RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490425.1

NISCH-214, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 5

Gene NISCH, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-214ENST00000490425 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
NISCH-214ENST00000490425 FOXD1Q16676 465 aa17.95■□□□□ 0.46
NISCH-214ENST00000490425 BCANQ96GW7 911 aa17.95■□□□□ 0.46
NISCH-214ENST00000490425 SLC26A8Q96RN1 970 aa17.95■□□□□ 0.46
NISCH-214ENST00000490425 SETD5Q9C0A6 1442 aa17.95■□□□□ 0.46
NISCH-214ENST00000490425 CLTCL1P53675 1640 aa17.94■□□□□ 0.46
NISCH-214ENST00000490425 TRPM2O94759 1503 aa17.93■□□□□ 0.46
NISCH-214ENST00000490425 HDGFP51858 240 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
NISCH-214ENST00000490425 UBAP1LF5GYI3 381 aa17.91■□□□□ 0.46
NISCH-214ENST00000490425 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP17.91■□□□□ 0.46
NISCH-214ENST00000490425 MPHOSPH9Q99550 1183 aa17.91■□□□□ 0.46
NISCH-214ENST00000490425 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa17.91■□□□□ 0.46
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NISCH-214ENST00000490425 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa17.9■□□□□ 0.46
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NISCH-214ENST00000490425 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa17.83■□□□□ 0.45
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NISCH-214ENST00000490425 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
NISCH-214ENST00000490425 TBX22Q9Y458 520 aa17.82■□□□□ 0.44
NISCH-214ENST00000490425 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa17.82■□□□□ 0.44
NISCH-214ENST00000490425 TOM1O60784 492 aa17.81■□□□□ 0.44
NISCH-214ENST00000490425 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
NISCH-214ENST00000490425 NWD1Q149M9 1564 aa17.8■□□□□ 0.44
NISCH-214ENST00000490425 CCDC144AA2RUR9 1427 aa17.8■□□□□ 0.44
NISCH-214ENST00000490425 TMEM94Q12767 1356 aa17.79■□□□□ 0.44
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NISCH-214ENST00000490425 ALKQ9UM73 1620 aa17.79■□□□□ 0.44
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NISCH-214ENST00000490425 DIP2AQ14689 1571 aa17.79■□□□□ 0.44
NISCH-214ENST00000490425 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa17.78■□□□□ 0.44
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NISCH-214ENST00000490425 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa17.77■□□□□ 0.44
NISCH-214ENST00000490425 RGL3Q3MIN7 710 aa17.76■□□□□ 0.43
NISCH-214ENST00000490425 PTPRUQ92729 1446 aa17.75■□□□□ 0.43
NISCH-214ENST00000490425 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa17.74■□□□□ 0.43
NISCH-214ENST00000490425 VGFO15240 615 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
NISCH-214ENST00000490425 HRCP23327 699 aa17.74■□□□□ 0.43
NISCH-214ENST00000490425 PIK3R4Q99570 1358 aa17.74■□□□□ 0.43
NISCH-214ENST00000490425 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa17.73■□□□□ 0.43
NISCH-214ENST00000490425 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa17.73■□□□□ 0.43
NISCH-214ENST00000490425 METP08581 1390 aa17.73■□□□□ 0.43
NISCH-214ENST00000490425 PPLO60437 1756 aa17.72■□□□□ 0.43
NISCH-214ENST00000490425 HSPA1LP34931 641 aa17.71■□□□□ 0.43
NISCH-214ENST00000490425 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa17.69■□□□□ 0.42
NISCH-214ENST00000490425 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa17.68■□□□□ 0.42
NISCH-214ENST00000490425 C14orf37Q86TY3 774 aa17.68■□□□□ 0.42
NISCH-214ENST00000490425 MSH6P52701 1360 aa17.67■□□□□ 0.42
NISCH-214ENST00000490425 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
NISCH-214ENST00000490425 IFT172Q9UG01 1749 aa17.66■□□□□ 0.42
NISCH-214ENST00000490425 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP17.65■□□□□ 0.42
NISCH-214ENST00000490425 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa17.64■□□□□ 0.41
NISCH-214ENST00000490425 C19orf44Q9H6X5 657 aa17.61■□□□□ 0.41
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NISCH-214ENST00000490425 FAM135BQ49AJ0 1406 aa17.61■□□□□ 0.41
NISCH-214ENST00000490425 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP17.61■□□□□ 0.41
NISCH-214ENST00000490425 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa17.59■□□□□ 0.41
NISCH-214ENST00000490425 PIK3C2GO75747 1445 aa17.59■□□□□ 0.41
NISCH-214ENST00000490425 ROBO2Q9HCK4 1378 aa17.59■□□□□ 0.41
NISCH-214ENST00000490425 ATF3P18847 181 aa17.59■□□□□ 0.41
NISCH-214ENST00000490425 TMEM132EQ6IEE7 984 aa17.58■□□□□ 0.4
NISCH-214ENST00000490425 CADPS2Q86UW7 1296 aa17.57■□□□□ 0.4
NISCH-214ENST00000490425 STK26Q9P289 416 aa17.57■□□□□ 0.4
NISCH-214ENST00000490425 MYOM2P54296 1465 aa17.56■□□□□ 0.4
NISCH-214ENST00000490425 PTCH1Q13635 1447 aa17.56■□□□□ 0.4
NISCH-214ENST00000490425 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa17.56■□□□□ 0.4
NISCH-214ENST00000490425 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa17.56■□□□□ 0.4
NISCH-214ENST00000490425 NRXN1Q9ULB1 1477 aa17.56■□□□□ 0.4
NISCH-214ENST00000490425 CFAP70Q5T0N1 1121 aa17.55■□□□□ 0.4
NISCH-214ENST00000490425 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa17.55■□□□□ 0.4
NISCH-214ENST00000490425 DISP3Q9P2K9 1392 aa17.54■□□□□ 0.4
NISCH-214ENST00000490425 DCAF11Q8TEB1 546 aa17.54■□□□□ 0.4
NISCH-214ENST00000490425 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
NISCH-214ENST00000490425 NALCNQ8IZF0 1738 aa17.54■□□□□ 0.4
NISCH-214ENST00000490425 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
NISCH-214ENST00000490425 DCCP43146 1447 aa17.53■□□□□ 0.4
NISCH-214ENST00000490425 PRAG1Q86YV5 1406 aa17.53■□□□□ 0.4
NISCH-214ENST00000490425 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
NISCH-214ENST00000490425 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.39
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NISCH-214ENST00000490425 MST1RQ04912 1400 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-214ENST00000490425 WAPLQ7Z5K2 1190 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-214ENST00000490425 TECPR2O15040 1411 aa17.49■□□□□ 0.39
NISCH-214ENST00000490425 BRINP3Q76B58 766 aa17.49■□□□□ 0.39
NISCH-214ENST00000490425 ABCC11Q96J66 1382 aa17.49■□□□□ 0.39
NISCH-214ENST00000490425 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa17.48■□□□□ 0.39
NISCH-214ENST00000490425 LAMC1P11047 1609 aa17.47■□□□□ 0.39
NISCH-214ENST00000490425 PHLPP1O60346 1717 aa17.47■□□□□ 0.39
NISCH-214ENST00000490425 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP17.47■□□□□ 0.39
NISCH-214ENST00000490425 KNDC1Q76NI1 1749 aa17.47■□□□□ 0.39
NISCH-214ENST00000490425 SIN3AQ96ST3 1273 aa17.46■□□□□ 0.39
NISCH-214ENST00000490425 STAC3Q96MF2 364 aa17.44■□□□□ 0.38
NISCH-214ENST00000490425 C1orf167Q5SNV9 1468 aa17.44■□□□□ 0.38
NISCH-214ENST00000490425 ADGRB1O14514 1584 aa17.43■□□□□ 0.38
NISCH-214ENST00000490425 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
NISCH-214ENST00000490425 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
NISCH-214ENST00000490425 NEUROD1Q13562 356 aa17.42■□□□□ 0.38
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