RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa27.17■■□□□ 1.94
PTX4-201ENST00000293922 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa27.15■■□□□ 1.94
PTX4-201ENST00000293922 TRIM52Q96A61 297 aa27.15■■□□□ 1.94
PTX4-201ENST00000293922 HDGFP51858 240 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.93
PTX4-201ENST00000293922 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.13■■□□□ 1.93
PTX4-201ENST00000293922 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
PTX4-201ENST00000293922 TOM1O60784 492 aa27.11■■□□□ 1.93
PTX4-201ENST00000293922 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP27.11■■□□□ 1.93
PTX4-201ENST00000293922 TRPM2O94759 1503 aa27.1■■□□□ 1.93
PTX4-201ENST00000293922 BCANQ96GW7 911 aa27.1■■□□□ 1.93
PTX4-201ENST00000293922 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
PTX4-201ENST00000293922 ALKQ9UM73 1620 aa27.1■■□□□ 1.93
PTX4-201ENST00000293922 KCNA6P17658 529 aa27.09■■□□□ 1.93
PTX4-201ENST00000293922 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
PTX4-201ENST00000293922 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
PTX4-201ENST00000293922 CLTCL1P53675 1640 aa27.07■■□□□ 1.92
PTX4-201ENST00000293922 PIP4K2BP78356 416 aa27.06■■□□□ 1.92
PTX4-201ENST00000293922 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.06■■□□□ 1.92
PTX4-201ENST00000293922 NWD1Q149M9 1564 aa27.05■■□□□ 1.92
PTX4-201ENST00000293922 HRCP23327 699 aa27.04■■□□□ 1.92
PTX4-201ENST00000293922 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa27.03■■□□□ 1.92
PTX4-201ENST00000293922 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
PTX4-201ENST00000293922 TBX22Q9Y458 520 aa27.03■■□□□ 1.92
PTX4-201ENST00000293922 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
PTX4-201ENST00000293922 TMEM94Q12767 1356 aa27.01■■□□□ 1.92
PTX4-201ENST00000293922 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
PTX4-201ENST00000293922 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
PTX4-201ENST00000293922 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
PTX4-201ENST00000293922 DIP2AQ14689 1571 aa26.97■■□□□ 1.91
PTX4-201ENST00000293922 FOXD1Q16676 465 aa26.97■■□□□ 1.91
PTX4-201ENST00000293922 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
PTX4-201ENST00000293922 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
PTX4-201ENST00000293922 HSPA1LP34931 641 aa26.95■■□□□ 1.9
PTX4-201ENST00000293922 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
PTX4-201ENST00000293922 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa26.95■■□□□ 1.9
PTX4-201ENST00000293922 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.94■■□□□ 1.9
PTX4-201ENST00000293922 PIK3R4Q99570 1358 aa26.93■■□□□ 1.9
PTX4-201ENST00000293922 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa26.93■■□□□ 1.9
PTX4-201ENST00000293922 KIF1BO60333 1816 aa26.93■■□□□ 1.9
PTX4-201ENST00000293922 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa26.92■■□□□ 1.9
PTX4-201ENST00000293922 PTPRUQ92729 1446 aa26.87■■□□□ 1.89
PTX4-201ENST00000293922 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa26.84■■□□□ 1.89
PTX4-201ENST00000293922 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.83■■□□□ 1.89
PTX4-201ENST00000293922 MSH6P52701 1360 aa26.83■■□□□ 1.89
PTX4-201ENST00000293922 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa26.83■■□□□ 1.89
PTX4-201ENST00000293922 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa26.83■■□□□ 1.89
PTX4-201ENST00000293922 METP08581 1390 aa26.82■■□□□ 1.88
PTX4-201ENST00000293922 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.82■■□□□ 1.88
PTX4-201ENST00000293922 FAM135BQ49AJ0 1406 aa26.81■■□□□ 1.88
PTX4-201ENST00000293922 VGFO15240 615 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
PTX4-201ENST00000293922 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
PTX4-201ENST00000293922 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.79■■□□□ 1.88
PTX4-201ENST00000293922 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
PTX4-201ENST00000293922 PPLO60437 1756 aa26.76■■□□□ 1.87
PTX4-201ENST00000293922 C14orf37Q86TY3 774 aa26.73■■□□□ 1.87
PTX4-201ENST00000293922 SLAIN2Q9P270 581 aa26.73■■□□□ 1.87
PTX4-201ENST00000293922 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa26.73■■□□□ 1.87
PTX4-201ENST00000293922 RGL3Q3MIN7 710 aa26.73■■□□□ 1.87
PTX4-201ENST00000293922 C19orf44Q9H6X5 657 aa26.73■■□□□ 1.87
PTX4-201ENST00000293922 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
PTX4-201ENST00000293922 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
PTX4-201ENST00000293922 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa26.68■■□□□ 1.86
PTX4-201ENST00000293922 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.67■■□□□ 1.86
PTX4-201ENST00000293922 CADPS2Q86UW7 1296 aa26.67■■□□□ 1.86
PTX4-201ENST00000293922 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
PTX4-201ENST00000293922 IFT172Q9UG01 1749 aa26.66■■□□□ 1.86
PTX4-201ENST00000293922 ATF3P18847 181 aa26.65■■□□□ 1.86
PTX4-201ENST00000293922 DCCP43146 1447 aa26.64■■□□□ 1.86
PTX4-201ENST00000293922 ILDR2Q71H61 639 aa26.64■■□□□ 1.85
PTX4-201ENST00000293922 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.85
PTX4-201ENST00000293922 PTCH1Q13635 1447 aa26.63■■□□□ 1.85
PTX4-201ENST00000293922 PRAG1Q86YV5 1406 aa26.63■■□□□ 1.85
PTX4-201ENST00000293922 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa26.61■■□□□ 1.85
PTX4-201ENST00000293922 ROBO2Q9HCK4 1378 aa26.61■■□□□ 1.85
PTX4-201ENST00000293922 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.6■■□□□ 1.85
PTX4-201ENST00000293922 PIK3C2GO75747 1445 aa26.59■■□□□ 1.85
PTX4-201ENST00000293922 NALCNQ8IZF0 1738 aa26.57■■□□□ 1.84
PTX4-201ENST00000293922 MST1RQ04912 1400 aa26.55■■□□□ 1.84
PTX4-201ENST00000293922 NRXN1Q9ULB1 1477 aa26.54■■□□□ 1.84
PTX4-201ENST00000293922 PHLPP1O60346 1717 aa26.54■■□□□ 1.84
PTX4-201ENST00000293922 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa26.53■■□□□ 1.84
PTX4-201ENST00000293922 BRINP3Q76B58 766 aa26.53■■□□□ 1.84
PTX4-201ENST00000293922 MYOM2P54296 1465 aa26.53■■□□□ 1.84
PTX4-201ENST00000293922 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
PTX4-201ENST00000293922 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
PTX4-201ENST00000293922 TMEM132EQ6IEE7 984 aa26.5■■□□□ 1.83
PTX4-201ENST00000293922 TECPR2O15040 1411 aa26.5■■□□□ 1.83
PTX4-201ENST00000293922 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
PTX4-201ENST00000293922 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
PTX4-201ENST00000293922 STK26Q9P289 416 aa26.48■■□□□ 1.83
PTX4-201ENST00000293922 ABCC11Q96J66 1382 aa26.47■■□□□ 1.83
PTX4-201ENST00000293922 JCADQ9P266 1359 aa26.47■■□□□ 1.83
PTX4-201ENST00000293922 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
PTX4-201ENST00000293922 CFAP70Q5T0N1 1121 aa26.45■■□□□ 1.82
PTX4-201ENST00000293922 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
PTX4-201ENST00000293922 C1orf167Q5SNV9 1468 aa26.44■■□□□ 1.82
PTX4-201ENST00000293922 WAPLQ7Z5K2 1190 aa26.42■■□□□ 1.82
PTX4-201ENST00000293922 KNDC1Q76NI1 1749 aa26.42■■□□□ 1.82
PTX4-201ENST00000293922 LAMC1P11047 1609 aa26.41■■□□□ 1.82
PTX4-201ENST00000293922 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa26.4■■□□□ 1.82
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