RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404321.3

PTPRN2-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRN2, Length 1,374 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-204ENST00000404321 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa27.13■■□□□ 1.93
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PTPRN2-204ENST00000404321 FOXD1Q16676 465 aa27.13■■□□□ 1.93
PTPRN2-204ENST00000404321 MYO5BQ9ULV0 1848 aa27.13■■□□□ 1.93
PTPRN2-204ENST00000404321 HDGFP51858 240 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
PTPRN2-204ENST00000404321 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.11■■□□□ 1.93
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PTPRN2-204ENST00000404321 TRPM2O94759 1503 aa27.09■■□□□ 1.93
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PTPRN2-204ENST00000404321 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.08■■□□□ 1.93
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PTPRN2-204ENST00000404321 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.04■■□□□ 1.92
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PTPRN2-204ENST00000404321 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.91■■□□□ 1.9
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PTPRN2-204ENST00000404321 NWD1Q149M9 1564 aa26.89■■□□□ 1.89
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PTPRN2-204ENST00000404321 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa26.84■■□□□ 1.89
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PTPRN2-204ENST00000404321 METP08581 1390 aa26.82■■□□□ 1.88
PTPRN2-204ENST00000404321 PIK3R4Q99570 1358 aa26.82■■□□□ 1.88
PTPRN2-204ENST00000404321 HSPA1LP34931 641 aa26.81■■□□□ 1.88
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PTPRN2-204ENST00000404321 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.79■■□□□ 1.88
PTPRN2-204ENST00000404321 C14orf37Q86TY3 774 aa26.79■■□□□ 1.88
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PTPRN2-204ENST00000404321 MSH6P52701 1360 aa26.76■■□□□ 1.87
PTPRN2-204ENST00000404321 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa26.75■■□□□ 1.87
PTPRN2-204ENST00000404321 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.72■■□□□ 1.87
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PTPRN2-204ENST00000404321 C19orf44Q9H6X5 657 aa26.65■■□□□ 1.86
PTPRN2-204ENST00000404321 FAM135BQ49AJ0 1406 aa26.63■■□□□ 1.85
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PTPRN2-204ENST00000404321 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.59■■□□□ 1.85
PTPRN2-204ENST00000404321 CADPS2Q86UW7 1296 aa26.59■■□□□ 1.85
PTPRN2-204ENST00000404321 IFT172Q9UG01 1749 aa26.59■■□□□ 1.85
PTPRN2-204ENST00000404321 PIK3C2GO75747 1445 aa26.59■■□□□ 1.85
PTPRN2-204ENST00000404321 TMEM132EQ6IEE7 984 aa26.58■■□□□ 1.85
PTPRN2-204ENST00000404321 STK26Q9P289 416 aa26.58■■□□□ 1.85
PTPRN2-204ENST00000404321 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa26.57■■□□□ 1.84
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PTPRN2-204ENST00000404321 PTCH1Q13635 1447 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRN2-204ENST00000404321 MYOM2P54296 1465 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRN2-204ENST00000404321 CFAP70Q5T0N1 1121 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRN2-204ENST00000404321 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRN2-204ENST00000404321 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRN2-204ENST00000404321 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRN2-204ENST00000404321 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
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PTPRN2-204ENST00000404321 DCCP43146 1447 aa26.5■■□□□ 1.83
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PTPRN2-204ENST00000404321 MST1RQ04912 1400 aa26.47■■□□□ 1.83
PTPRN2-204ENST00000404321 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
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PTPRN2-204ENST00000404321 ABCC11Q96J66 1382 aa26.44■■□□□ 1.82
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PTPRN2-204ENST00000404321 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
PTPRN2-204ENST00000404321 TECPR2O15040 1411 aa26.42■■□□□ 1.82
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PTPRN2-204ENST00000404321 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
PTPRN2-204ENST00000404321 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.38■■□□□ 1.81
PTPRN2-204ENST00000404321 LAMC1P11047 1609 aa26.37■■□□□ 1.81
PTPRN2-204ENST00000404321 C1orf167Q5SNV9 1468 aa26.37■■□□□ 1.81
PTPRN2-204ENST00000404321 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP26.36■■□□□ 1.81
PTPRN2-204ENST00000404321 ILDR2Q71H61 639 aa26.36■■□□□ 1.81
PTPRN2-204ENST00000404321 STAC3Q96MF2 364 aa26.35■■□□□ 1.81
PTPRN2-204ENST00000404321 ORAI2Q96SN7 254 aa26.35■■□□□ 1.81
PTPRN2-204ENST00000404321 NUTM2FA1L443 756 aa26.34■■□□□ 1.81
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