RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468083.1

ZYX-208, Transcript of zyxin, human

TSL 5

Gene ZYX, Length 1,146 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZYX-208	ENST00000468083	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	32.17	■■■□□ 2.74
ZYX-208	ENST00000468083	CLTCL1	P53675	1640 aa		32.17	■■■□□ 2.74
ZYX-208	ENST00000468083	IQGAP1	P46940	1657 aa		32.17	■■■□□ 2.74
ZYX-208	ENST00000468083	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	32.16	■■■□□ 2.74
ZYX-208	ENST00000468083	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		32.16	■■■□□ 2.74
ZYX-208	ENST00000468083	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		32.15	■■■□□ 2.74
ZYX-208	ENST00000468083	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		32.13	■■■□□ 2.73
ZYX-208	ENST00000468083	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		32.13	■■■□□ 2.73
ZYX-208	ENST00000468083	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		32.11	■■■□□ 2.73
ZYX-208	ENST00000468083	BCAN	Q96GW7	911 aa		32.09	■■■□□ 2.73
ZYX-208	ENST00000468083	TBX22	Q9Y458	520 aa		32.08	■■■□□ 2.73
ZYX-208	ENST00000468083	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		32.07	■■■□□ 2.72
ZYX-208	ENST00000468083	KIF1B	O60333	1816 aa		32.06	■■■□□ 2.72
ZYX-208	ENST00000468083	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	32.06	■■■□□ 2.72
ZYX-208	ENST00000468083	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		32.06	■■■□□ 2.72
ZYX-208	ENST00000468083	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	32.05	■■■□□ 2.72
ZYX-208	ENST00000468083	CPS1	P31327	1500 aa		32.02	■■■□□ 2.72
ZYX-208	ENST00000468083	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		32.02	■■■□□ 2.72
ZYX-208	ENST00000468083	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		32.01	■■■□□ 2.72
ZYX-208	ENST00000468083	KCNA6	P17658	529 aa		32	■■■□□ 2.71
ZYX-208	ENST00000468083	FBXO41	Q8TF61	875 aa		31.99	■■■□□ 2.71
ZYX-208	ENST00000468083	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		31.98	■■■□□ 2.71
ZYX-208	ENST00000468083	RGL3	Q3MIN7	710 aa		31.97	■■■□□ 2.71
ZYX-208	ENST00000468083	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		31.96	■■■□□ 2.71
ZYX-208	ENST00000468083	PIK3R4	Q99570	1358 aa		31.94	■■■□□ 2.7
ZYX-208	ENST00000468083	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	31.91	■■■□□ 2.7
ZYX-208	ENST00000468083	DIP2A	Q14689	1571 aa		31.9	■■■□□ 2.7
ZYX-208	ENST00000468083	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		31.9	■■■□□ 2.7
ZYX-208	ENST00000468083	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		31.85	■■■□□ 2.69
ZYX-208	ENST00000468083	STAC3	Q96MF2	364 aa		31.85	■■■□□ 2.69
ZYX-208	ENST00000468083	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	31.84	■■■□□ 2.69
ZYX-208	ENST00000468083	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		31.83	■■■□□ 2.69
ZYX-208	ENST00000468083	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		31.82	■■■□□ 2.68
ZYX-208	ENST00000468083	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	31.82	■■■□□ 2.68
ZYX-208	ENST00000468083	PPL	O60437	1756 aa		31.81	■■■□□ 2.68
ZYX-208	ENST00000468083	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	31.8	■■■□□ 2.68
ZYX-208	ENST00000468083	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		31.8	■■■□□ 2.68
ZYX-208	ENST00000468083	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		31.8	■■■□□ 2.68
ZYX-208	ENST00000468083	NWD1	Q149M9	1564 aa		31.8	■■■□□ 2.68
ZYX-208	ENST00000468083	MET	P08581	1390 aa		31.77	■■■□□ 2.68
ZYX-208	ENST00000468083	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	31.77	■■■□□ 2.68
ZYX-208	ENST00000468083	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	31.77	■■■□□ 2.68
ZYX-208	ENST00000468083	TOM1	O60784	492 aa		31.76	■■■□□ 2.67
ZYX-208	ENST00000468083	TMEM94	Q12767	1356 aa		31.75	■■■□□ 2.67
ZYX-208	ENST00000468083	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		31.74	■■■□□ 2.67
ZYX-208	ENST00000468083	PTPRU	Q92729	1446 aa		31.74	■■■□□ 2.67
ZYX-208	ENST00000468083	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		31.74	■■■□□ 2.67
ZYX-208	ENST00000468083	MYOM2	P54296	1465 aa		31.72	■■■□□ 2.67
ZYX-208	ENST00000468083	ALK	Q9UM73	1620 aa		31.71	■■■□□ 2.67
ZYX-208	ENST00000468083	IFT172	Q9UG01	1749 aa		31.71	■■■□□ 2.67
ZYX-208	ENST00000468083	PIK3C2G	O75747	1445 aa		31.7	■■■□□ 2.67
ZYX-208	ENST00000468083	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		31.7	■■■□□ 2.67
ZYX-208	ENST00000468083	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	31.7	■■■□□ 2.67
ZYX-208	ENST00000468083	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		31.7	■■■□□ 2.66
ZYX-208	ENST00000468083	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		31.69	■■■□□ 2.66
ZYX-208	ENST00000468083	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		31.64	■■■□□ 2.66
ZYX-208	ENST00000468083	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	31.63	■■■□□ 2.65
ZYX-208	ENST00000468083	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		31.62	■■■□□ 2.65
ZYX-208	ENST00000468083	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		31.61	■■■□□ 2.65
ZYX-208	ENST00000468083	MSH6	P52701	1360 aa		31.6	■■■□□ 2.65
ZYX-208	ENST00000468083	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		31.6	■■■□□ 2.65
ZYX-208	ENST00000468083	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		31.6	■■■□□ 2.65
ZYX-208	ENST00000468083	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	31.6	■■■□□ 2.65
ZYX-208	ENST00000468083	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	31.59	■■■□□ 2.65
ZYX-208	ENST00000468083	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	31.57	■■■□□ 2.64
ZYX-208	ENST00000468083	ABCC11	Q96J66	1382 aa		31.56	■■■□□ 2.64
ZYX-208	ENST00000468083	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		31.56	■■■□□ 2.64
ZYX-208	ENST00000468083	PTCH1	Q13635	1447 aa		31.56	■■■□□ 2.64
ZYX-208	ENST00000468083	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	31.56	■■■□□ 2.64
ZYX-208	ENST00000468083	NEUROD1	Q13562	356 aa		31.55	■■■□□ 2.64
ZYX-208	ENST00000468083	C14orf37	Q86TY3	774 aa		31.55	■■■□□ 2.64
ZYX-208	ENST00000468083	SIRT1	Q96EB6	747 aa		31.55	■■■□□ 2.64
ZYX-208	ENST00000468083	PIP4K2B	P78356	416 aa		31.52	■■■□□ 2.64
ZYX-208	ENST00000468083	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		31.52	■■■□□ 2.64
ZYX-208	ENST00000468083	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		31.52	■■■□□ 2.64
ZYX-208	ENST00000468083	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		31.51	■■■□□ 2.63
ZYX-208	ENST00000468083	TECPR2	O15040	1411 aa		31.5	■■■□□ 2.63
ZYX-208	ENST00000468083	STK26	Q9P289	416 aa		31.49	■■■□□ 2.63
ZYX-208	ENST00000468083	LAMC1	P11047	1609 aa		31.49	■■■□□ 2.63
ZYX-208	ENST00000468083	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	31.49	■■■□□ 2.63
ZYX-208	ENST00000468083	ATF3	P18847	181 aa		31.48	■■■□□ 2.63
ZYX-208	ENST00000468083	SLAIN2	Q9P270	581 aa		31.47	■■■□□ 2.63
ZYX-208	ENST00000468083	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	31.47	■■■□□ 2.63
ZYX-208	ENST00000468083	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		31.45	■■■□□ 2.63
ZYX-208	ENST00000468083	DCC	P43146	1447 aa		31.45	■■■□□ 2.63
ZYX-208	ENST00000468083	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		31.45	■■■□□ 2.63
ZYX-208	ENST00000468083	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		31.42	■■■□□ 2.62
ZYX-208	ENST00000468083	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		31.42	■■■□□ 2.62
ZYX-208	ENST00000468083	ADGRB1	O14514	1584 aa		31.39	■■■□□ 2.62
ZYX-208	ENST00000468083	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		31.39	■■■□□ 2.62
ZYX-208	ENST00000468083	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	31.37	■■■□□ 2.61
ZYX-208	ENST00000468083	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		31.35	■■■□□ 2.61
ZYX-208	ENST00000468083	TONSL	Q96HA7	1378 aa		31.34	■■■□□ 2.61
ZYX-208	ENST00000468083	DLC1	Q96QB1	1528 aa		31.34	■■■□□ 2.61
ZYX-208	ENST00000468083	HSPA1L	P34931	641 aa		31.33	■■■□□ 2.61
ZYX-208	ENST00000468083	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		31.32	■■■□□ 2.6
ZYX-208	ENST00000468083	PRAM1	Q96QH2	718 aa		31.31	■■■□□ 2.6
ZYX-208	ENST00000468083	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		31.3	■■■□□ 2.6
ZYX-208	ENST00000468083	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		31.3	■■■□□ 2.6
ZYX-208	ENST00000468083	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		31.3	■■■□□ 2.6

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73 ms