RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462357.1

IMP4-209, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 5

Gene IMP4, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-209ENST00000462357 NEURL4Q96JN8 1562 aa30.24■■■□□ 2.43
IMP4-209ENST00000462357 CCDC144AA2RUR9 1427 aa30.23■■■□□ 2.43
IMP4-209ENST00000462357 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa30.23■■■□□ 2.43
IMP4-209ENST00000462357 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa30.21■■■□□ 2.43
IMP4-209ENST00000462357 IQGAP1P46940 1657 aa30.2■■■□□ 2.42
IMP4-209ENST00000462357 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa30.19■■■□□ 2.42
IMP4-209ENST00000462357 VGFO15240 615 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
IMP4-209ENST00000462357 ZFYVE9O95405 1425 aa30.18■■■□□ 2.42
IMP4-209ENST00000462357 FBXO41Q8TF61 875 aa30.16■■■□□ 2.42
IMP4-209ENST00000462357 SLC26A8Q96RN1 970 aa30.15■■■□□ 2.42
IMP4-209ENST00000462357 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
IMP4-209ENST00000462357 TBX22Q9Y458 520 aa30.14■■■□□ 2.42
IMP4-209ENST00000462357 CPS1P31327 1500 aa30.12■■■□□ 2.41
IMP4-209ENST00000462357 CLTCL1P53675 1640 aa30.11■■■□□ 2.41
IMP4-209ENST00000462357 KCNA6P17658 529 aa30.1■■■□□ 2.41
IMP4-209ENST00000462357 IQSEC2Q5JU85 1478 aa30.1■■■□□ 2.41
IMP4-209ENST00000462357 LTBP4Q8N2S1 1624 aa30.1■■■□□ 2.41
IMP4-209ENST00000462357 KIF1BO60333 1816 aa30.08■■■□□ 2.41
IMP4-209ENST00000462357 RGL3Q3MIN7 710 aa30.07■■■□□ 2.4
IMP4-209ENST00000462357 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
IMP4-209ENST00000462357 MYO5BQ9ULV0 1848 aa30.03■■■□□ 2.4
IMP4-209ENST00000462357 PIK3R4Q99570 1358 aa30.03■■■□□ 2.4
IMP4-209ENST00000462357 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa30.01■■■□□ 2.39
IMP4-209ENST00000462357 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
IMP4-209ENST00000462357 TOM1O60784 492 aa29.99■■■□□ 2.39
IMP4-209ENST00000462357 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
IMP4-209ENST00000462357 STAC3Q96MF2 364 aa29.97■■■□□ 2.39
IMP4-209ENST00000462357 UBAP1LF5GYI3 381 aa29.96■■■□□ 2.39
IMP4-209ENST00000462357 DIP2AQ14689 1571 aa29.95■■■□□ 2.39
IMP4-209ENST00000462357 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa29.94■■■□□ 2.38
IMP4-209ENST00000462357 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.94■■■□□ 2.38
IMP4-209ENST00000462357 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa29.93■■■□□ 2.38
IMP4-209ENST00000462357 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa29.9■■■□□ 2.38
IMP4-209ENST00000462357 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa29.89■■■□□ 2.38
IMP4-209ENST00000462357 LRRC7Q96NW7 1537 aa29.88■■■□□ 2.37
IMP4-209ENST00000462357 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
IMP4-209ENST00000462357 C14orf37Q86TY3 774 aa29.86■■■□□ 2.37
IMP4-209ENST00000462357 TMEM94Q12767 1356 aa29.84■■■□□ 2.37
IMP4-209ENST00000462357 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa29.83■■■□□ 2.37
IMP4-209ENST00000462357 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa29.82■■■□□ 2.36
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IMP4-209ENST00000462357 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
IMP4-209ENST00000462357 METP08581 1390 aa29.79■■■□□ 2.36
IMP4-209ENST00000462357 MSH6P52701 1360 aa29.79■■■□□ 2.36
IMP4-209ENST00000462357 NWD1Q149M9 1564 aa29.78■■■□□ 2.36
IMP4-209ENST00000462357 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa29.77■■■□□ 2.36
IMP4-209ENST00000462357 PPLO60437 1756 aa29.77■■■□□ 2.36
IMP4-209ENST00000462357 PIP4K2BP78356 416 aa29.76■■■□□ 2.35
IMP4-209ENST00000462357 C19orf44Q9H6X5 657 aa29.75■■■□□ 2.35
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IMP4-209ENST00000462357 STRCP1A6NGW2 1772 aa29.75■■■□□ 2.35
IMP4-209ENST00000462357 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
IMP4-209ENST00000462357 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
IMP4-209ENST00000462357 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.73■■■□□ 2.35
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IMP4-209ENST00000462357 ALKQ9UM73 1620 aa29.72■■■□□ 2.35
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IMP4-209ENST00000462357 STK26Q9P289 416 aa29.65■■■□□ 2.34
IMP4-209ENST00000462357 NRXN1Q9ULB1 1477 aa29.63■■■□□ 2.33
IMP4-209ENST00000462357 TMEM132EQ6IEE7 984 aa29.63■■■□□ 2.33
IMP4-209ENST00000462357 SLAIN2Q9P270 581 aa29.63■■■□□ 2.33
IMP4-209ENST00000462357 IFT172Q9UG01 1749 aa29.62■■■□□ 2.33
IMP4-209ENST00000462357 SIN3AQ96ST3 1273 aa29.62■■■□□ 2.33
IMP4-209ENST00000462357 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
IMP4-209ENST00000462357 PTCH1Q13635 1447 aa29.62■■■□□ 2.33
IMP4-209ENST00000462357 SIRT1Q96EB6 747 aa29.61■■■□□ 2.33
IMP4-209ENST00000462357 ABCC11Q96J66 1382 aa29.61■■■□□ 2.33
IMP4-209ENST00000462357 PRAG1Q86YV5 1406 aa29.57■■■□□ 2.32
IMP4-209ENST00000462357 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
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IMP4-209ENST00000462357 FAM135BQ49AJ0 1406 aa29.55■■■□□ 2.32
IMP4-209ENST00000462357 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
IMP4-209ENST00000462357 L3MBTL2Q969R5 705 aa29.55■■■□□ 2.32
IMP4-209ENST00000462357 LAMC1P11047 1609 aa29.55■■■□□ 2.32
IMP4-209ENST00000462357 ROBO2Q9HCK4 1378 aa29.54■■■□□ 2.32
IMP4-209ENST00000462357 POGKQ9P215 609 aa29.52■■■□□ 2.32
IMP4-209ENST00000462357 TECPR2O15040 1411 aa29.52■■■□□ 2.32
IMP4-209ENST00000462357 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa29.51■■■□□ 2.31
IMP4-209ENST00000462357 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
IMP4-209ENST00000462357 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
IMP4-209ENST00000462357 TONSLQ96HA7 1378 aa29.5■■■□□ 2.31
IMP4-209ENST00000462357 HSPA1LP34931 641 aa29.49■■■□□ 2.31
IMP4-209ENST00000462357 CLSPNQ9HAW4 1339 aa29.47■■■□□ 2.31
IMP4-209ENST00000462357 WAPLQ7Z5K2 1190 aa29.47■■■□□ 2.31
IMP4-209ENST00000462357 TRAK1Q9UPV9 953 aa29.46■■■□□ 2.31
IMP4-209ENST00000462357 PRAM1Q96QH2 718 aa29.43■■■□□ 2.3
IMP4-209ENST00000462357 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
IMP4-209ENST00000462357 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
IMP4-209ENST00000462357 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa29.38■■■□□ 2.29
IMP4-209ENST00000462357 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa29.37■■■□□ 2.29
IMP4-209ENST00000462357 DLC1Q96QB1 1528 aa29.36■■■□□ 2.29
IMP4-209ENST00000462357 KNDC1Q76NI1 1749 aa29.35■■■□□ 2.29
IMP4-209ENST00000462357 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP29.35■■■□□ 2.29
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