-206ENST00000491293 TOM1O60784 492 aa36.49■■■■□ 3.43
C1orf35-206ENST00000491293 SLC26A8Q96RN1 970 aa36.49■■■■□ 3.43
C1orf35-206ENST00000491293 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP36.48■■■■□ 3.43
C1orf35-206ENST00000491293 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP36.47■■■■□ 3.43
C1orf35-206ENST00000491293 ILDR2Q71H61 639 aa36.46■■■■□ 3.43
C1orf35-206ENST00000491293 BCANQ96GW7 911 aa36.45■■■■□ 3.43
C1orf35-206ENST00000491293 HDGFP51858 240 aaKnown RBP36.43■■■■□ 3.42
C1orf35-206ENST00000491293 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP36.43■■■■□ 3.42
C1orf35-206ENST00000491293 STRCP1A6NGW2 1772 aa36.41■■■■□ 3.42
C1orf35-206ENST00000491293 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa36.4■■■■□ 3.42
C1orf35-206ENST00000491293 HSPA1LP34931 641 aa36.39■■■■□ 3.42
C1orf35-206ENST00000491293 CCDC144AA2RUR9 1427 aa36.37■■■■□ 3.41
C1orf35-206ENST00000491293 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP36.37■■■■□ 3.41
C1orf35-206ENST00000491293 LRRC7Q96NW7 1537 aa36.36■■■■□ 3.41
C1orf35-206ENST00000491293 RGL3Q3MIN7 710 aa36.33■■■■□ 3.41
C1orf35-206ENST00000491293 KIF1BO60333 1816 aa36.33■■■■□ 3.41
C1orf35-206ENST00000491293 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa36.31■■■■□ 3.4
C1orf35-206ENST00000491293 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa36.3■■■■□ 3.4
C1orf35-206ENST00000491293 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa36.3■■■■□ 3.4
C1orf35-206ENST00000491293 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa36.28■■■■□ 3.4
C1orf35-206ENST00000491293 ALKQ9UM73 1620 aa36.27■■■■□ 3.4
C1orf35-206ENST00000491293 TBX22Q9Y458 520 aa36.26■■■■□ 3.4
C1orf35-206ENST00000491293 KCNA6P17658 529 aa36.24■■■■□ 3.39
C1orf35-206ENST00000491293 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa36.22■■■■□ 3.39
C1orf35-206ENST00000491293 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP36.21■■■■□ 3.39
C1orf35-206ENST00000491293 VGFO15240 615 aaPredicted RBP36.18■■■■□ 3.38
C1orf35-206ENST00000491293 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa36.18■■■■□ 3.38
C1orf35-206ENST00000491293 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa36.15■■■■□ 3.38
C1orf35-206ENST00000491293 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa36.15■■■■□ 3.38
C1orf35-206ENST00000491293 SOCS7O14512 581 aa36.14■■■■□ 3.38
C1orf35-206ENST00000491293 METP08581 1390 aa36.13■■■■□ 3.37
C1orf35-206ENST00000491293 PTPRUQ92729 1446 aa36.12■■■■□ 3.37
C1orf35-206ENST00000491293 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP36.11■■■■□ 3.37
C1orf35-206ENST00000491293 PPLO60437 1756 aa36.11■■■■□ 3.37
C1orf35-206ENST00000491293 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP36.1■■■■□ 3.37
C1orf35-206ENST00000491293 DIP2AQ14689 1571 aa36.08■■■■□ 3.37
C1orf35-206ENST00000491293 NWD1Q149M9 1564 aa36.08■■■■□ 3.37
C1orf35-206ENST00000491293 TMEM94Q12767 1356 aa36.07■■■■□ 3.36
C1orf35-206ENST00000491293 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa36.07■■■■□ 3.36
C1orf35-206ENST00000491293 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
C1orf35-206ENST00000491293 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP36.04■■■■□ 3.36
C1orf35-206ENST00000491293 PIK3R4Q99570 1358 aa36.03■■■■□ 3.36
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C1orf35-206ENST00000491293 IFT172Q9UG01 1749 aa36■■■■□ 3.35
C1orf35-206ENST00000491293 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP35.99■■■■□ 3.35
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C1orf35-206ENST00000491293 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa35.95■■■■□ 3.35
C1orf35-206ENST00000491293 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP35.94■■■■□ 3.34
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C1orf35-206ENST00000491293 PCGF6Q9BYE7 350 aa35.93■■■■□ 3.34
C1orf35-206ENST00000491293 PIK3C2GO75747 1445 aa35.92■■■■□ 3.34
C1orf35-206ENST00000491293 TMEM132EQ6IEE7 984 aa35.9■■■■□ 3.34
C1orf35-206ENST00000491293 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP35.9■■■■□ 3.34
C1orf35-206ENST00000491293 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP35.89■■■■□ 3.34
C1orf35-206ENST00000491293 NRXN1Q9ULB1 1477 aa35.88■■■■□ 3.33
C1orf35-206ENST00000491293 CFAP70Q5T0N1 1121 aa35.88■■■■□ 3.33
C1orf35-206ENST00000491293 MYOM2P54296 1465 aa35.87■■■■□ 3.33
C1orf35-206ENST00000491293 FAM135BQ49AJ0 1406 aa35.87■■■■□ 3.33
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C1orf35-206ENST00000491293 C14orf37Q86TY3 774 aa35.84■■■■□ 3.33
C1orf35-206ENST00000491293 MSH6P52701 1360 aa35.83■■■■□ 3.33
C1orf35-206ENST00000491293 ROBO2Q9HCK4 1378 aa35.82■■■■□ 3.32
C1orf35-206ENST00000491293 STK26Q9P289 416 aa35.82■■■■□ 3.32
C1orf35-206ENST00000491293 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa35.82■■■■□ 3.32
C1orf35-206ENST00000491293 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa35.77■■■■□ 3.32
C1orf35-206ENST00000491293 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa35.77■■■■□ 3.32
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C1orf35-206ENST00000491293 C19orf44Q9H6X5 657 aa35.75■■■■□ 3.31
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C1orf35-206ENST00000491293 PTCH1Q13635 1447 aa35.71■■■■□ 3.31
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C1orf35-206ENST00000491293 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP35.69■■■■□ 3.3
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C1orf35-206ENST00000491293 PRAG1Q86YV5 1406 aa35.68■■■■□ 3.3
C1orf35-206ENST00000491293 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP35.68■■■■□ 3.3
C1orf35-206ENST00000491293 ABCC11Q96J66 1382 aa35.67■■■■□ 3.3
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C1orf35-206ENST00000491293 ATF3P18847 181 aa35.66■■■■□ 3.3
C1orf35-206ENST00000491293 CADPS2Q86UW7 1296 aa35.64■■■■□ 3.3
C1orf35-206ENST00000491293 TECPR2O15040 1411 aa35.64■■■■□ 3.3
C1orf35-206ENST00000491293 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa35.64■■■■□ 3.3
C1orf35-206ENST00000491293 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP35.62■■■■□ 3.29
C1orf35-206ENST00000491293 ADGRB1O14514 1584 aa35.62■■■■□ 3.29
C1orf35-206ENST00000491293 LAMC1P11047 1609 aa35.6■■■■□ 3.29
C1orf35-206ENST00000491293 NALCNQ8IZF0 1738 aa35.59■■■■□ 3.29
C1orf35-206ENST00000491293 TRAK1Q9UPV9 953 aa35.58■■■■□ 3.29
C1orf35-206ENST00000491293 NBPF1Q3BBV0 1214 aa35.57■■■■□ 3.28
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