RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395211.6

TMOD1-203, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,259 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-203ENST00000395211 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
TMOD1-203ENST00000395211 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
TMOD1-203ENST00000395211 TRERF1Q96PN7 1200 aa11.93□□□□□ -0.5
TMOD1-203ENST00000395211 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
TMOD1-203ENST00000395211 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa11.92□□□□□ -0.5
TMOD1-203ENST00000395211 KCNA4P22459 653 aa11.92□□□□□ -0.5
TMOD1-203ENST00000395211 TAF3Q5VWG9 929 aa11.91□□□□□ -0.5
TMOD1-203ENST00000395211 PANK1Q8TE04 598 aa11.91□□□□□ -0.5
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TMOD1-203ENST00000395211 PTPN23Q9H3S7 1636 aa11.9□□□□□ -0.5
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TMOD1-203ENST00000395211 FGD5Q6ZNL6 1462 aa11.89□□□□□ -0.51
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TMOD1-203ENST00000395211 DUSP27Q5VZP5 1158 aa11.89□□□□□ -0.51
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TMOD1-203ENST00000395211 MCTP1Q6DN14 999 aa11.87□□□□□ -0.51
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TMOD1-203ENST00000395211 NLRP1Q9C000 1473 aa11.86□□□□□ -0.51
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TMOD1-203ENST00000395211 TPRNQ4KMQ1 711 aa11.82□□□□□ -0.52
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TMOD1-203ENST00000395211 RGS22Q8NE09 1264 aa11.82□□□□□ -0.52
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TMOD1-203ENST00000395211 MIA2Q96PC5 1412 aa11.81□□□□□ -0.52
TMOD1-203ENST00000395211 CGNL1Q0VF96 1302 aa11.81□□□□□ -0.52
TMOD1-203ENST00000395211 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
TMOD1-203ENST00000395211 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa11.81□□□□□ -0.52
TMOD1-203ENST00000395211 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
TMOD1-203ENST00000395211 BCL2L13Q9BXK5 485 aa11.8□□□□□ -0.52
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TMOD1-203ENST00000395211 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
TMOD1-203ENST00000395211 CCDC66A2RUB6 948 aa11.8□□□□□ -0.52
TMOD1-203ENST00000395211 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
TMOD1-203ENST00000395211 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa11.8□□□□□ -0.52
TMOD1-203ENST00000395211 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
TMOD1-203ENST00000395211 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa11.8□□□□□ -0.52
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TMOD1-203ENST00000395211 BCORL1Q5H9F3 1711 aa11.79□□□□□ -0.52
TMOD1-203ENST00000395211 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
TMOD1-203ENST00000395211 PDLIM2Q96JY6 352 aa11.79□□□□□ -0.52
TMOD1-203ENST00000395211 PRIMPOLQ96LW4 560 aa11.79□□□□□ -0.52
TMOD1-203ENST00000395211 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
TMOD1-203ENST00000395211 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
TMOD1-203ENST00000395211 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
TMOD1-203ENST00000395211 ARID3CA6NKF2 412 aa11.77□□□□□ -0.52
TMOD1-203ENST00000395211 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.52
TMOD1-203ENST00000395211 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP11.77□□□□□ -0.52
TMOD1-203ENST00000395211 TNNQ9UQP3 1299 aa11.77□□□□□ -0.52
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