RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490738.5

CAMTA1-213, Transcript of calmodulin binding transcription activator 1, humanhuman

TSL 2

Gene CAMTA1, Length 538 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1-213ENST00000490738 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP41.61■■■■■ 4.25
CAMTA1-213ENST00000490738 NWD1Q149M9 1564 aa41.61■■■■■ 4.25
CAMTA1-213ENST00000490738 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa41.61■■■■■ 4.25
CAMTA1-213ENST00000490738 MYO5BQ9ULV0 1848 aa41.6■■■■■ 4.25
CAMTA1-213ENST00000490738 BCANQ96GW7 911 aa41.6■■■■■ 4.25
CAMTA1-213ENST00000490738 FAM135BQ49AJ0 1406 aa41.6■■■■■ 4.25
CAMTA1-213ENST00000490738 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP41.59■■■■■ 4.25
CAMTA1-213ENST00000490738 RIMS2Q9UQ26 1411 aa41.58■■■■■ 4.25
CAMTA1-213ENST00000490738 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa41.57■■■■■ 4.25
CAMTA1-213ENST00000490738 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP41.57■■■■■ 4.25
CAMTA1-213ENST00000490738 E9PCH4 1651 aa41.56■■■■■ 4.24
CAMTA1-213ENST00000490738 IQGAP3Q86VI3 1631 aa41.53■■■■■ 4.24
CAMTA1-213ENST00000490738 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP41.51■■■■■ 4.24
CAMTA1-213ENST00000490738 HDGFP51858 240 aaKnown RBP41.51■■■■■ 4.24
CAMTA1-213ENST00000490738 ITGAEP38570 1179 aa41.49■■■■■ 4.23
CAMTA1-213ENST00000490738 CHGAP10645 457 aaKnown RBP41.48■■■■■ 4.23
CAMTA1-213ENST00000490738 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP41.47■■■■■ 4.23
CAMTA1-213ENST00000490738 NUP155O75694 1391 aa41.46■■■■■ 4.23
CAMTA1-213ENST00000490738 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa41.45■■■■■ 4.23
CAMTA1-213ENST00000490738 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.22
CAMTA1-213ENST00000490738 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP41.43■■■■■ 4.22
CAMTA1-213ENST00000490738 TBX22Q9Y458 520 aa41.43■■■■■ 4.22
CAMTA1-213ENST00000490738 MSH6P52701 1360 aa41.41■■■■■ 4.22
CAMTA1-213ENST00000490738 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP41.4■■■■■ 4.22
CAMTA1-213ENST00000490738 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa41.38■■■■■ 4.22
CAMTA1-213ENST00000490738 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP41.38■■■■■ 4.21
CAMTA1-213ENST00000490738 SLAIN2Q9P270 581 aa41.33■■■■■ 4.21
CAMTA1-213ENST00000490738 DIP2AQ14689 1571 aa41.29■■■■■ 4.2
CAMTA1-213ENST00000490738 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa41.27■■■■■ 4.2
CAMTA1-213ENST00000490738 PIK3R4Q99570 1358 aa41.25■■■■■ 4.19
CAMTA1-213ENST00000490738 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa41.18■■■■■ 4.18
CAMTA1-213ENST00000490738 PHLPP1O60346 1717 aa41.18■■■■■ 4.18
CAMTA1-213ENST00000490738 TRPM2O94759 1503 aa41.18■■■■■ 4.18
CAMTA1-213ENST00000490738 PTPRUQ92729 1446 aa41.18■■■■■ 4.18
CAMTA1-213ENST00000490738 C14orf37Q86TY3 774 aa41.16■■■■■ 4.18
CAMTA1-213ENST00000490738 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP41.16■■■■■ 4.18
CAMTA1-213ENST00000490738 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa41.15■■■■■ 4.18
CAMTA1-213ENST00000490738 C19orf44Q9H6X5 657 aa41.14■■■■■ 4.18
CAMTA1-213ENST00000490738 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP41.13■■■■■ 4.17
CAMTA1-213ENST00000490738 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa41.12■■■■■ 4.17
CAMTA1-213ENST00000490738 POTEAQ6S8J7 498 aa41.1■■■■■ 4.17
CAMTA1-213ENST00000490738 CADPS2Q86UW7 1296 aa41.1■■■■■ 4.17
CAMTA1-213ENST00000490738 JCADQ9P266 1359 aa41.1■■■■■ 4.17
CAMTA1-213ENST00000490738 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa41.09■■■■■ 4.17
CAMTA1-213ENST00000490738 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP41.08■■■■■ 4.17
CAMTA1-213ENST00000490738 NAIPQ13075 1403 aa41.08■■■■■ 4.17
CAMTA1-213ENST00000490738 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP41.07■■■■■ 4.17
CAMTA1-213ENST00000490738 ATF3P18847 181 aa41.06■■■■■ 4.16
CAMTA1-213ENST00000490738 CLTCL1P53675 1640 aa41.04■■■■■ 4.16
CAMTA1-213ENST00000490738 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP41.01■■■■■ 4.16
CAMTA1-213ENST00000490738 METP08581 1390 aa40.99■■■■■ 4.15
CAMTA1-213ENST00000490738 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP40.98■■■■■ 4.15
CAMTA1-213ENST00000490738 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa40.98■■■■■ 4.15
CAMTA1-213ENST00000490738 DCCP43146 1447 aa40.93■■■■■ 4.14
CAMTA1-213ENST00000490738 BRINP3Q76B58 766 aa40.93■■■■■ 4.14
CAMTA1-213ENST00000490738 LRP6O75581 1613 aa40.9■■■■■ 4.14
CAMTA1-213ENST00000490738 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa40.9■■■■■ 4.14
CAMTA1-213ENST00000490738 HFM1A2PYH4 1435 aa40.88■■■■■ 4.13
CAMTA1-213ENST00000490738 KIF1BO60333 1816 aa40.86■■■■■ 4.13
CAMTA1-213ENST00000490738 MST1RQ04912 1400 aa40.84■■■■■ 4.13
CAMTA1-213ENST00000490738 TRIM52Q96A61 297 aa40.84■■■■■ 4.13
CAMTA1-213ENST00000490738 SHPRHQ149N8 1683 aa40.84■■■■■ 4.13
CAMTA1-213ENST00000490738 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa40.82■■■■■ 4.12
CAMTA1-213ENST00000490738 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa40.79■■■■■ 4.12
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CAMTA1-213ENST00000490738 VGFO15240 615 aaPredicted RBP40.74■■■■■ 4.11
CAMTA1-213ENST00000490738 NALCNQ8IZF0 1738 aa40.73■■■■■ 4.11
CAMTA1-213ENST00000490738 NHSL1Q5SYE7 1610 aa40.72■■■■■ 4.11
CAMTA1-213ENST00000490738 SETD5Q9C0A6 1442 aa40.72■■■■■ 4.11
CAMTA1-213ENST00000490738 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP40.71■■■■■ 4.11
CAMTA1-213ENST00000490738 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa40.68■■■■■ 4.1
CAMTA1-213ENST00000490738 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP40.67■■■■■ 4.1
CAMTA1-213ENST00000490738 PTCH1Q13635 1447 aa40.67■■■■■ 4.1
CAMTA1-213ENST00000490738 ROBO2Q9HCK4 1378 aa40.65■■■■■ 4.1
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CAMTA1-213ENST00000490738 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP40.64■■■■■ 4.1
CAMTA1-213ENST00000490738 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP40.64■■■■■ 4.1
CAMTA1-213ENST00000490738 FOXD1Q16676 465 aa40.63■■■■■ 4.09
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CAMTA1-213ENST00000490738 PRAG1Q86YV5 1406 aa40.6■■■■■ 4.09
CAMTA1-213ENST00000490738 C1orf167Q5SNV9 1468 aa40.6■■■■■ 4.09
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CAMTA1-213ENST00000490738 ORAI2Q96SN7 254 aa40.5■■■■■ 4.07
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CAMTA1-213ENST00000490738 LAMC1P11047 1609 aa40.49■■■■■ 4.07
CAMTA1-213ENST00000490738 RXRBP28702 533 aa40.47■■■■■ 4.07
CAMTA1-213ENST00000490738 CCDC144AA2RUR9 1427 aa40.47■■■■■ 4.07
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CAMTA1-213ENST00000490738 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa40.45■■■■■ 4.07
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CAMTA1-213ENST00000490738 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP40.43■■■■■ 4.06
CAMTA1-213ENST00000490738 RGL3Q3MIN7 710 aa40.42■■■■■ 4.06
CAMTA1-213ENST00000490738 C8orf37Q96NL8 207 aa40.41■■■■■ 4.06
CAMTA1-213ENST00000490738 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP40.38■■■■■ 4.05
CAMTA1-213ENST00000490738 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP40.37■■■■■ 4.05
CAMTA1-213ENST00000490738 IFT172Q9UG01 1749 aa40.36■■■■■ 4.05
CAMTA1-213ENST00000490738 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa40.35■■■■■ 4.05
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