RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 MYOM1P52179 1685 aa28.06■■■□□ 2.08
KCNQ1-202ENST00000335475 PANK3Q9H999 370 aa28.06■■■□□ 2.08
KCNQ1-202ENST00000335475 PPP4R2Q9NY27 417 aa28.06■■■□□ 2.08
KCNQ1-202ENST00000335475 RNF123Q5XPI4 1314 aa28.05■■■□□ 2.08
KCNQ1-202ENST00000335475 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.05■■■□□ 2.08
KCNQ1-202ENST00000335475 ADGRB3O60242 1522 aa28.03■■■□□ 2.08
KCNQ1-202ENST00000335475 NRXN1Q9ULB1 1477 aa28.02■■■□□ 2.08
KCNQ1-202ENST00000335475 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.01■■■□□ 2.08
KCNQ1-202ENST00000335475 INSRP06213 1382 aa27.98■■■□□ 2.07
KCNQ1-202ENST00000335475 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
KCNQ1-202ENST00000335475 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
KCNQ1-202ENST00000335475 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
KCNQ1-202ENST00000335475 NEO1Q92859 1461 aa27.96■■■□□ 2.07
KCNQ1-202ENST00000335475 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa27.96■■■□□ 2.07
KCNQ1-202ENST00000335475 NPATQ14207 1427 aa27.96■■■□□ 2.07
KCNQ1-202ENST00000335475 MYO3AQ8NEV4 1616 aa27.96■■■□□ 2.07
KCNQ1-202ENST00000335475 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
KCNQ1-202ENST00000335475 PPLO60437 1756 aa27.93■■■□□ 2.06
KCNQ1-202ENST00000335475 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa27.93■■■□□ 2.06
KCNQ1-202ENST00000335475 ABCC3O15438 1527 aa27.93■■■□□ 2.06
KCNQ1-202ENST00000335475 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
KCNQ1-202ENST00000335475 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa27.9■■■□□ 2.06
KCNQ1-202ENST00000335475 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa27.9■■■□□ 2.06
KCNQ1-202ENST00000335475 CDCA8Q53HL2 280 aa27.9■■■□□ 2.06
KCNQ1-202ENST00000335475 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.89■■■□□ 2.06
KCNQ1-202ENST00000335475 ERVK-7P63135 1459 aa27.89■■■□□ 2.06
KCNQ1-202ENST00000335475 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa27.89■■■□□ 2.05
KCNQ1-202ENST00000335475 RICTORQ6R327 1708 aa27.89■■■□□ 2.05
KCNQ1-202ENST00000335475 CFAP70Q5T0N1 1121 aa27.89■■■□□ 2.05
KCNQ1-202ENST00000335475 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.88■■■□□ 2.05
KCNQ1-202ENST00000335475 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
KCNQ1-202ENST00000335475 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
KCNQ1-202ENST00000335475 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa27.86■■■□□ 2.05
KCNQ1-202ENST00000335475 NOS1P29475 1434 aa27.86■■■□□ 2.05
KCNQ1-202ENST00000335475 PIK3C2BO00750 1634 aa27.84■■■□□ 2.05
KCNQ1-202ENST00000335475 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
KCNQ1-202ENST00000335475 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa27.83■■■□□ 2.05
KCNQ1-202ENST00000335475 PIK3C2GO75747 1445 aa27.82■■■□□ 2.04
KCNQ1-202ENST00000335475 KNSTRNQ9Y448 316 aa27.82■■■□□ 2.04
KCNQ1-202ENST00000335475 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa27.81■■■□□ 2.04
KCNQ1-202ENST00000335475 PDE3BQ13370 1112 aa27.8■■■□□ 2.04
KCNQ1-202ENST00000335475 ADGRB1O14514 1584 aa27.79■■■□□ 2.04
KCNQ1-202ENST00000335475 GGT6Q6P531 493 aa27.79■■■□□ 2.04
KCNQ1-202ENST00000335475 PPP2R1AP30153 589 aa27.78■■■□□ 2.04
KCNQ1-202ENST00000335475 RAPGEF3O95398 923 aa27.76■■■□□ 2.03
KCNQ1-202ENST00000335475 GLI2P10070 1586 aa27.75■■■□□ 2.03
KCNQ1-202ENST00000335475 QRICH2Q9H0J4 1663 aa27.75■■■□□ 2.03
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC24A1O60721 1099 aa27.75■■■□□ 2.03
KCNQ1-202ENST00000335475 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
KCNQ1-202ENST00000335475 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa27.71■■■□□ 2.03
KCNQ1-202ENST00000335475 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa27.71■■■□□ 2.03
KCNQ1-202ENST00000335475 RRP1P56182 461 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.03
KCNQ1-202ENST00000335475 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
KCNQ1-202ENST00000335475 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa27.69■■■□□ 2.02
KCNQ1-202ENST00000335475 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.69■■■□□ 2.02
KCNQ1-202ENST00000335475 CHGAP10645 457 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
KCNQ1-202ENST00000335475 RCAN3Q9UKA8 241 aa27.69■■■□□ 2.02
KCNQ1-202ENST00000335475 CDCA7LQ96GN5 454 aa27.68■■■□□ 2.02
KCNQ1-202ENST00000335475 ADAMTS8Q9UP79 889 aa27.67■■■□□ 2.02
KCNQ1-202ENST00000335475 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
KCNQ1-202ENST00000335475 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
KCNQ1-202ENST00000335475 CARD14Q9BXL6 1004 aa27.62■■■□□ 2.01
KCNQ1-202ENST00000335475 PREX1Q8TCU6 1659 aa27.61■■■□□ 2.01
KCNQ1-202ENST00000335475 CCDC136Q96JN2 1154 aa27.61■■■□□ 2.01
KCNQ1-202ENST00000335475 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa27.6■■■□□ 2.01
KCNQ1-202ENST00000335475 MYO5BQ9ULV0 1848 aa27.6■■■□□ 2.01
KCNQ1-202ENST00000335475 FANCIQ9NVI1 1328 aa27.6■■■□□ 2.01
KCNQ1-202ENST00000335475 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP27.59■■■□□ 2.01
KCNQ1-202ENST00000335475 TRAK1Q9UPV9 953 aa27.58■■■□□ 2.01
KCNQ1-202ENST00000335475 DIP2BQ9P265 1576 aa27.58■■■□□ 2.01
KCNQ1-202ENST00000335475 USP32Q8NFA0 1604 aa27.58■■■□□ 2.01
KCNQ1-202ENST00000335475 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.57■■■□□ 2
KCNQ1-202ENST00000335475 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.57■■■□□ 2
KCNQ1-202ENST00000335475 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.57■■■□□ 2
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF521Q96K83 1311 aa27.57■■■□□ 2
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM132EQ6IEE7 984 aa27.55■■■□□ 2
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa27.54■■■□□ 2
KCNQ1-202ENST00000335475 ZFYVE9O95405 1425 aa27.54■■■□□ 2
KCNQ1-202ENST00000335475 TULP4Q9NRJ4 1543 aa27.53■■■□□ 2
KCNQ1-202ENST00000335475 EXOC6Q8TAG9 804 aa27.53■■■□□ 2
KCNQ1-202ENST00000335475 NSD3Q9BZ95 1437 aa27.52■■■□□ 2
KCNQ1-202ENST00000335475 ANP32EQ9BTT0 268 aa27.5■■□□□ 1.99
KCNQ1-202ENST00000335475 VGFO15240 615 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
KCNQ1-202ENST00000335475 IDI1Q13907 227 aa27.49■■□□□ 1.99
KCNQ1-202ENST00000335475 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.49■■□□□ 1.99
KCNQ1-202ENST00000335475 SHPRHQ149N8 1683 aa27.49■■□□□ 1.99
KCNQ1-202ENST00000335475 REREQ9P2R6 1566 aa27.49■■□□□ 1.99
KCNQ1-202ENST00000335475 MSH5O43196 834 aa27.48■■□□□ 1.99
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC52A1Q9NWF4 448 aa27.47■■□□□ 1.99
KCNQ1-202ENST00000335475 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
KCNQ1-202ENST00000335475 DUSP27Q5VZP5 1158 aa27.46■■□□□ 1.99
KCNQ1-202ENST00000335475 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.99
KCNQ1-202ENST00000335475 TSPOAP1O95153 1857 aa27.44■■□□□ 1.98
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa27.43■■□□□ 1.98
KCNQ1-202ENST00000335475 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
KCNQ1-202ENST00000335475 AGLP35573 1532 aa27.41■■□□□ 1.98
KCNQ1-202ENST00000335475 CCDC146Q8IYE0 955 aa27.41■■□□□ 1.98
KCNQ1-202ENST00000335475 GOLGA2Q08379 1002 aa27.4■■□□□ 1.98
KCNQ1-202ENST00000335475 PLIN1O60240 522 aa27.39■■□□□ 1.98
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms