RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473191.1

USP40-212, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 3

Gene USP40, Length 590 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-212ENST00000473191 HSPA1LP34931 641 aa25.47■■□□□ 1.67
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USP40-212ENST00000473191 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
USP40-212ENST00000473191 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
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USP40-212ENST00000473191 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.42■■□□□ 1.66
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USP40-212ENST00000473191 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.35■■□□□ 1.65
USP40-212ENST00000473191 TMEM94Q12767 1356 aa25.34■■□□□ 1.65
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USP40-212ENST00000473191 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa25.29■■□□□ 1.64
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USP40-212ENST00000473191 HFM1A2PYH4 1435 aa25.26■■□□□ 1.63
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USP40-212ENST00000473191 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.24■■□□□ 1.63
USP40-212ENST00000473191 TBX22Q9Y458 520 aa25.23■■□□□ 1.63
USP40-212ENST00000473191 TRIM52Q96A61 297 aa25.21■■□□□ 1.63
USP40-212ENST00000473191 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa25.2■■□□□ 1.62
USP40-212ENST00000473191 TRPM2O94759 1503 aa25.2■■□□□ 1.62
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USP40-212ENST00000473191 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.15■■□□□ 1.62
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USP40-212ENST00000473191 MSH6P52701 1360 aa25.13■■□□□ 1.61
USP40-212ENST00000473191 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.12■■□□□ 1.61
USP40-212ENST00000473191 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa25.11■■□□□ 1.61
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USP40-212ENST00000473191 METP08581 1390 aa25.1■■□□□ 1.61
USP40-212ENST00000473191 PIK3R4Q99570 1358 aa25.09■■□□□ 1.61
USP40-212ENST00000473191 SOCS7O14512 581 aa25.08■■□□□ 1.61
USP40-212ENST00000473191 SLAIN2Q9P270 581 aa25.08■■□□□ 1.61
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USP40-212ENST00000473191 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.91■■□□□ 1.58
USP40-212ENST00000473191 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.9■■□□□ 1.58
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USP40-212ENST00000473191 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa24.89■■□□□ 1.58
USP40-212ENST00000473191 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.89■■□□□ 1.58
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USP40-212ENST00000473191 DCCP43146 1447 aa24.86■■□□□ 1.57
USP40-212ENST00000473191 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa24.86■■□□□ 1.57
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USP40-212ENST00000473191 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa24.84■■□□□ 1.57
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USP40-212ENST00000473191 C1orf167Q5SNV9 1468 aa24.75■■□□□ 1.55
USP40-212ENST00000473191 STK26Q9P289 416 aa24.74■■□□□ 1.55
USP40-212ENST00000473191 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.74■■□□□ 1.55
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USP40-212ENST00000473191 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.71■■□□□ 1.55
USP40-212ENST00000473191 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa24.7■■□□□ 1.54
USP40-212ENST00000473191 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
USP40-212ENST00000473191 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
USP40-212ENST00000473191 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
USP40-212ENST00000473191 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
USP40-212ENST00000473191 NRXN1Q9ULB1 1477 aa24.66■■□□□ 1.54
USP40-212ENST00000473191 TECPR2O15040 1411 aa24.66■■□□□ 1.54
USP40-212ENST00000473191 CFAP70Q5T0N1 1121 aa24.65■■□□□ 1.54
USP40-212ENST00000473191 KNDC1Q76NI1 1749 aa24.65■■□□□ 1.54
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