RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
SH3BP1-205ENST00000466097 ILDR2Q71H61 639 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP1-205ENST00000466097 CPS1P31327 1500 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP1-205ENST00000466097 CLTCL1P53675 1640 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP1-205ENST00000466097 RIMS2Q9UQ26 1411 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BP1-205ENST00000466097 ZFYVE9O95405 1425 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BP1-205ENST00000466097 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
SH3BP1-205ENST00000466097 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP21.95■■□□□ 1.1
SH3BP1-205ENST00000466097 STRCP1A6NGW2 1772 aa21.94■■□□□ 1.1
SH3BP1-205ENST00000466097 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.93■■□□□ 1.1
SH3BP1-205ENST00000466097 BCANQ96GW7 911 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP1-205ENST00000466097 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP1-205ENST00000466097 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
SH3BP1-205ENST00000466097 FOXD1Q16676 465 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC26A8Q96RN1 970 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP1-205ENST00000466097 DIP2AQ14689 1571 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP1-205ENST00000466097 CCDC144AA2RUR9 1427 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP1-205ENST00000466097 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SH3BP1-205ENST00000466097 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SH3BP1-205ENST00000466097 HRCP23327 699 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP1-205ENST00000466097 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP1-205ENST00000466097 LRRC7Q96NW7 1537 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BP1-205ENST00000466097 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
SH3BP1-205ENST00000466097 NWD1Q149M9 1564 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BP1-205ENST00000466097 PPLO60437 1756 aa21.8■■□□□ 1.08
SH3BP1-205ENST00000466097 KCNA6P17658 529 aa21.8■■□□□ 1.08
SH3BP1-205ENST00000466097 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SH3BP1-205ENST00000466097 UBAP1LF5GYI3 381 aa21.79■■□□□ 1.08
SH3BP1-205ENST00000466097 TBX22Q9Y458 520 aa21.79■■□□□ 1.08
SH3BP1-205ENST00000466097 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa21.78■■□□□ 1.08
SH3BP1-205ENST00000466097 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
SH3BP1-205ENST00000466097 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa21.78■■□□□ 1.08
SH3BP1-205ENST00000466097 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa21.77■■□□□ 1.07
SH3BP1-205ENST00000466097 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa21.77■■□□□ 1.07
SH3BP1-205ENST00000466097 TOM1O60784 492 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP1-205ENST00000466097 PIK3R4Q99570 1358 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP1-205ENST00000466097 VGFO15240 615 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
SH3BP1-205ENST00000466097 IFT172Q9UG01 1749 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP1-205ENST00000466097 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
SH3BP1-205ENST00000466097 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM94Q12767 1356 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1-205ENST00000466097 RGL3Q3MIN7 710 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BP1-205ENST00000466097 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
SH3BP1-205ENST00000466097 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
SH3BP1-205ENST00000466097 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
SH3BP1-205ENST00000466097 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP1-205ENST00000466097 PIP4K2BP78356 416 aa21.65■■□□□ 1.06
SH3BP1-205ENST00000466097 ALKQ9UM73 1620 aa21.65■■□□□ 1.06
SH3BP1-205ENST00000466097 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP1-205ENST00000466097 PTPRUQ92729 1446 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP1-205ENST00000466097 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP1-205ENST00000466097 METP08581 1390 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP1-205ENST00000466097 MSH6P52701 1360 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP1-205ENST00000466097 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
SH3BP1-205ENST00000466097 C14orf37Q86TY3 774 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP1-205ENST00000466097 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP1-205ENST00000466097 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
SH3BP1-205ENST00000466097 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
SH3BP1-205ENST00000466097 MYOM2P54296 1465 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP1-205ENST00000466097 PIK3C2GO75747 1445 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP1-205ENST00000466097 LAMC1P11047 1609 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP1-205ENST00000466097 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SH3BP1-205ENST00000466097 C19orf44Q9H6X5 657 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP1-205ENST00000466097 PTCH1Q13635 1447 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP1-205ENST00000466097 NRXN1Q9ULB1 1477 aa21.52■■□□□ 1.03
SH3BP1-205ENST00000466097 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP1-205ENST00000466097 PRAG1Q86YV5 1406 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM135BQ49AJ0 1406 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1-205ENST00000466097 ATF3P18847 181 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1-205ENST00000466097 HSPA1LP34931 641 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1-205ENST00000466097 CADPS2Q86UW7 1296 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1-205ENST00000466097 KNDC1Q76NI1 1749 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP1-205ENST00000466097 NALCNQ8IZF0 1738 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP1-205ENST00000466097 DCCP43146 1447 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP1-205ENST00000466097 STAC3Q96MF2 364 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP1-205ENST00000466097 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1-205ENST00000466097 SLAIN2Q9P270 581 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1-205ENST00000466097 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP1-205ENST00000466097 DCAF11Q8TEB1 546 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP1-205ENST00000466097 ROBO2Q9HCK4 1378 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP1-205ENST00000466097 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SH3BP1-205ENST00000466097 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP1-205ENST00000466097 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SH3BP1-205ENST00000466097 TECPR2O15040 1411 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP1-205ENST00000466097 CFAP70Q5T0N1 1121 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM132EQ6IEE7 984 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP1-205ENST00000466097 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SH3BP1-205ENST00000466097 STK26Q9P289 416 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP1-205ENST00000466097 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
SH3BP1-205ENST00000466097 ABCC11Q96J66 1382 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP1-205ENST00000466097 PHLPP1O60346 1717 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP1-205ENST00000466097 MST1RQ04912 1400 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP1-205ENST00000466097 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
SH3BP1-205ENST00000466097 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP1-205ENST00000466097 ADGRB1O14514 1584 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP1-205ENST00000466097 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP1-205ENST00000466097 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
SH3BP1-205ENST00000466097 SIRT1Q96EB6 747 aa21.33■■□□□ 1.01
SH3BP1-205ENST00000466097 DLC1Q96QB1 1528 aa21.33■■□□□ 1
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