RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468532.5

CHKB-205, Transcript of choline kinase beta, humanhuman

TSL 5

Gene CHKB, Length 1,052 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKB-205ENST00000468532 TRPM2O94759 1503 aa46.59■■■■■ 5.05
CHKB-205ENST00000468532 BCANQ96GW7 911 aa46.59■■■■■ 5.05
CHKB-205ENST00000468532 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP46.59■■■■■ 5.05
CHKB-205ENST00000468532 SLC26A8Q96RN1 970 aa46.58■■■■■ 5.05
CHKB-205ENST00000468532 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa46.57■■■■■ 5.05
CHKB-205ENST00000468532 LRRC7Q96NW7 1537 aa46.56■■■■■ 5.04
CHKB-205ENST00000468532 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP46.56■■■■■ 5.04
CHKB-205ENST00000468532 CLTCL1P53675 1640 aa46.56■■■■■ 5.04
CHKB-205ENST00000468532 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP46.55■■■■■ 5.04
CHKB-205ENST00000468532 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP46.51■■■■■ 5.04
CHKB-205ENST00000468532 SETD5Q9C0A6 1442 aa46.45■■■■■ 5.03
CHKB-205ENST00000468532 KIF1BO60333 1816 aa46.44■■■■■ 5.03
CHKB-205ENST00000468532 KCNA6P17658 529 aa46.42■■■■■ 5.02
CHKB-205ENST00000468532 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP46.42■■■■■ 5.02
CHKB-205ENST00000468532 TOM1O60784 492 aa46.41■■■■■ 5.02
CHKB-205ENST00000468532 NWD1Q149M9 1564 aa46.38■■■■■ 5.01
CHKB-205ENST00000468532 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP46.38■■■■■ 5.01
CHKB-205ENST00000468532 FOXD1Q16676 465 aa46.37■■■■■ 5.01
CHKB-205ENST00000468532 MPHOSPH9Q99550 1183 aa46.35■■■■■ 5.01
CHKB-205ENST00000468532 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa46.34■■■■■ 5.01
CHKB-205ENST00000468532 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP46.33■■■■■ 5.01
CHKB-205ENST00000468532 TBX22Q9Y458 520 aa46.33■■■■■ 5.01
CHKB-205ENST00000468532 DIP2AQ14689 1571 aa46.33■■■■■ 5.01
CHKB-205ENST00000468532 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP46.32■■■■■ 5.01
CHKB-205ENST00000468532 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP46.31■■■■■ 5
CHKB-205ENST00000468532 PIP4K2BP78356 416 aa46.31■■■■■ 5
CHKB-205ENST00000468532 ALKQ9UM73 1620 aa46.31■■■■■ 5
CHKB-205ENST00000468532 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP46.31■■■■■ 5
CHKB-205ENST00000468532 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa46.29■■■■■ 5
CHKB-205ENST00000468532 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa46.29■■■■■ 5
CHKB-205ENST00000468532 TMEM94Q12767 1356 aa46.27■■■■■ 5
CHKB-205ENST00000468532 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP46.26■■■■■ 5
CHKB-205ENST00000468532 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa46.23■■■■■ 4.99
CHKB-205ENST00000468532 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa46.22■■■■■ 4.99
CHKB-205ENST00000468532 CCDC144AA2RUR9 1427 aa46.19■■■■■ 4.98
CHKB-205ENST00000468532 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP46.18■■■■■ 4.98
CHKB-205ENST00000468532 PIK3R4Q99570 1358 aa46.18■■■■■ 4.98
CHKB-205ENST00000468532 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa46.08■■■■■ 4.97
CHKB-205ENST00000468532 PPLO60437 1756 aa46.08■■■■■ 4.97
CHKB-205ENST00000468532 PTPRUQ92729 1446 aa46.07■■■■■ 4.97
CHKB-205ENST00000468532 HSPA1LP34931 641 aa46.06■■■■■ 4.96
CHKB-205ENST00000468532 VGFO15240 615 aaPredicted RBP46.05■■■■■ 4.96
CHKB-205ENST00000468532 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa46.03■■■■■ 4.96
CHKB-205ENST00000468532 MSH6P52701 1360 aa46.01■■■■■ 4.96
CHKB-205ENST00000468532 METP08581 1390 aa46■■■■■ 4.95
CHKB-205ENST00000468532 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa46■■■■■ 4.95
CHKB-205ENST00000468532 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP45.99■■■■■ 4.95
CHKB-205ENST00000468532 HRCP23327 699 aa45.96■■■■■ 4.95
CHKB-205ENST00000468532 RGL3Q3MIN7 710 aa45.96■■■■■ 4.95
CHKB-205ENST00000468532 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa45.95■■■■■ 4.95
CHKB-205ENST00000468532 C14orf37Q86TY3 774 aa45.92■■■■■ 4.94
CHKB-205ENST00000468532 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP45.91■■■■■ 4.94
CHKB-205ENST00000468532 IFT172Q9UG01 1749 aa45.91■■■■■ 4.94
CHKB-205ENST00000468532 FAM135BQ49AJ0 1406 aa45.86■■■■■ 4.93
CHKB-205ENST00000468532 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa45.84■■■■■ 4.93
CHKB-205ENST00000468532 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP45.83■■■■■ 4.93
CHKB-205ENST00000468532 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa45.82■■■■■ 4.93
CHKB-205ENST00000468532 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa45.82■■■■■ 4.93
CHKB-205ENST00000468532 C19orf44Q9H6X5 657 aa45.79■■■■■ 4.92
CHKB-205ENST00000468532 DISP3Q9P2K9 1392 aa45.78■■■■■ 4.92
CHKB-205ENST00000468532 SLAIN2Q9P270 581 aa45.77■■■■■ 4.92
CHKB-205ENST00000468532 ATF3P18847 181 aa45.72■■■■■ 4.91
CHKB-205ENST00000468532 CADPS2Q86UW7 1296 aa45.72■■■■■ 4.91
CHKB-205ENST00000468532 PTCH1Q13635 1447 aa45.69■■■■■ 4.9
CHKB-205ENST00000468532 PIK3C2GO75747 1445 aa45.68■■■■■ 4.9
CHKB-205ENST00000468532 DCCP43146 1447 aa45.66■■■■■ 4.9
CHKB-205ENST00000468532 PRAG1Q86YV5 1406 aa45.64■■■■■ 4.9
CHKB-205ENST00000468532 NALCNQ8IZF0 1738 aa45.63■■■■■ 4.9
CHKB-205ENST00000468532 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa45.63■■■■■ 4.9
CHKB-205ENST00000468532 ROBO2Q9HCK4 1378 aa45.63■■■■■ 4.9
CHKB-205ENST00000468532 MYOM2P54296 1465 aa45.62■■■■■ 4.89
CHKB-205ENST00000468532 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP45.6■■■■■ 4.89
CHKB-205ENST00000468532 NRXN1Q9ULB1 1477 aa45.58■■■■■ 4.89
CHKB-205ENST00000468532 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa45.57■■■■■ 4.89
CHKB-205ENST00000468532 PHLPP1O60346 1717 aa45.55■■■■■ 4.88
CHKB-205ENST00000468532 TMEM132EQ6IEE7 984 aa45.51■■■■■ 4.88
CHKB-205ENST00000468532 MST1RQ04912 1400 aa45.51■■■■■ 4.88
CHKB-205ENST00000468532 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP45.5■■■■■ 4.87
CHKB-205ENST00000468532 STK26Q9P289 416 aa45.5■■■■■ 4.87
CHKB-205ENST00000468532 LAMC1P11047 1609 aa45.5■■■■■ 4.87
CHKB-205ENST00000468532 KNDC1Q76NI1 1749 aa45.47■■■■■ 4.87
CHKB-205ENST00000468532 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP45.47■■■■■ 4.87
CHKB-205ENST00000468532 TECPR2O15040 1411 aa45.46■■■■■ 4.87
CHKB-205ENST00000468532 CFAP70Q5T0N1 1121 aa45.44■■■■■ 4.86
CHKB-205ENST00000468532 BRINP3Q76B58 766 aa45.44■■■■■ 4.86
CHKB-205ENST00000468532 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP45.43■■■■■ 4.86
CHKB-205ENST00000468532 DCAF11Q8TEB1 546 aa45.42■■■■■ 4.86
CHKB-205ENST00000468532 ABCC11Q96J66 1382 aa45.42■■■■■ 4.86
CHKB-205ENST00000468532 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP45.41■■■■■ 4.86
CHKB-205ENST00000468532 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP45.41■■■■■ 4.86
CHKB-205ENST00000468532 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa45.41■■■■■ 4.86
CHKB-205ENST00000468532 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP45.35■■■■■ 4.85
CHKB-205ENST00000468532 WAPLQ7Z5K2 1190 aa45.35■■■■■ 4.85
CHKB-205ENST00000468532 ILDR2Q71H61 639 aa45.33■■■■■ 4.85
CHKB-205ENST00000468532 C1orf167Q5SNV9 1468 aa45.32■■■■■ 4.85
CHKB-205ENST00000468532 STAC3Q96MF2 364 aa45.31■■■■■ 4.84
CHKB-205ENST00000468532 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa45.31■■■■■ 4.84
CHKB-205ENST00000468532 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa45.31■■■■■ 4.84
CHKB-205ENST00000468532 JCADQ9P266 1359 aa45.3■■■■■ 4.84
CHKB-205ENST00000468532 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP45.29■■■■■ 4.84
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