RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470271.5

CTPS1-206, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-206ENST00000470271 CPS1P31327 1500 aa29.63■■■□□ 2.33
CTPS1-206ENST00000470271 MPHOSPH9Q99550 1183 aa29.62■■■□□ 2.33
CTPS1-206ENST00000470271 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.62■■■□□ 2.33
CTPS1-206ENST00000470271 CLTCL1P53675 1640 aa29.61■■■□□ 2.33
CTPS1-206ENST00000470271 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
CTPS1-206ENST00000470271 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP29.61■■■□□ 2.33
CTPS1-206ENST00000470271 BCANQ96GW7 911 aa29.58■■■□□ 2.33
CTPS1-206ENST00000470271 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa29.57■■■□□ 2.32
CTPS1-206ENST00000470271 FOXD1Q16676 465 aa29.57■■■□□ 2.32
CTPS1-206ENST00000470271 SLC26A8Q96RN1 970 aa29.56■■■□□ 2.32
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
CTPS1-206ENST00000470271 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
CTPS1-206ENST00000470271 KIF1BO60333 1816 aa29.54■■■□□ 2.32
CTPS1-206ENST00000470271 STRCP1A6NGW2 1772 aa29.54■■■□□ 2.32
CTPS1-206ENST00000470271 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
CTPS1-206ENST00000470271 HRCP23327 699 aa29.48■■■□□ 2.31
CTPS1-206ENST00000470271 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.45■■■□□ 2.31
CTPS1-206ENST00000470271 LRRC7Q96NW7 1537 aa29.45■■■□□ 2.31
CTPS1-206ENST00000470271 KCNA6P17658 529 aa29.45■■■□□ 2.31
CTPS1-206ENST00000470271 UBAP1LF5GYI3 381 aa29.44■■■□□ 2.3
CTPS1-206ENST00000470271 TBX22Q9Y458 520 aa29.44■■■□□ 2.3
CTPS1-206ENST00000470271 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa29.43■■■□□ 2.3
CTPS1-206ENST00000470271 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa29.42■■■□□ 2.3
CTPS1-206ENST00000470271 DIP2AQ14689 1571 aa29.4■■■□□ 2.3
CTPS1-206ENST00000470271 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa29.38■■■□□ 2.29
CTPS1-206ENST00000470271 NWD1Q149M9 1564 aa29.38■■■□□ 2.29
CTPS1-206ENST00000470271 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa29.36■■■□□ 2.29
CTPS1-206ENST00000470271 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
CTPS1-206ENST00000470271 TOM1O60784 492 aa29.35■■■□□ 2.29
CTPS1-206ENST00000470271 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
CTPS1-206ENST00000470271 VGFO15240 615 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
CTPS1-206ENST00000470271 PIK3R4Q99570 1358 aa29.34■■■□□ 2.29
CTPS1-206ENST00000470271 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa29.34■■■□□ 2.29
CTPS1-206ENST00000470271 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.32■■■□□ 2.28
CTPS1-206ENST00000470271 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM94Q12767 1356 aa29.31■■■□□ 2.28
CTPS1-206ENST00000470271 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
CTPS1-206ENST00000470271 RGL3Q3MIN7 710 aa29.3■■■□□ 2.28
CTPS1-206ENST00000470271 PPLO60437 1756 aa29.3■■■□□ 2.28
CTPS1-206ENST00000470271 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa29.26■■■□□ 2.28
CTPS1-206ENST00000470271 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
CTPS1-206ENST00000470271 PIP4K2BP78356 416 aa29.25■■■□□ 2.27
CTPS1-206ENST00000470271 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
CTPS1-206ENST00000470271 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa29.24■■■□□ 2.27
CTPS1-206ENST00000470271 METP08581 1390 aa29.24■■■□□ 2.27
CTPS1-206ENST00000470271 ALKQ9UM73 1620 aa29.23■■■□□ 2.27
CTPS1-206ENST00000470271 PTPRUQ92729 1446 aa29.23■■■□□ 2.27
CTPS1-206ENST00000470271 IFT172Q9UG01 1749 aa29.2■■■□□ 2.26
CTPS1-206ENST00000470271 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa29.19■■■□□ 2.26
CTPS1-206ENST00000470271 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa29.17■■■□□ 2.26
CTPS1-206ENST00000470271 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
CTPS1-206ENST00000470271 MSH6P52701 1360 aa29.16■■■□□ 2.26
CTPS1-206ENST00000470271 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
CTPS1-206ENST00000470271 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
CTPS1-206ENST00000470271 C14orf37Q86TY3 774 aa29.13■■■□□ 2.25
CTPS1-206ENST00000470271 PIK3C2GO75747 1445 aa29.09■■■□□ 2.25
CTPS1-206ENST00000470271 HSPA1LP34931 641 aa29.07■■■□□ 2.24
CTPS1-206ENST00000470271 MYOM2P54296 1465 aa29.07■■■□□ 2.24
CTPS1-206ENST00000470271 C19orf44Q9H6X5 657 aa29.07■■■□□ 2.24
CTPS1-206ENST00000470271 NRXN1Q9ULB1 1477 aa29.04■■■□□ 2.24
CTPS1-206ENST00000470271 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
CTPS1-206ENST00000470271 PTCH1Q13635 1447 aa29.03■■■□□ 2.24
CTPS1-206ENST00000470271 FAM135BQ49AJ0 1406 aa29.03■■■□□ 2.24
CTPS1-206ENST00000470271 ATF3P18847 181 aa29.02■■■□□ 2.24
CTPS1-206ENST00000470271 CADPS2Q86UW7 1296 aa29.02■■■□□ 2.24
CTPS1-206ENST00000470271 SLAIN2Q9P270 581 aa29.02■■■□□ 2.24
CTPS1-206ENST00000470271 PRAG1Q86YV5 1406 aa29.02■■■□□ 2.24
CTPS1-206ENST00000470271 ROBO2Q9HCK4 1378 aa29■■■□□ 2.23
CTPS1-206ENST00000470271 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.99■■■□□ 2.23
CTPS1-206ENST00000470271 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
CTPS1-206ENST00000470271 DCCP43146 1447 aa28.97■■■□□ 2.23
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM132EQ6IEE7 984 aa28.97■■■□□ 2.23
CTPS1-206ENST00000470271 STAC3Q96MF2 364 aa28.97■■■□□ 2.23
CTPS1-206ENST00000470271 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.97■■■□□ 2.23
CTPS1-206ENST00000470271 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa28.96■■■□□ 2.23
CTPS1-206ENST00000470271 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa28.96■■■□□ 2.23
CTPS1-206ENST00000470271 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa28.96■■■□□ 2.23
CTPS1-206ENST00000470271 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
CTPS1-206ENST00000470271 LAMC1P11047 1609 aa28.95■■■□□ 2.23
CTPS1-206ENST00000470271 CFAP70Q5T0N1 1121 aa28.95■■■□□ 2.22
CTPS1-206ENST00000470271 STK26Q9P289 416 aa28.95■■■□□ 2.22
CTPS1-206ENST00000470271 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
CTPS1-206ENST00000470271 NALCNQ8IZF0 1738 aa28.92■■■□□ 2.22
CTPS1-206ENST00000470271 ABCC11Q96J66 1382 aa28.92■■■□□ 2.22
CTPS1-206ENST00000470271 TECPR2O15040 1411 aa28.92■■■□□ 2.22
CTPS1-206ENST00000470271 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
CTPS1-206ENST00000470271 KNDC1Q76NI1 1749 aa28.89■■■□□ 2.21
CTPS1-206ENST00000470271 MST1RQ04912 1400 aa28.86■■■□□ 2.21
CTPS1-206ENST00000470271 WAPLQ7Z5K2 1190 aa28.84■■■□□ 2.21
CTPS1-206ENST00000470271 SIN3AQ96ST3 1273 aa28.84■■■□□ 2.21
CTPS1-206ENST00000470271 SIRT1Q96EB6 747 aa28.82■■■□□ 2.2
CTPS1-206ENST00000470271 ADGRB1O14514 1584 aa28.81■■■□□ 2.2
CTPS1-206ENST00000470271 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa28.8■■■□□ 2.2
CTPS1-206ENST00000470271 BRINP3Q76B58 766 aa28.8■■■□□ 2.2
CTPS1-206ENST00000470271 PHLPP1O60346 1717 aa28.78■■■□□ 2.2
CTPS1-206ENST00000470271 NEUROD1Q13562 356 aa28.78■■■□□ 2.2
CTPS1-206ENST00000470271 C1orf167Q5SNV9 1468 aa28.76■■■□□ 2.19
CTPS1-206ENST00000470271 DISP3Q9P2K9 1392 aa28.75■■■□□ 2.19
CTPS1-206ENST00000470271 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa28.75■■■□□ 2.19
CTPS1-206ENST00000470271 DLC1Q96QB1 1528 aa28.75■■■□□ 2.19
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