RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489918.1

C1orf61-220, Transcript of chromosome 1 open reading frame 61, humanhuman

TSL 3

Gene C1orf61, Length 427 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61-220ENST00000489918 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
C1orf61-220ENST00000489918 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.41■■■□□ 2.3
C1orf61-220ENST00000489918 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
C1orf61-220ENST00000489918 SLC26A8Q96RN1 970 aa29.4■■■□□ 2.3
C1orf61-220ENST00000489918 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
C1orf61-220ENST00000489918 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa29.38■■■□□ 2.29
C1orf61-220ENST00000489918 FOXD1Q16676 465 aa29.37■■■□□ 2.29
C1orf61-220ENST00000489918 BCANQ96GW7 911 aa29.36■■■□□ 2.29
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C1orf61-220ENST00000489918 HDGFP51858 240 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
C1orf61-220ENST00000489918 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP29.34■■■□□ 2.29
C1orf61-220ENST00000489918 UBAP1LF5GYI3 381 aa29.33■■■□□ 2.29
C1orf61-220ENST00000489918 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.33■■■□□ 2.29
C1orf61-220ENST00000489918 MPHOSPH9Q99550 1183 aa29.32■■■□□ 2.28
C1orf61-220ENST00000489918 KIF1BO60333 1816 aa29.31■■■□□ 2.28
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C1orf61-220ENST00000489918 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa29.27■■■□□ 2.28
C1orf61-220ENST00000489918 KCNA6P17658 529 aa29.26■■■□□ 2.27
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C1orf61-220ENST00000489918 NWD1Q149M9 1564 aa29.25■■■□□ 2.27
C1orf61-220ENST00000489918 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa29.25■■■□□ 2.27
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C1orf61-220ENST00000489918 TBX22Q9Y458 520 aa29.22■■■□□ 2.27
C1orf61-220ENST00000489918 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa29.21■■■□□ 2.27
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C1orf61-220ENST00000489918 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.27
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C1orf61-220ENST00000489918 TMEM94Q12767 1356 aa29.18■■■□□ 2.26
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C1orf61-220ENST00000489918 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.17■■■□□ 2.26
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C1orf61-220ENST00000489918 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
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C1orf61-220ENST00000489918 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.11■■■□□ 2.25
C1orf61-220ENST00000489918 PTPRUQ92729 1446 aa29.11■■■□□ 2.25
C1orf61-220ENST00000489918 PIK3R4Q99570 1358 aa29.1■■■□□ 2.25
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C1orf61-220ENST00000489918 METP08581 1390 aa29.07■■■□□ 2.24
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C1orf61-220ENST00000489918 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa29.05■■■□□ 2.24
C1orf61-220ENST00000489918 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
C1orf61-220ENST00000489918 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
C1orf61-220ENST00000489918 IFT172Q9UG01 1749 aa29.01■■■□□ 2.23
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C1orf61-220ENST00000489918 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa28.98■■■□□ 2.23
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C1orf61-220ENST00000489918 C14orf37Q86TY3 774 aa28.93■■■□□ 2.22
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C1orf61-220ENST00000489918 C19orf44Q9H6X5 657 aa28.87■■■□□ 2.21
C1orf61-220ENST00000489918 PIK3C2GO75747 1445 aa28.86■■■□□ 2.21
C1orf61-220ENST00000489918 SLAIN2Q9P270 581 aa28.85■■■□□ 2.21
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C1orf61-220ENST00000489918 PTCH1Q13635 1447 aa28.83■■■□□ 2.21
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C1orf61-220ENST00000489918 MYOM2P54296 1465 aa28.82■■■□□ 2.2
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C1orf61-220ENST00000489918 PRAG1Q86YV5 1406 aa28.81■■■□□ 2.2
C1orf61-220ENST00000489918 NALCNQ8IZF0 1738 aa28.8■■■□□ 2.2
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C1orf61-220ENST00000489918 CADPS2Q86UW7 1296 aa28.8■■■□□ 2.2
C1orf61-220ENST00000489918 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa28.78■■■□□ 2.2
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C1orf61-220ENST00000489918 DCCP43146 1447 aa28.77■■■□□ 2.2
C1orf61-220ENST00000489918 DISP3Q9P2K9 1392 aa28.75■■■□□ 2.19
C1orf61-220ENST00000489918 CFAP70Q5T0N1 1121 aa28.74■■■□□ 2.19
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C1orf61-220ENST00000489918 STK26Q9P289 416 aa28.74■■■□□ 2.19
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C1orf61-220ENST00000489918 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.72■■■□□ 2.19
C1orf61-220ENST00000489918 TECPR2O15040 1411 aa28.71■■■□□ 2.19
C1orf61-220ENST00000489918 MST1RQ04912 1400 aa28.71■■■□□ 2.19
C1orf61-220ENST00000489918 LAMC1P11047 1609 aa28.7■■■□□ 2.19
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C1orf61-220ENST00000489918 KNDC1Q76NI1 1749 aa28.69■■■□□ 2.18
C1orf61-220ENST00000489918 PHLPP1O60346 1717 aa28.69■■■□□ 2.18
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C1orf61-220ENST00000489918 ABCC11Q96J66 1382 aa28.68■■■□□ 2.18
C1orf61-220ENST00000489918 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
C1orf61-220ENST00000489918 WAPLQ7Z5K2 1190 aa28.67■■■□□ 2.18
C1orf61-220ENST00000489918 BRINP3Q76B58 766 aa28.66■■■□□ 2.18
C1orf61-220ENST00000489918 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa28.65■■■□□ 2.18
C1orf61-220ENST00000489918 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
C1orf61-220ENST00000489918 ADGRB1O14514 1584 aa28.62■■■□□ 2.17
C1orf61-220ENST00000489918 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
C1orf61-220ENST00000489918 C1orf167Q5SNV9 1468 aa28.59■■■□□ 2.17
C1orf61-220ENST00000489918 STAC3Q96MF2 364 aa28.59■■■□□ 2.17
C1orf61-220ENST00000489918 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa28.58■■■□□ 2.17
C1orf61-220ENST00000489918 SIN3AQ96ST3 1273 aa28.57■■■□□ 2.16
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