RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467594.1

NISCH-205, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 1,014 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-205ENST00000467594 SLC26A8Q96RN1 970 aa23.31■■□□□ 1.32
NISCH-205ENST00000467594 HFM1A2PYH4 1435 aa23.31■■□□□ 1.32
NISCH-205ENST00000467594 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
NISCH-205ENST00000467594 PIP4K2BP78356 416 aa23.3■■□□□ 1.32
NISCH-205ENST00000467594 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa23.29■■□□□ 1.32
NISCH-205ENST00000467594 MYO5BQ9ULV0 1848 aa23.29■■□□□ 1.32
NISCH-205ENST00000467594 KCNA6P17658 529 aa23.29■■□□□ 1.32
NISCH-205ENST00000467594 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.25■■□□□ 1.31
NISCH-205ENST00000467594 TRIM52Q96A61 297 aa23.24■■□□□ 1.31
NISCH-205ENST00000467594 ALKQ9UM73 1620 aa23.22■■□□□ 1.31
NISCH-205ENST00000467594 TBX22Q9Y458 520 aa23.22■■□□□ 1.31
NISCH-205ENST00000467594 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
NISCH-205ENST00000467594 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
NISCH-205ENST00000467594 NWD1Q149M9 1564 aa23.2■■□□□ 1.3
NISCH-205ENST00000467594 HSPA1LP34931 641 aa23.2■■□□□ 1.3
NISCH-205ENST00000467594 TMEM94Q12767 1356 aa23.19■■□□□ 1.3
NISCH-205ENST00000467594 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.19■■□□□ 1.3
NISCH-205ENST00000467594 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
NISCH-205ENST00000467594 TRPM2O94759 1503 aa23.18■■□□□ 1.3
NISCH-205ENST00000467594 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
NISCH-205ENST00000467594 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
NISCH-205ENST00000467594 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
NISCH-205ENST00000467594 DIP2AQ14689 1571 aa23.17■■□□□ 1.3
NISCH-205ENST00000467594 PIK3R4Q99570 1358 aa23.15■■□□□ 1.3
NISCH-205ENST00000467594 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
NISCH-205ENST00000467594 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa23.15■■□□□ 1.3
NISCH-205ENST00000467594 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
NISCH-205ENST00000467594 CLTCL1P53675 1640 aa23.13■■□□□ 1.29
NISCH-205ENST00000467594 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
NISCH-205ENST00000467594 MSH6P52701 1360 aa23.1■■□□□ 1.29
NISCH-205ENST00000467594 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.09■■□□□ 1.29
NISCH-205ENST00000467594 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
NISCH-205ENST00000467594 KIF1BO60333 1816 aa23.08■■□□□ 1.29
NISCH-205ENST00000467594 FAM135BQ49AJ0 1406 aa23.08■■□□□ 1.28
NISCH-205ENST00000467594 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa23.07■■□□□ 1.28
NISCH-205ENST00000467594 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa23.05■■□□□ 1.28
NISCH-205ENST00000467594 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.03■■□□□ 1.28
NISCH-205ENST00000467594 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa23.03■■□□□ 1.28
NISCH-205ENST00000467594 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa23.03■■□□□ 1.28
NISCH-205ENST00000467594 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa23.02■■□□□ 1.28
NISCH-205ENST00000467594 VGFO15240 615 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
NISCH-205ENST00000467594 C14orf37Q86TY3 774 aa23.01■■□□□ 1.27
NISCH-205ENST00000467594 SETD5Q9C0A6 1442 aa23■■□□□ 1.27
NISCH-205ENST00000467594 SLAIN2Q9P270 581 aa23■■□□□ 1.27
NISCH-205ENST00000467594 PTPRUQ92729 1446 aa22.99■■□□□ 1.27
NISCH-205ENST00000467594 C19orf44Q9H6X5 657 aa22.99■■□□□ 1.27
NISCH-205ENST00000467594 FOXD1Q16676 465 aa22.98■■□□□ 1.27
NISCH-205ENST00000467594 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
NISCH-205ENST00000467594 ILDR2Q71H61 639 aa22.97■■□□□ 1.27
NISCH-205ENST00000467594 CADPS2Q86UW7 1296 aa22.97■■□□□ 1.27
NISCH-205ENST00000467594 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.97■■□□□ 1.27
NISCH-205ENST00000467594 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa22.97■■□□□ 1.27
NISCH-205ENST00000467594 METP08581 1390 aa22.96■■□□□ 1.27
NISCH-205ENST00000467594 ATF3P18847 181 aa22.95■■□□□ 1.26
NISCH-205ENST00000467594 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
NISCH-205ENST00000467594 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
NISCH-205ENST00000467594 PPLO60437 1756 aa22.9■■□□□ 1.26
NISCH-205ENST00000467594 DCCP43146 1447 aa22.9■■□□□ 1.26
NISCH-205ENST00000467594 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.89■■□□□ 1.26
NISCH-205ENST00000467594 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
NISCH-205ENST00000467594 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.87■■□□□ 1.25
NISCH-205ENST00000467594 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.87■■□□□ 1.25
NISCH-205ENST00000467594 RGL3Q3MIN7 710 aa22.86■■□□□ 1.25
NISCH-205ENST00000467594 SOCS7O14512 581 aa22.84■■□□□ 1.25
NISCH-205ENST00000467594 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
NISCH-205ENST00000467594 PHLPP1O60346 1717 aa22.83■■□□□ 1.25
NISCH-205ENST00000467594 PTCH1Q13635 1447 aa22.82■■□□□ 1.24
NISCH-205ENST00000467594 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.82■■□□□ 1.24
NISCH-205ENST00000467594 HRCP23327 699 aa22.82■■□□□ 1.24
NISCH-205ENST00000467594 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.82■■□□□ 1.24
NISCH-205ENST00000467594 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.81■■□□□ 1.24
NISCH-205ENST00000467594 JCADQ9P266 1359 aa22.79■■□□□ 1.24
NISCH-205ENST00000467594 BRINP3Q76B58 766 aa22.78■■□□□ 1.24
NISCH-205ENST00000467594 IFT172Q9UG01 1749 aa22.78■■□□□ 1.24
NISCH-205ENST00000467594 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
NISCH-205ENST00000467594 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.77■■□□□ 1.24
NISCH-205ENST00000467594 MST1RQ04912 1400 aa22.77■■□□□ 1.24
NISCH-205ENST00000467594 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
NISCH-205ENST00000467594 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.75■■□□□ 1.23
NISCH-205ENST00000467594 PIK3C2GO75747 1445 aa22.74■■□□□ 1.23
NISCH-205ENST00000467594 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.73■■□□□ 1.23
NISCH-205ENST00000467594 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa22.71■■□□□ 1.23
NISCH-205ENST00000467594 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
NISCH-205ENST00000467594 MYOM2P54296 1465 aa22.7■■□□□ 1.22
NISCH-205ENST00000467594 TECPR2O15040 1411 aa22.69■■□□□ 1.22
NISCH-205ENST00000467594 ABCC11Q96J66 1382 aa22.69■■□□□ 1.22
NISCH-205ENST00000467594 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
NISCH-205ENST00000467594 STK26Q9P289 416 aa22.68■■□□□ 1.22
NISCH-205ENST00000467594 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
NISCH-205ENST00000467594 C1orf167Q5SNV9 1468 aa22.67■■□□□ 1.22
NISCH-205ENST00000467594 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.67■■□□□ 1.22
NISCH-205ENST00000467594 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.66■■□□□ 1.22
NISCH-205ENST00000467594 SHPRHQ149N8 1683 aa22.65■■□□□ 1.22
NISCH-205ENST00000467594 NHSL1Q5SYE7 1610 aa22.65■■□□□ 1.22
NISCH-205ENST00000467594 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
NISCH-205ENST00000467594 LAMC1P11047 1609 aa22.64■■□□□ 1.22
NISCH-205ENST00000467594 SIRT1Q96EB6 747 aa22.64■■□□□ 1.21
NISCH-205ENST00000467594 STAC3Q96MF2 364 aa22.64■■□□□ 1.21
NISCH-205ENST00000467594 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.64■■□□□ 1.21
NISCH-205ENST00000467594 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
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