RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa29.27■■■□□ 2.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRC7Q96NW7 1537 aa29.25■■■□□ 2.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIF1BO60333 1816 aa29.24■■■□□ 2.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 HDGFP51858 240 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP29.21■■■□□ 2.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC26A8Q96RN1 970 aa29.21■■■□□ 2.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 NWD1Q149M9 1564 aa29.21■■■□□ 2.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.2■■■□□ 2.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa29.18■■■□□ 2.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 FOXD1Q16676 465 aa29.17■■■□□ 2.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 MPHOSPH9Q99550 1183 aa29.17■■■□□ 2.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 DIP2AQ14689 1571 aa29.17■■■□□ 2.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa29.16■■■□□ 2.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 UBAP1LF5GYI3 381 aa29.15■■■□□ 2.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 BCANQ96GW7 911 aa29.15■■■□□ 2.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa29.15■■■□□ 2.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 ALKQ9UM73 1620 aa29.13■■■□□ 2.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa29.12■■■□□ 2.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCNA6P17658 529 aa29.11■■■□□ 2.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 TBX22Q9Y458 520 aa29.08■■■□□ 2.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.07■■■□□ 2.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPLO60437 1756 aa29.06■■■□□ 2.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM94Q12767 1356 aa29.04■■■□□ 2.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 PIK3R4Q99570 1358 aa29.02■■■□□ 2.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 TOM1O60784 492 aa29.02■■■□□ 2.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.01■■■□□ 2.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 IFT172Q9UG01 1749 aa28.98■■■□□ 2.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTPRUQ92729 1446 aa28.98■■■□□ 2.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa28.97■■■□□ 2.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 HRCP23327 699 aa28.97■■■□□ 2.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 PIP4K2BP78356 416 aa28.96■■■□□ 2.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 METP08581 1390 aa28.92■■■□□ 2.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 VGFO15240 615 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa28.88■■■□□ 2.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.88■■■□□ 2.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa28.86■■■□□ 2.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 RGL3Q3MIN7 710 aa28.86■■■□□ 2.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 MSH6P52701 1360 aa28.86■■■□□ 2.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 HSPA1LP34931 641 aa28.84■■■□□ 2.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa28.83■■■□□ 2.21
PTPRCAP-201ENST00000326294 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 PIK3C2GO75747 1445 aa28.78■■■□□ 2.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRAG1Q86YV5 1406 aa28.78■■■□□ 2.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa28.78■■■□□ 2.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYOM2P54296 1465 aa28.78■■■□□ 2.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTCH1Q13635 1447 aa28.77■■■□□ 2.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM135BQ49AJ0 1406 aa28.77■■■□□ 2.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 NRXN1Q9ULB1 1477 aa28.76■■■□□ 2.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa28.75■■■□□ 2.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 C14orf37Q86TY3 774 aa28.75■■■□□ 2.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 NALCNQ8IZF0 1738 aa28.74■■■□□ 2.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 DCCP43146 1447 aa28.71■■■□□ 2.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 C19orf44Q9H6X5 657 aa28.71■■■□□ 2.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 ROBO2Q9HCK4 1378 aa28.71■■■□□ 2.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa28.7■■■□□ 2.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 LAMC1P11047 1609 aa28.69■■■□□ 2.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLAIN2Q9P270 581 aa28.68■■■□□ 2.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 KNDC1Q76NI1 1749 aa28.67■■■□□ 2.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 CADPS2Q86UW7 1296 aa28.66■■■□□ 2.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 TECPR2O15040 1411 aa28.64■■■□□ 2.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATF3P18847 181 aa28.64■■■□□ 2.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 MST1RQ04912 1400 aa28.6■■■□□ 2.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 PHLPP1O60346 1717 aa28.6■■■□□ 2.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM132EQ6IEE7 984 aa28.59■■■□□ 2.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 CFAP70Q5T0N1 1121 aa28.57■■■□□ 2.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABCC11Q96J66 1382 aa28.57■■■□□ 2.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 DISP3Q9P2K9 1392 aa28.57■■■□□ 2.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 STK26Q9P289 416 aa28.55■■■□□ 2.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADGRB1O14514 1584 aa28.54■■■□□ 2.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.54■■■□□ 2.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa28.54■■■□□ 2.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 BRINP3Q76B58 766 aa28.51■■■□□ 2.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.51■■■□□ 2.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa28.5■■■□□ 2.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 NHSL1Q5SYE7 1610 aa28.5■■■□□ 2.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 STAC3Q96MF2 364 aa28.49■■■□□ 2.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 C1orf167Q5SNV9 1468 aa28.48■■■□□ 2.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 WAPLQ7Z5K2 1190 aa28.48■■■□□ 2.15
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