RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411858.1

CCZ1B-202, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

TSL 5

Gene CCZ1B, Length 571 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1B-202ENST00000411858 DISP3Q9P2K9 1392 aa37.06■■■■□ 3.52
CCZ1B-202ENST00000411858 SETD5Q9C0A6 1442 aa37.05■■■■□ 3.52
CCZ1B-202ENST00000411858 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa37.05■■■■□ 3.52
CCZ1B-202ENST00000411858 ZFYVE9O95405 1425 aa37.04■■■■□ 3.52
CCZ1B-202ENST00000411858 PIP4K2BP78356 416 aa37.03■■■■□ 3.52
CCZ1B-202ENST00000411858 RIMS2Q9UQ26 1411 aa37.02■■■■□ 3.52
CCZ1B-202ENST00000411858 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP37.01■■■■□ 3.52
CCZ1B-202ENST00000411858 HDGFP51858 240 aaKnown RBP36.99■■■■□ 3.51
CCZ1B-202ENST00000411858 MPHOSPH9Q99550 1183 aa36.98■■■■□ 3.51
CCZ1B-202ENST00000411858 NWD1Q149M9 1564 aa36.97■■■■□ 3.51
CCZ1B-202ENST00000411858 FOXD1Q16676 465 aa36.97■■■■□ 3.51
CCZ1B-202ENST00000411858 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP36.97■■■■□ 3.51
CCZ1B-202ENST00000411858 SLC26A8Q96RN1 970 aa36.97■■■■□ 3.51
CCZ1B-202ENST00000411858 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP36.96■■■■□ 3.51
CCZ1B-202ENST00000411858 HSPA1LP34931 641 aa36.95■■■■□ 3.51
CCZ1B-202ENST00000411858 TRPM2O94759 1503 aa36.95■■■■□ 3.5
CCZ1B-202ENST00000411858 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP36.94■■■■□ 3.5
CCZ1B-202ENST00000411858 CLTCL1P53675 1640 aa36.92■■■■□ 3.5
CCZ1B-202ENST00000411858 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa36.92■■■■□ 3.5
CCZ1B-202ENST00000411858 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP36.92■■■■□ 3.5
CCZ1B-202ENST00000411858 BCANQ96GW7 911 aa36.92■■■■□ 3.5
CCZ1B-202ENST00000411858 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa36.91■■■■□ 3.5
CCZ1B-202ENST00000411858 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP36.89■■■■□ 3.5
CCZ1B-202ENST00000411858 KCNA6P17658 529 aa36.87■■■■□ 3.49
CCZ1B-202ENST00000411858 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP36.87■■■■□ 3.49
CCZ1B-202ENST00000411858 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP36.86■■■■□ 3.49
CCZ1B-202ENST00000411858 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP36.86■■■■□ 3.49
CCZ1B-202ENST00000411858 ILDR2Q71H61 639 aa36.85■■■■□ 3.49
CCZ1B-202ENST00000411858 TMEM94Q12767 1356 aa36.83■■■■□ 3.49
CCZ1B-202ENST00000411858 TBX22Q9Y458 520 aa36.81■■■■□ 3.48
CCZ1B-202ENST00000411858 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP36.79■■■■□ 3.48
CCZ1B-202ENST00000411858 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa36.77■■■■□ 3.48
CCZ1B-202ENST00000411858 DIP2AQ14689 1571 aa36.77■■■■□ 3.48
CCZ1B-202ENST00000411858 KIF1BO60333 1816 aa36.76■■■■□ 3.48
CCZ1B-202ENST00000411858 HRCP23327 699 aa36.76■■■■□ 3.48
CCZ1B-202ENST00000411858 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP36.72■■■■□ 3.47
CCZ1B-202ENST00000411858 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa36.7■■■■□ 3.47
CCZ1B-202ENST00000411858 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP36.7■■■■□ 3.47
CCZ1B-202ENST00000411858 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa36.68■■■■□ 3.46
CCZ1B-202ENST00000411858 CCDC144AA2RUR9 1427 aa36.68■■■■□ 3.46
CCZ1B-202ENST00000411858 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa36.65■■■■□ 3.46
CCZ1B-202ENST00000411858 FAM135BQ49AJ0 1406 aa36.65■■■■□ 3.46
CCZ1B-202ENST00000411858 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa36.64■■■■□ 3.46
CCZ1B-202ENST00000411858 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa36.62■■■■□ 3.45
CCZ1B-202ENST00000411858 VGFO15240 615 aaPredicted RBP36.62■■■■□ 3.45
CCZ1B-202ENST00000411858 PIK3R4Q99570 1358 aa36.62■■■■□ 3.45
CCZ1B-202ENST00000411858 RGL3Q3MIN7 710 aa36.61■■■■□ 3.45
CCZ1B-202ENST00000411858 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa36.59■■■■□ 3.45
CCZ1B-202ENST00000411858 MSH6P52701 1360 aa36.59■■■■□ 3.45
CCZ1B-202ENST00000411858 SOCS7O14512 581 aa36.59■■■■□ 3.45
CCZ1B-202ENST00000411858 PTPRUQ92729 1446 aa36.57■■■■□ 3.44
CCZ1B-202ENST00000411858 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa36.56■■■■□ 3.44
CCZ1B-202ENST00000411858 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP36.55■■■■□ 3.44
CCZ1B-202ENST00000411858 METP08581 1390 aa36.54■■■■□ 3.44
CCZ1B-202ENST00000411858 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa36.54■■■■□ 3.44
CCZ1B-202ENST00000411858 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa36.53■■■■□ 3.44
CCZ1B-202ENST00000411858 PPLO60437 1756 aa36.5■■■■□ 3.43
CCZ1B-202ENST00000411858 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP36.5■■■■□ 3.43
CCZ1B-202ENST00000411858 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa36.48■■■■□ 3.43
CCZ1B-202ENST00000411858 SLAIN2Q9P270 581 aa36.42■■■■□ 3.42
CCZ1B-202ENST00000411858 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP36.42■■■■□ 3.42
CCZ1B-202ENST00000411858 PHLPP1O60346 1717 aa36.42■■■■□ 3.42
CCZ1B-202ENST00000411858 IFT172Q9UG01 1749 aa36.37■■■■□ 3.41
CCZ1B-202ENST00000411858 C14orf37Q86TY3 774 aa36.35■■■■□ 3.41
CCZ1B-202ENST00000411858 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP36.34■■■■□ 3.41
CCZ1B-202ENST00000411858 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP36.34■■■■□ 3.41
CCZ1B-202ENST00000411858 C19orf44Q9H6X5 657 aa36.34■■■■□ 3.41
CCZ1B-202ENST00000411858 DCCP43146 1447 aa36.31■■■■□ 3.4
CCZ1B-202ENST00000411858 CADPS2Q86UW7 1296 aa36.3■■■■□ 3.4
CCZ1B-202ENST00000411858 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP36.28■■■■□ 3.4
CCZ1B-202ENST00000411858 NALCNQ8IZF0 1738 aa36.28■■■■□ 3.4
CCZ1B-202ENST00000411858 PIK3C2GO75747 1445 aa36.27■■■■□ 3.4
CCZ1B-202ENST00000411858 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP36.27■■■■□ 3.4
CCZ1B-202ENST00000411858 ATF3P18847 181 aa36.25■■■■□ 3.39
CCZ1B-202ENST00000411858 ROBO2Q9HCK4 1378 aa36.24■■■■□ 3.39
CCZ1B-202ENST00000411858 TMEM132EQ6IEE7 984 aa36.23■■■■□ 3.39
CCZ1B-202ENST00000411858 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP36.23■■■■□ 3.39
CCZ1B-202ENST00000411858 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa36.22■■■■□ 3.39
CCZ1B-202ENST00000411858 NRXN1Q9ULB1 1477 aa36.22■■■■□ 3.39
CCZ1B-202ENST00000411858 MYOM2P54296 1465 aa36.21■■■■□ 3.39
CCZ1B-202ENST00000411858 PTCH1Q13635 1447 aa36.2■■■■□ 3.39
CCZ1B-202ENST00000411858 PRAG1Q86YV5 1406 aa36.2■■■■□ 3.39
CCZ1B-202ENST00000411858 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP36.2■■■■□ 3.39
CCZ1B-202ENST00000411858 MST1RQ04912 1400 aa36.19■■■■□ 3.38
CCZ1B-202ENST00000411858 JCADQ9P266 1359 aa36.19■■■■□ 3.38
CCZ1B-202ENST00000411858 CFAP70Q5T0N1 1121 aa36.19■■■■□ 3.38
CCZ1B-202ENST00000411858 DCAF11Q8TEB1 546 aa36.19■■■■□ 3.38
CCZ1B-202ENST00000411858 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa36.19■■■■□ 3.38
CCZ1B-202ENST00000411858 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP36.17■■■■□ 3.38
CCZ1B-202ENST00000411858 STK26Q9P289 416 aa36.17■■■■□ 3.38
CCZ1B-202ENST00000411858 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa36.16■■■■□ 3.38
CCZ1B-202ENST00000411858 SHPRHQ149N8 1683 aa36.15■■■■□ 3.38
CCZ1B-202ENST00000411858 BRINP3Q76B58 766 aa36.14■■■■□ 3.38
CCZ1B-202ENST00000411858 NHSL1Q5SYE7 1610 aa36.14■■■■□ 3.38
CCZ1B-202ENST00000411858 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP36.14■■■■□ 3.38
CCZ1B-202ENST00000411858 ABCC11Q96J66 1382 aa36.11■■■■□ 3.37
CCZ1B-202ENST00000411858 STAC3Q96MF2 364 aa36.1■■■■□ 3.37
CCZ1B-202ENST00000411858 WAPLQ7Z5K2 1190 aa36.08■■■■□ 3.37
CCZ1B-202ENST00000411858 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP36.08■■■■□ 3.37
CCZ1B-202ENST00000411858 LRP6O75581 1613 aa36.07■■■■□ 3.36
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