RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288390.2

SPATS1-201, Transcript of spermatogenesis associated serine rich 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPATS1, Length 1,354 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATS1-201ENST00000288390 RIMS2Q9UQ26 1411 aa23.34■■□□□ 1.33
SPATS1-201ENST00000288390 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
SPATS1-201ENST00000288390 STRCP1A6NGW2 1772 aa23.27■■□□□ 1.32
SPATS1-201ENST00000288390 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.31
SPATS1-201ENST00000288390 KIF1BO60333 1816 aa23.26■■□□□ 1.31
SPATS1-201ENST00000288390 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa23.25■■□□□ 1.31
SPATS1-201ENST00000288390 SLC26A8Q96RN1 970 aa23.25■■□□□ 1.31
SPATS1-201ENST00000288390 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP23.24■■□□□ 1.31
SPATS1-201ENST00000288390 HDGFP51858 240 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
SPATS1-201ENST00000288390 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa23.22■■□□□ 1.31
SPATS1-201ENST00000288390 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
SPATS1-201ENST00000288390 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
SPATS1-201ENST00000288390 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
SPATS1-201ENST00000288390 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.2■■□□□ 1.3
SPATS1-201ENST00000288390 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa23.2■■□□□ 1.3
SPATS1-201ENST00000288390 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.19■■□□□ 1.3
SPATS1-201ENST00000288390 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.19■■□□□ 1.3
SPATS1-201ENST00000288390 FBXO41Q8TF61 875 aa23.18■■□□□ 1.3
SPATS1-201ENST00000288390 CPS1P31327 1500 aa23.18■■□□□ 1.3
SPATS1-201ENST00000288390 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
SPATS1-201ENST00000288390 BCANQ96GW7 911 aa23.17■■□□□ 1.3
SPATS1-201ENST00000288390 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa23.16■■□□□ 1.3
SPATS1-201ENST00000288390 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.16■■□□□ 1.3
SPATS1-201ENST00000288390 TBX22Q9Y458 520 aa23.15■■□□□ 1.3
SPATS1-201ENST00000288390 LRRC7Q96NW7 1537 aa23.14■■□□□ 1.3
SPATS1-201ENST00000288390 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa23.13■■□□□ 1.29
SPATS1-201ENST00000288390 KCNA6P17658 529 aa23.13■■□□□ 1.29
SPATS1-201ENST00000288390 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa23.12■■□□□ 1.29
SPATS1-201ENST00000288390 PPLO60437 1756 aa23.12■■□□□ 1.29
SPATS1-201ENST00000288390 RGL3Q3MIN7 710 aa23.12■■□□□ 1.29
SPATS1-201ENST00000288390 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
SPATS1-201ENST00000288390 NWD1Q149M9 1564 aa23.09■■□□□ 1.29
SPATS1-201ENST00000288390 DIP2AQ14689 1571 aa23.08■■□□□ 1.29
SPATS1-201ENST00000288390 VGFO15240 615 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
SPATS1-201ENST00000288390 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
SPATS1-201ENST00000288390 PTPRUQ92729 1446 aa23.06■■□□□ 1.28
SPATS1-201ENST00000288390 IFT172Q9UG01 1749 aa23.06■■□□□ 1.28
SPATS1-201ENST00000288390 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa23.06■■□□□ 1.28
SPATS1-201ENST00000288390 METP08581 1390 aa23.05■■□□□ 1.28
SPATS1-201ENST00000288390 PIK3R4Q99570 1358 aa23.04■■□□□ 1.28
SPATS1-201ENST00000288390 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
SPATS1-201ENST00000288390 ALKQ9UM73 1620 aa23.02■■□□□ 1.28
SPATS1-201ENST00000288390 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
SPATS1-201ENST00000288390 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
SPATS1-201ENST00000288390 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
SPATS1-201ENST00000288390 TMEM94Q12767 1356 aa23.01■■□□□ 1.27
SPATS1-201ENST00000288390 UBAP1LF5GYI3 381 aa23.01■■□□□ 1.27
SPATS1-201ENST00000288390 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa23■■□□□ 1.27
SPATS1-201ENST00000288390 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SPATS1-201ENST00000288390 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SPATS1-201ENST00000288390 PIK3C2GO75747 1445 aa22.95■■□□□ 1.26
SPATS1-201ENST00000288390 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.95■■□□□ 1.26
SPATS1-201ENST00000288390 MYOM2P54296 1465 aa22.93■■□□□ 1.26
SPATS1-201ENST00000288390 TOM1O60784 492 aa22.91■■□□□ 1.26
SPATS1-201ENST00000288390 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.9■■□□□ 1.26
SPATS1-201ENST00000288390 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.89■■□□□ 1.26
SPATS1-201ENST00000288390 PIP4K2BP78356 416 aa22.89■■□□□ 1.25
SPATS1-201ENST00000288390 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.89■■□□□ 1.25
SPATS1-201ENST00000288390 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
SPATS1-201ENST00000288390 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.88■■□□□ 1.25
SPATS1-201ENST00000288390 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.87■■□□□ 1.25
SPATS1-201ENST00000288390 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.87■■□□□ 1.25
SPATS1-201ENST00000288390 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.87■■□□□ 1.25
SPATS1-201ENST00000288390 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.86■■□□□ 1.25
SPATS1-201ENST00000288390 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.86■■□□□ 1.25
SPATS1-201ENST00000288390 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.84■■□□□ 1.25
SPATS1-201ENST00000288390 MSH6P52701 1360 aa22.83■■□□□ 1.25
SPATS1-201ENST00000288390 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SPATS1-201ENST00000288390 PTCH1Q13635 1447 aa22.82■■□□□ 1.24
SPATS1-201ENST00000288390 C19orf44Q9H6X5 657 aa22.82■■□□□ 1.24
SPATS1-201ENST00000288390 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SPATS1-201ENST00000288390 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
SPATS1-201ENST00000288390 C14orf37Q86TY3 774 aa22.8■■□□□ 1.24
SPATS1-201ENST00000288390 STAC3Q96MF2 364 aa22.8■■□□□ 1.24
SPATS1-201ENST00000288390 STK26Q9P289 416 aa22.8■■□□□ 1.24
SPATS1-201ENST00000288390 ABCC11Q96J66 1382 aa22.79■■□□□ 1.24
SPATS1-201ENST00000288390 NEUROD1Q13562 356 aa22.79■■□□□ 1.24
SPATS1-201ENST00000288390 TECPR2O15040 1411 aa22.79■■□□□ 1.24
SPATS1-201ENST00000288390 LAMC1P11047 1609 aa22.79■■□□□ 1.24
SPATS1-201ENST00000288390 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.78■■□□□ 1.24
SPATS1-201ENST00000288390 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
SPATS1-201ENST00000288390 ADGRB1O14514 1584 aa22.77■■□□□ 1.24
SPATS1-201ENST00000288390 HSPA1LP34931 641 aa22.77■■□□□ 1.24
SPATS1-201ENST00000288390 SLAIN2Q9P270 581 aa22.77■■□□□ 1.24
SPATS1-201ENST00000288390 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.76■■□□□ 1.23
SPATS1-201ENST00000288390 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.76■■□□□ 1.23
SPATS1-201ENST00000288390 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.75■■□□□ 1.23
SPATS1-201ENST00000288390 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.75■■□□□ 1.23
SPATS1-201ENST00000288390 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.75■■□□□ 1.23
SPATS1-201ENST00000288390 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.74■■□□□ 1.23
SPATS1-201ENST00000288390 ATF3P18847 181 aa22.73■■□□□ 1.23
SPATS1-201ENST00000288390 CADPS2Q86UW7 1296 aa22.73■■□□□ 1.23
SPATS1-201ENST00000288390 DCCP43146 1447 aa22.72■■□□□ 1.23
SPATS1-201ENST00000288390 SIRT1Q96EB6 747 aa22.71■■□□□ 1.23
SPATS1-201ENST00000288390 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa22.71■■□□□ 1.23
SPATS1-201ENST00000288390 MST1RQ04912 1400 aa22.69■■□□□ 1.22
SPATS1-201ENST00000288390 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.67■■□□□ 1.22
SPATS1-201ENST00000288390 DLC1Q96QB1 1528 aa22.66■■□□□ 1.22
SPATS1-201ENST00000288390 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.66■■□□□ 1.22
SPATS1-201ENST00000288390 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms