RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366976.3

NSL1-201, Transcript of NSL1, MIS12 kinetochore complex component, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NSL1, Length 722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSL1-201ENST00000366976 ADGRB3O60242 1522 aa23.39■■□□□ 1.34
NSL1-201ENST00000366976 E9PCH4 1651 aa23.38■■□□□ 1.33
NSL1-201ENST00000366976 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
NSL1-201ENST00000366976 HSPA1LP34931 641 aa23.38■■□□□ 1.33
NSL1-201ENST00000366976 PIP4K2BP78356 416 aa23.35■■□□□ 1.33
NSL1-201ENST00000366976 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP23.35■■□□□ 1.33
NSL1-201ENST00000366976 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa23.32■■□□□ 1.32
NSL1-201ENST00000366976 ZFYVE9O95405 1425 aa23.32■■□□□ 1.32
NSL1-201ENST00000366976 ALKQ9UM73 1620 aa23.31■■□□□ 1.32
NSL1-201ENST00000366976 STRCP1A6NGW2 1772 aa23.31■■□□□ 1.32
NSL1-201ENST00000366976 TOM1O60784 492 aa23.3■■□□□ 1.32
NSL1-201ENST00000366976 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa23.27■■□□□ 1.32
NSL1-201ENST00000366976 TRIM52Q96A61 297 aa23.27■■□□□ 1.32
NSL1-201ENST00000366976 RIMS2Q9UQ26 1411 aa23.26■■□□□ 1.31
NSL1-201ENST00000366976 KCNA6P17658 529 aa23.24■■□□□ 1.31
NSL1-201ENST00000366976 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
NSL1-201ENST00000366976 TBX22Q9Y458 520 aa23.24■■□□□ 1.31
NSL1-201ENST00000366976 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.23■■□□□ 1.31
NSL1-201ENST00000366976 TRPM2O94759 1503 aa23.23■■□□□ 1.31
NSL1-201ENST00000366976 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
NSL1-201ENST00000366976 HRCP23327 699 aa23.21■■□□□ 1.31
NSL1-201ENST00000366976 LRRC7Q96NW7 1537 aa23.2■■□□□ 1.3
NSL1-201ENST00000366976 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.2■■□□□ 1.3
NSL1-201ENST00000366976 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
NSL1-201ENST00000366976 PIK3R4Q99570 1358 aa23.18■■□□□ 1.3
NSL1-201ENST00000366976 SLC26A8Q96RN1 970 aa23.17■■□□□ 1.3
NSL1-201ENST00000366976 MYO5BQ9ULV0 1848 aa23.16■■□□□ 1.3
NSL1-201ENST00000366976 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
NSL1-201ENST00000366976 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa23.15■■□□□ 1.3
NSL1-201ENST00000366976 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.15■■□□□ 1.3
NSL1-201ENST00000366976 DIP2AQ14689 1571 aa23.14■■□□□ 1.3
NSL1-201ENST00000366976 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
NSL1-201ENST00000366976 BCANQ96GW7 911 aa23.14■■□□□ 1.29
NSL1-201ENST00000366976 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.12■■□□□ 1.29
NSL1-201ENST00000366976 NWD1Q149M9 1564 aa23.11■■□□□ 1.29
NSL1-201ENST00000366976 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa23.11■■□□□ 1.29
NSL1-201ENST00000366976 VGFO15240 615 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
NSL1-201ENST00000366976 CLTCL1P53675 1640 aa23.1■■□□□ 1.29
NSL1-201ENST00000366976 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
NSL1-201ENST00000366976 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
NSL1-201ENST00000366976 KIF1BO60333 1816 aa23.07■■□□□ 1.28
NSL1-201ENST00000366976 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa23.06■■□□□ 1.28
NSL1-201ENST00000366976 TMEM94Q12767 1356 aa23.05■■□□□ 1.28
NSL1-201ENST00000366976 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.05■■□□□ 1.28
NSL1-201ENST00000366976 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
NSL1-201ENST00000366976 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.04■■□□□ 1.28
NSL1-201ENST00000366976 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa23.03■■□□□ 1.28
NSL1-201ENST00000366976 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
NSL1-201ENST00000366976 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.98■■□□□ 1.27
NSL1-201ENST00000366976 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.98■■□□□ 1.27
NSL1-201ENST00000366976 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
NSL1-201ENST00000366976 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.97■■□□□ 1.27
NSL1-201ENST00000366976 MSH6P52701 1360 aa22.97■■□□□ 1.27
NSL1-201ENST00000366976 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.97■■□□□ 1.27
NSL1-201ENST00000366976 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.96■■□□□ 1.27
NSL1-201ENST00000366976 C19orf44Q9H6X5 657 aa22.95■■□□□ 1.26
NSL1-201ENST00000366976 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.92■■□□□ 1.26
NSL1-201ENST00000366976 PTPRUQ92729 1446 aa22.92■■□□□ 1.26
NSL1-201ENST00000366976 METP08581 1390 aa22.91■■□□□ 1.26
NSL1-201ENST00000366976 CADPS2Q86UW7 1296 aa22.91■■□□□ 1.26
NSL1-201ENST00000366976 STAC3Q96MF2 364 aa22.91■■□□□ 1.26
NSL1-201ENST00000366976 SLAIN2Q9P270 581 aa22.89■■□□□ 1.25
NSL1-201ENST00000366976 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa22.89■■□□□ 1.25
NSL1-201ENST00000366976 DCCP43146 1447 aa22.89■■□□□ 1.25
NSL1-201ENST00000366976 PPLO60437 1756 aa22.89■■□□□ 1.25
NSL1-201ENST00000366976 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
NSL1-201ENST00000366976 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
NSL1-201ENST00000366976 RGL3Q3MIN7 710 aa22.85■■□□□ 1.25
NSL1-201ENST00000366976 ATF3P18847 181 aa22.84■■□□□ 1.25
NSL1-201ENST00000366976 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
NSL1-201ENST00000366976 PTCH1Q13635 1447 aa22.83■■□□□ 1.25
NSL1-201ENST00000366976 C14orf37Q86TY3 774 aa22.83■■□□□ 1.25
NSL1-201ENST00000366976 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.82■■□□□ 1.24
NSL1-201ENST00000366976 POTEAQ6S8J7 498 aa22.81■■□□□ 1.24
NSL1-201ENST00000366976 PIK3C2GO75747 1445 aa22.8■■□□□ 1.24
NSL1-201ENST00000366976 IFT172Q9UG01 1749 aa22.79■■□□□ 1.24
NSL1-201ENST00000366976 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.79■■□□□ 1.24
NSL1-201ENST00000366976 PHLPP1O60346 1717 aa22.79■■□□□ 1.24
NSL1-201ENST00000366976 MYOM2P54296 1465 aa22.79■■□□□ 1.24
NSL1-201ENST00000366976 SIRT1Q96EB6 747 aa22.78■■□□□ 1.24
NSL1-201ENST00000366976 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
NSL1-201ENST00000366976 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.77■■□□□ 1.24
NSL1-201ENST00000366976 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
NSL1-201ENST00000366976 ABCC11Q96J66 1382 aa22.76■■□□□ 1.23
NSL1-201ENST00000366976 TECPR2O15040 1411 aa22.76■■□□□ 1.23
NSL1-201ENST00000366976 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
NSL1-201ENST00000366976 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.73■■□□□ 1.23
NSL1-201ENST00000366976 LAMC1P11047 1609 aa22.68■■□□□ 1.22
NSL1-201ENST00000366976 MST1RQ04912 1400 aa22.68■■□□□ 1.22
NSL1-201ENST00000366976 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
NSL1-201ENST00000366976 BRINP3Q76B58 766 aa22.67■■□□□ 1.22
NSL1-201ENST00000366976 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
NSL1-201ENST00000366976 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
NSL1-201ENST00000366976 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
NSL1-201ENST00000366976 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.64■■□□□ 1.21
NSL1-201ENST00000366976 JCADQ9P266 1359 aa22.63■■□□□ 1.21
NSL1-201ENST00000366976 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.63■■□□□ 1.21
NSL1-201ENST00000366976 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.62■■□□□ 1.21
NSL1-201ENST00000366976 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.62■■□□□ 1.21
NSL1-201ENST00000366976 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.61■■□□□ 1.21
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