RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440825.6

FAAP20-210, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 855 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-210ENST00000440825 SLC26A8Q96RN1 970 aa41.63■■■■■ 4.25
FAAP20-210ENST00000440825 HDGFP51858 240 aaKnown RBP41.6■■■■■ 4.25
FAAP20-210ENST00000440825 ZFYVE9O95405 1425 aa41.6■■■■■ 4.25
FAAP20-210ENST00000440825 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP41.59■■■■■ 4.25
FAAP20-210ENST00000440825 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP41.56■■■■■ 4.24
FAAP20-210ENST00000440825 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP41.55■■■■■ 4.24
FAAP20-210ENST00000440825 LRRC7Q96NW7 1537 aa41.54■■■■■ 4.24
FAAP20-210ENST00000440825 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP41.52■■■■■ 4.24
FAAP20-210ENST00000440825 PIP4K2BP78356 416 aa41.51■■■■■ 4.24
FAAP20-210ENST00000440825 TOM1O60784 492 aa41.5■■■■■ 4.23
FAAP20-210ENST00000440825 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa41.5■■■■■ 4.23
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP41.48■■■■■ 4.23
FAAP20-210ENST00000440825 TRPM2O94759 1503 aa41.45■■■■■ 4.23
FAAP20-210ENST00000440825 CLTCL1P53675 1640 aa41.45■■■■■ 4.23
FAAP20-210ENST00000440825 KCNA6P17658 529 aa41.42■■■■■ 4.22
FAAP20-210ENST00000440825 FOXD1Q16676 465 aa41.38■■■■■ 4.21
FAAP20-210ENST00000440825 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP41.35■■■■■ 4.21
FAAP20-210ENST00000440825 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP41.34■■■■■ 4.21
FAAP20-210ENST00000440825 KIF1BO60333 1816 aa41.33■■■■■ 4.21
FAAP20-210ENST00000440825 SETD5Q9C0A6 1442 aa41.33■■■■■ 4.21
FAAP20-210ENST00000440825 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP41.32■■■■■ 4.2
FAAP20-210ENST00000440825 TMEM94Q12767 1356 aa41.31■■■■■ 4.2
FAAP20-210ENST00000440825 TBX22Q9Y458 520 aa41.31■■■■■ 4.2
FAAP20-210ENST00000440825 NWD1Q149M9 1564 aa41.29■■■■■ 4.2
FAAP20-210ENST00000440825 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa41.28■■■■■ 4.2
FAAP20-210ENST00000440825 MPHOSPH9Q99550 1183 aa41.28■■■■■ 4.2
FAAP20-210ENST00000440825 ALKQ9UM73 1620 aa41.28■■■■■ 4.2
FAAP20-210ENST00000440825 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP41.26■■■■■ 4.2
FAAP20-210ENST00000440825 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP41.25■■■■■ 4.19
FAAP20-210ENST00000440825 DIP2AQ14689 1571 aa41.25■■■■■ 4.19
FAAP20-210ENST00000440825 HSPA1LP34931 641 aa41.21■■■■■ 4.19
FAAP20-210ENST00000440825 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa41.2■■■■■ 4.19
FAAP20-210ENST00000440825 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa41.2■■■■■ 4.19
FAAP20-210ENST00000440825 CCDC144AA2RUR9 1427 aa41.14■■■■■ 4.18
FAAP20-210ENST00000440825 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa41.14■■■■■ 4.18
FAAP20-210ENST00000440825 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP41.14■■■■■ 4.18
FAAP20-210ENST00000440825 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa41.13■■■■■ 4.18
FAAP20-210ENST00000440825 PIK3R4Q99570 1358 aa41.12■■■■■ 4.17
FAAP20-210ENST00000440825 C14orf37Q86TY3 774 aa41.1■■■■■ 4.17
FAAP20-210ENST00000440825 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa41.1■■■■■ 4.17
FAAP20-210ENST00000440825 MSH6P52701 1360 aa41.1■■■■■ 4.17
FAAP20-210ENST00000440825 PTPRUQ92729 1446 aa41.07■■■■■ 4.16
FAAP20-210ENST00000440825 VGFO15240 615 aaPredicted RBP41.06■■■■■ 4.16
FAAP20-210ENST00000440825 DISP3Q9P2K9 1392 aa41.06■■■■■ 4.16
FAAP20-210ENST00000440825 RGL3Q3MIN7 710 aa41.05■■■■■ 4.16
FAAP20-210ENST00000440825 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa41.04■■■■■ 4.16
FAAP20-210ENST00000440825 METP08581 1390 aa41.02■■■■■ 4.16
FAAP20-210ENST00000440825 PPLO60437 1756 aa40.99■■■■■ 4.15
FAAP20-210ENST00000440825 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP40.93■■■■■ 4.14
FAAP20-210ENST00000440825 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa40.93■■■■■ 4.14
FAAP20-210ENST00000440825 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa40.92■■■■■ 4.14
FAAP20-210ENST00000440825 FAM135BQ49AJ0 1406 aa40.91■■■■■ 4.14
FAAP20-210ENST00000440825 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa40.91■■■■■ 4.14
FAAP20-210ENST00000440825 SLAIN2Q9P270 581 aa40.9■■■■■ 4.14
FAAP20-210ENST00000440825 ATF3P18847 181 aa40.87■■■■■ 4.13
FAAP20-210ENST00000440825 C19orf44Q9H6X5 657 aa40.87■■■■■ 4.13
FAAP20-210ENST00000440825 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP40.87■■■■■ 4.13
FAAP20-210ENST00000440825 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa40.86■■■■■ 4.13
FAAP20-210ENST00000440825 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP40.83■■■■■ 4.13
FAAP20-210ENST00000440825 CADPS2Q86UW7 1296 aa40.82■■■■■ 4.13
FAAP20-210ENST00000440825 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa40.81■■■■■ 4.12
FAAP20-210ENST00000440825 HRCP23327 699 aa40.8■■■■■ 4.12
FAAP20-210ENST00000440825 IFT172Q9UG01 1749 aa40.8■■■■■ 4.12
FAAP20-210ENST00000440825 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP40.76■■■■■ 4.12
FAAP20-210ENST00000440825 ROBO2Q9HCK4 1378 aa40.69■■■■■ 4.1
FAAP20-210ENST00000440825 PTCH1Q13635 1447 aa40.67■■■■■ 4.1
FAAP20-210ENST00000440825 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa40.67■■■■■ 4.1
FAAP20-210ENST00000440825 STK26Q9P289 416 aa40.67■■■■■ 4.1
FAAP20-210ENST00000440825 PHLPP1O60346 1717 aa40.67■■■■■ 4.1
FAAP20-210ENST00000440825 NALCNQ8IZF0 1738 aa40.67■■■■■ 4.1
FAAP20-210ENST00000440825 DCCP43146 1447 aa40.67■■■■■ 4.1
FAAP20-210ENST00000440825 ILDR2Q71H61 639 aa40.65■■■■■ 4.1
FAAP20-210ENST00000440825 PIK3C2GO75747 1445 aa40.65■■■■■ 4.1
FAAP20-210ENST00000440825 TMEM132EQ6IEE7 984 aa40.63■■■■■ 4.09
FAAP20-210ENST00000440825 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP40.61■■■■■ 4.09
FAAP20-210ENST00000440825 BRINP3Q76B58 766 aa40.58■■■■■ 4.09
FAAP20-210ENST00000440825 MST1RQ04912 1400 aa40.58■■■■■ 4.09
FAAP20-210ENST00000440825 MYOM2P54296 1465 aa40.57■■■■■ 4.08
FAAP20-210ENST00000440825 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa40.55■■■■■ 4.08
FAAP20-210ENST00000440825 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa40.55■■■■■ 4.08
FAAP20-210ENST00000440825 PRAG1Q86YV5 1406 aa40.54■■■■■ 4.08
FAAP20-210ENST00000440825 CFAP70Q5T0N1 1121 aa40.53■■■■■ 4.08
FAAP20-210ENST00000440825 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP40.52■■■■■ 4.08
FAAP20-210ENST00000440825 DCAF11Q8TEB1 546 aa40.51■■■■■ 4.08
FAAP20-210ENST00000440825 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP40.51■■■■■ 4.08
FAAP20-210ENST00000440825 NRXN1Q9ULB1 1477 aa40.51■■■■■ 4.07
FAAP20-210ENST00000440825 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP40.5■■■■■ 4.07
FAAP20-210ENST00000440825 WAPLQ7Z5K2 1190 aa40.49■■■■■ 4.07
FAAP20-210ENST00000440825 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP40.48■■■■■ 4.07
FAAP20-210ENST00000440825 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP40.48■■■■■ 4.07
FAAP20-210ENST00000440825 JCADQ9P266 1359 aa40.46■■■■■ 4.07
FAAP20-210ENST00000440825 LAMC1P11047 1609 aa40.45■■■■■ 4.07
FAAP20-210ENST00000440825 ABCC11Q96J66 1382 aa40.45■■■■■ 4.07
FAAP20-210ENST00000440825 TECPR2O15040 1411 aa40.43■■■■■ 4.06
FAAP20-210ENST00000440825 KNDC1Q76NI1 1749 aa40.43■■■■■ 4.06
FAAP20-210ENST00000440825 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP40.42■■■■■ 4.06
FAAP20-210ENST00000440825 C1orf167Q5SNV9 1468 aa40.42■■■■■ 4.06
FAAP20-210ENST00000440825 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa40.41■■■■■ 4.06
FAAP20-210ENST00000440825 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP40.4■■■■■ 4.06
FAAP20-210ENST00000440825 ORAI2Q96SN7 254 aa40.35■■■■■ 4.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 120.6 ms