RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450602.6

CXorf40A-211, Transcript of chromosome X open reading frame 40A, humanhuman

APPRIS P3 TSL 3 BASIC

Gene CXorf40A, Length 1,204 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf40A-211ENST00000450602 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
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CXorf40A-211ENST00000450602 TRPM2O94759 1503 aa22.73■■□□□ 1.23
CXorf40A-211ENST00000450602 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.73■■□□□ 1.23
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CXorf40A-211ENST00000450602 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.72■■□□□ 1.23
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CXorf40A-211ENST00000450602 PIK3R4Q99570 1358 aa22.47■■□□□ 1.19
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CXorf40A-211ENST00000450602 TMEM94Q12767 1356 aa22.45■■□□□ 1.18
CXorf40A-211ENST00000450602 STRCP1A6NGW2 1772 aa22.44■■□□□ 1.18
CXorf40A-211ENST00000450602 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.44■■□□□ 1.18
CXorf40A-211ENST00000450602 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.44■■□□□ 1.18
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CXorf40A-211ENST00000450602 NEUROD1Q13562 356 aa22.41■■□□□ 1.18
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CXorf40A-211ENST00000450602 MSH6P52701 1360 aa22.38■■□□□ 1.17
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CXorf40A-211ENST00000450602 IFT172Q9UG01 1749 aa22.3■■□□□ 1.16
CXorf40A-211ENST00000450602 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.3■■□□□ 1.16
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CXorf40A-211ENST00000450602 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.24■■□□□ 1.15
CXorf40A-211ENST00000450602 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CXorf40A-211ENST00000450602 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CXorf40A-211ENST00000450602 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.24■■□□□ 1.15
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CXorf40A-211ENST00000450602 POGKQ9P215 609 aa22.22■■□□□ 1.15
CXorf40A-211ENST00000450602 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
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CXorf40A-211ENST00000450602 HSPA1LP34931 641 aa22.21■■□□□ 1.15
CXorf40A-211ENST00000450602 ABCC11Q96J66 1382 aa22.21■■□□□ 1.15
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CXorf40A-211ENST00000450602 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.2■■□□□ 1.14
CXorf40A-211ENST00000450602 TONSLQ96HA7 1378 aa22.19■■□□□ 1.14
CXorf40A-211ENST00000450602 LAMC1P11047 1609 aa22.18■■□□□ 1.14
CXorf40A-211ENST00000450602 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
CXorf40A-211ENST00000450602 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.16■■□□□ 1.14
CXorf40A-211ENST00000450602 SIRT1Q96EB6 747 aa22.16■■□□□ 1.14
CXorf40A-211ENST00000450602 PRAM1Q96QH2 718 aa22.16■■□□□ 1.14
CXorf40A-211ENST00000450602 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.15■■□□□ 1.14
CXorf40A-211ENST00000450602 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CXorf40A-211ENST00000450602 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CXorf40A-211ENST00000450602 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.14■■□□□ 1.13
CXorf40A-211ENST00000450602 DCCP43146 1447 aa22.14■■□□□ 1.13
CXorf40A-211ENST00000450602 TECPR2O15040 1411 aa22.13■■□□□ 1.13
CXorf40A-211ENST00000450602 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.12■■□□□ 1.13
CXorf40A-211ENST00000450602 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.12■■□□□ 1.13
CXorf40A-211ENST00000450602 NUTM2FA1L443 756 aa22.1■■□□□ 1.13
CXorf40A-211ENST00000450602 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.1■■□□□ 1.13
CXorf40A-211ENST00000450602 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa22.07■■□□□ 1.12
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