RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477440.6

ARHGEF3-208, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 3

Gene ARHGEF3, Length 587 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-208ENST00000477440 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP37.76■■■■□ 3.64
ARHGEF3-208ENST00000477440 STRCP1A6NGW2 1772 aa37.74■■■■□ 3.63
ARHGEF3-208ENST00000477440 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP37.68■■■■□ 3.62
ARHGEF3-208ENST00000477440 CPS1P31327 1500 aa37.66■■■■□ 3.62
ARHGEF3-208ENST00000477440 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa37.66■■■■□ 3.62
ARHGEF3-208ENST00000477440 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP37.65■■■■□ 3.62
ARHGEF3-208ENST00000477440 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP37.65■■■■□ 3.62
ARHGEF3-208ENST00000477440 HDGFP51858 240 aaKnown RBP37.64■■■■□ 3.62
ARHGEF3-208ENST00000477440 FBXO41Q8TF61 875 aa37.64■■■■□ 3.62
ARHGEF3-208ENST00000477440 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP37.64■■■■□ 3.62
ARHGEF3-208ENST00000477440 IQSEC2Q5JU85 1478 aa37.64■■■■□ 3.62
ARHGEF3-208ENST00000477440 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP37.63■■■■□ 3.61
ARHGEF3-208ENST00000477440 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa37.61■■■■□ 3.61
ARHGEF3-208ENST00000477440 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP37.61■■■■□ 3.61
ARHGEF3-208ENST00000477440 SLC26A8Q96RN1 970 aa37.61■■■■□ 3.61
ARHGEF3-208ENST00000477440 HRCP23327 699 aa37.6■■■■□ 3.61
ARHGEF3-208ENST00000477440 CCDC144AA2RUR9 1427 aa37.59■■■■□ 3.61
ARHGEF3-208ENST00000477440 BCANQ96GW7 911 aa37.58■■■■□ 3.61
ARHGEF3-208ENST00000477440 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa37.52■■■■□ 3.6
ARHGEF3-208ENST00000477440 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa37.52■■■■□ 3.6
ARHGEF3-208ENST00000477440 PPLO60437 1756 aa37.51■■■■□ 3.6
ARHGEF3-208ENST00000477440 DIP2AQ14689 1571 aa37.51■■■■□ 3.59
ARHGEF3-208ENST00000477440 LRRC7Q96NW7 1537 aa37.5■■■■□ 3.59
ARHGEF3-208ENST00000477440 NWD1Q149M9 1564 aa37.5■■■■□ 3.59
ARHGEF3-208ENST00000477440 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP37.48■■■■□ 3.59
ARHGEF3-208ENST00000477440 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa37.48■■■■□ 3.59
ARHGEF3-208ENST00000477440 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP37.46■■■■□ 3.59
ARHGEF3-208ENST00000477440 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa37.45■■■■□ 3.59
ARHGEF3-208ENST00000477440 IFT172Q9UG01 1749 aa37.43■■■■□ 3.58
ARHGEF3-208ENST00000477440 TBX22Q9Y458 520 aa37.42■■■■□ 3.58
ARHGEF3-208ENST00000477440 KCNA6P17658 529 aa37.41■■■■□ 3.58
ARHGEF3-208ENST00000477440 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa37.4■■■■□ 3.58
ARHGEF3-208ENST00000477440 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa37.38■■■■□ 3.58
ARHGEF3-208ENST00000477440 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP37.38■■■■□ 3.57
ARHGEF3-208ENST00000477440 RGL3Q3MIN7 710 aa37.36■■■■□ 3.57
ARHGEF3-208ENST00000477440 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP37.33■■■■□ 3.57
ARHGEF3-208ENST00000477440 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP37.33■■■■□ 3.57
ARHGEF3-208ENST00000477440 PIK3R4Q99570 1358 aa37.32■■■■□ 3.57
ARHGEF3-208ENST00000477440 UBAP1LF5GYI3 381 aa37.32■■■■□ 3.56
ARHGEF3-208ENST00000477440 VGFO15240 615 aaPredicted RBP37.32■■■■□ 3.56
ARHGEF3-208ENST00000477440 ALKQ9UM73 1620 aa37.29■■■■□ 3.56
ARHGEF3-208ENST00000477440 PTPRUQ92729 1446 aa37.29■■■■□ 3.56
ARHGEF3-208ENST00000477440 TMEM94Q12767 1356 aa37.29■■■■□ 3.56
ARHGEF3-208ENST00000477440 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP37.27■■■■□ 3.56
ARHGEF3-208ENST00000477440 METP08581 1390 aa37.26■■■■□ 3.55
ARHGEF3-208ENST00000477440 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP37.25■■■■□ 3.55
ARHGEF3-208ENST00000477440 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP37.25■■■■□ 3.55
ARHGEF3-208ENST00000477440 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa37.22■■■■□ 3.55
ARHGEF3-208ENST00000477440 TOM1O60784 492 aa37.19■■■■□ 3.54
ARHGEF3-208ENST00000477440 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa37.19■■■■□ 3.54
ARHGEF3-208ENST00000477440 MYOM2P54296 1465 aa37.15■■■■□ 3.54
ARHGEF3-208ENST00000477440 PIK3C2GO75747 1445 aa37.14■■■■□ 3.54
ARHGEF3-208ENST00000477440 PIP4K2BP78356 416 aa37.12■■■■□ 3.53
ARHGEF3-208ENST00000477440 NRXN1Q9ULB1 1477 aa37.11■■■■□ 3.53
ARHGEF3-208ENST00000477440 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP37.1■■■■□ 3.53
ARHGEF3-208ENST00000477440 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa37.07■■■■□ 3.53
ARHGEF3-208ENST00000477440 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa37.07■■■■□ 3.52
ARHGEF3-208ENST00000477440 MSH6P52701 1360 aa37.06■■■■□ 3.52
ARHGEF3-208ENST00000477440 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP37.05■■■■□ 3.52
ARHGEF3-208ENST00000477440 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP37.04■■■■□ 3.52
ARHGEF3-208ENST00000477440 LAMC1P11047 1609 aa37.03■■■■□ 3.52
ARHGEF3-208ENST00000477440 PTCH1Q13635 1447 aa37.01■■■■□ 3.51
ARHGEF3-208ENST00000477440 PRAG1Q86YV5 1406 aa37.01■■■■□ 3.51
ARHGEF3-208ENST00000477440 C14orf37Q86TY3 774 aa37■■■■□ 3.51
ARHGEF3-208ENST00000477440 NALCNQ8IZF0 1738 aa36.99■■■■□ 3.51
ARHGEF3-208ENST00000477440 DCAF11Q8TEB1 546 aa36.98■■■■□ 3.51
ARHGEF3-208ENST00000477440 ROBO2Q9HCK4 1378 aa36.96■■■■□ 3.51
ARHGEF3-208ENST00000477440 KNDC1Q76NI1 1749 aa36.96■■■■□ 3.51
ARHGEF3-208ENST00000477440 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa36.95■■■■□ 3.51
ARHGEF3-208ENST00000477440 TMEM132EQ6IEE7 984 aa36.93■■■■□ 3.5
ARHGEF3-208ENST00000477440 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP36.93■■■■□ 3.5
ARHGEF3-208ENST00000477440 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa36.93■■■■□ 3.5
ARHGEF3-208ENST00000477440 CFAP70Q5T0N1 1121 aa36.92■■■■□ 3.5
ARHGEF3-208ENST00000477440 C19orf44Q9H6X5 657 aa36.92■■■■□ 3.5
ARHGEF3-208ENST00000477440 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa36.9■■■■□ 3.5
ARHGEF3-208ENST00000477440 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP36.9■■■■□ 3.5
ARHGEF3-208ENST00000477440 TECPR2O15040 1411 aa36.89■■■■□ 3.5
ARHGEF3-208ENST00000477440 HSPA1LP34931 641 aa36.89■■■■□ 3.5
ARHGEF3-208ENST00000477440 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP36.88■■■■□ 3.49
ARHGEF3-208ENST00000477440 SIN3AQ96ST3 1273 aa36.88■■■■□ 3.49
ARHGEF3-208ENST00000477440 DCCP43146 1447 aa36.87■■■■□ 3.49
ARHGEF3-208ENST00000477440 STK26Q9P289 416 aa36.87■■■■□ 3.49
ARHGEF3-208ENST00000477440 FAM135BQ49AJ0 1406 aa36.86■■■■□ 3.49
ARHGEF3-208ENST00000477440 STAC3Q96MF2 364 aa36.85■■■■□ 3.49
ARHGEF3-208ENST00000477440 ADGRB1O14514 1584 aa36.84■■■■□ 3.49
ARHGEF3-208ENST00000477440 SLAIN2Q9P270 581 aa36.84■■■■□ 3.49
ARHGEF3-208ENST00000477440 ABCC11Q96J66 1382 aa36.83■■■■□ 3.49
ARHGEF3-208ENST00000477440 ATF3P18847 181 aa36.83■■■■□ 3.49
ARHGEF3-208ENST00000477440 CADPS2Q86UW7 1296 aa36.83■■■■□ 3.49
ARHGEF3-208ENST00000477440 NEUROD1Q13562 356 aa36.77■■■■□ 3.48
ARHGEF3-208ENST00000477440 PCGF6Q9BYE7 350 aa36.77■■■■□ 3.48
ARHGEF3-208ENST00000477440 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa36.76■■■■□ 3.47
ARHGEF3-208ENST00000477440 MST1RQ04912 1400 aa36.76■■■■□ 3.47
ARHGEF3-208ENST00000477440 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa36.75■■■■□ 3.47
ARHGEF3-208ENST00000477440 WAPLQ7Z5K2 1190 aa36.74■■■■□ 3.47
ARHGEF3-208ENST00000477440 L3MBTL2Q969R5 705 aa36.72■■■■□ 3.47
ARHGEF3-208ENST00000477440 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa36.71■■■■□ 3.47
ARHGEF3-208ENST00000477440 DLC1Q96QB1 1528 aa36.7■■■■□ 3.47
ARHGEF3-208ENST00000477440 PHLPP1O60346 1717 aa36.69■■■■□ 3.46
ARHGEF3-208ENST00000477440 SIRT1Q96EB6 747 aa36.66■■■■□ 3.46
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