RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440445.5

AFF3-211, Transcript of AF4/FMR2 family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene AFF3, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF3-211ENST00000440445 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa40.49■■■■■ 4.07
AFF3-211ENST00000440445 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP40.49■■■■■ 4.07
AFF3-211ENST00000440445 PIP4K2BP78356 416 aa40.47■■■■■ 4.07
AFF3-211ENST00000440445 SLC26A8Q96RN1 970 aa40.47■■■■■ 4.07
AFF3-211ENST00000440445 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP40.45■■■■■ 4.07
AFF3-211ENST00000440445 KCNA6P17658 529 aa40.45■■■■■ 4.07
AFF3-211ENST00000440445 NWD1Q149M9 1564 aa40.44■■■■■ 4.06
AFF3-211ENST00000440445 CHGAP10645 457 aaKnown RBP40.44■■■■■ 4.06
AFF3-211ENST00000440445 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP40.44■■■■■ 4.06
AFF3-211ENST00000440445 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP40.43■■■■■ 4.06
AFF3-211ENST00000440445 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP40.4■■■■■ 4.06
AFF3-211ENST00000440445 BCANQ96GW7 911 aa40.4■■■■■ 4.06
AFF3-211ENST00000440445 DISP3Q9P2K9 1392 aa40.35■■■■■ 4.05
AFF3-211ENST00000440445 HSPA1LP34931 641 aa40.35■■■■■ 4.05
AFF3-211ENST00000440445 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP40.35■■■■■ 4.05
AFF3-211ENST00000440445 TMEM94Q12767 1356 aa40.34■■■■■ 4.05
AFF3-211ENST00000440445 TRPM2O94759 1503 aa40.33■■■■■ 4.05
AFF3-211ENST00000440445 DIP2AQ14689 1571 aa40.33■■■■■ 4.05
AFF3-211ENST00000440445 TBX22Q9Y458 520 aa40.31■■■■■ 4.04
AFF3-211ENST00000440445 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa40.29■■■■■ 4.04
AFF3-211ENST00000440445 CLTCL1P53675 1640 aa40.28■■■■■ 4.04
AFF3-211ENST00000440445 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP40.28■■■■■ 4.04
AFF3-211ENST00000440445 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP40.25■■■■■ 4.03
AFF3-211ENST00000440445 TRIM52Q96A61 297 aa40.25■■■■■ 4.03
AFF3-211ENST00000440445 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP40.25■■■■■ 4.03
AFF3-211ENST00000440445 PIK3R4Q99570 1358 aa40.23■■■■■ 4.03
AFF3-211ENST00000440445 KIF1BO60333 1816 aa40.21■■■■■ 4.03
AFF3-211ENST00000440445 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa40.17■■■■■ 4.02
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AFF3-211ENST00000440445 FAM135BQ49AJ0 1406 aa40.13■■■■■ 4.01
AFF3-211ENST00000440445 MSH6P52701 1360 aa40.12■■■■■ 4.01
AFF3-211ENST00000440445 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa40.12■■■■■ 4.01
AFF3-211ENST00000440445 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP40.07■■■■■ 4.01
AFF3-211ENST00000440445 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa40.03■■■■■ 4
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AFF3-211ENST00000440445 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa39.94■■■■□ 3.98
AFF3-211ENST00000440445 SLAIN2Q9P270 581 aa39.94■■■■□ 3.98
AFF3-211ENST00000440445 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP39.93■■■■□ 3.98
AFF3-211ENST00000440445 MPHOSPH9Q99550 1183 aa39.92■■■■□ 3.98
AFF3-211ENST00000440445 METP08581 1390 aa39.92■■■■□ 3.98
AFF3-211ENST00000440445 SETD5Q9C0A6 1442 aa39.91■■■■□ 3.98
AFF3-211ENST00000440445 VGFO15240 615 aaPredicted RBP39.91■■■■□ 3.98
AFF3-211ENST00000440445 FOXD1Q16676 465 aa39.91■■■■□ 3.98
AFF3-211ENST00000440445 C14orf37Q86TY3 774 aa39.91■■■■□ 3.98
AFF3-211ENST00000440445 PPLO60437 1756 aa39.91■■■■□ 3.98
AFF3-211ENST00000440445 C19orf44Q9H6X5 657 aa39.9■■■■□ 3.98
AFF3-211ENST00000440445 CCDC144AA2RUR9 1427 aa39.88■■■■□ 3.97
AFF3-211ENST00000440445 CADPS2Q86UW7 1296 aa39.86■■■■□ 3.97
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AFF3-211ENST00000440445 ATF3P18847 181 aa39.81■■■■□ 3.96
AFF3-211ENST00000440445 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa39.79■■■■□ 3.96
AFF3-211ENST00000440445 PHLPP1O60346 1717 aa39.78■■■■□ 3.96
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AFF3-211ENST00000440445 SOCS7O14512 581 aa39.75■■■■□ 3.95
AFF3-211ENST00000440445 IFT172Q9UG01 1749 aa39.74■■■■□ 3.95
AFF3-211ENST00000440445 PRAG1Q86YV5 1406 aa39.74■■■■□ 3.95
AFF3-211ENST00000440445 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP39.72■■■■□ 3.95
AFF3-211ENST00000440445 PTCH1Q13635 1447 aa39.72■■■■□ 3.95
AFF3-211ENST00000440445 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa39.72■■■■□ 3.95
AFF3-211ENST00000440445 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP39.69■■■■□ 3.94
AFF3-211ENST00000440445 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa39.69■■■■□ 3.94
AFF3-211ENST00000440445 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP39.68■■■■□ 3.94
AFF3-211ENST00000440445 NALCNQ8IZF0 1738 aa39.68■■■■□ 3.94
AFF3-211ENST00000440445 RGL3Q3MIN7 710 aa39.64■■■■□ 3.94
AFF3-211ENST00000440445 MST1RQ04912 1400 aa39.64■■■■□ 3.94
AFF3-211ENST00000440445 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa39.63■■■■□ 3.93
AFF3-211ENST00000440445 JCADQ9P266 1359 aa39.62■■■■□ 3.93
AFF3-211ENST00000440445 ROBO2Q9HCK4 1378 aa39.6■■■■□ 3.93
AFF3-211ENST00000440445 BRINP3Q76B58 766 aa39.59■■■■□ 3.93
AFF3-211ENST00000440445 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa39.57■■■■□ 3.93
AFF3-211ENST00000440445 PIK3C2GO75747 1445 aa39.55■■■■□ 3.92
AFF3-211ENST00000440445 HRCP23327 699 aa39.54■■■■□ 3.92
AFF3-211ENST00000440445 NHSL1Q5SYE7 1610 aa39.51■■■■□ 3.92
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AFF3-211ENST00000440445 TECPR2O15040 1411 aa39.48■■■■□ 3.91
AFF3-211ENST00000440445 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP39.48■■■■□ 3.91
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AFF3-211ENST00000440445 KNDC1Q76NI1 1749 aa39.45■■■■□ 3.91
AFF3-211ENST00000440445 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP39.45■■■■□ 3.91
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AFF3-211ENST00000440445 C1orf167Q5SNV9 1468 aa39.44■■■■□ 3.9
AFF3-211ENST00000440445 LAMC1P11047 1609 aa39.41■■■■□ 3.9
AFF3-211ENST00000440445 ABCC11Q96J66 1382 aa39.41■■■■□ 3.9
AFF3-211ENST00000440445 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa39.4■■■■□ 3.9
AFF3-211ENST00000440445 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP39.36■■■■□ 3.89
AFF3-211ENST00000440445 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP39.35■■■■□ 3.89
AFF3-211ENST00000440445 LRP6O75581 1613 aa39.35■■■■□ 3.89
AFF3-211ENST00000440445 TMEM132EQ6IEE7 984 aa39.34■■■■□ 3.89
AFF3-211ENST00000440445 STK26Q9P289 416 aa39.34■■■■□ 3.89
AFF3-211ENST00000440445 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP39.3■■■■□ 3.88
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