RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000274605.5

N4BP3-201, Transcript of NEDD4 binding protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene N4BP3, Length 6,080 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP3-201ENST00000274605 PSME1Q06323 249 aa22.05■■□□□ 1.12
N4BP3-201ENST00000274605 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
N4BP3-201ENST00000274605 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
N4BP3-201ENST00000274605 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
N4BP3-201ENST00000274605 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
N4BP3-201ENST00000274605 RAD21O60216 631 aa22.02■■□□□ 1.12
N4BP3-201ENST00000274605 HMOX1P09601 288 aa22.02■■□□□ 1.12
N4BP3-201ENST00000274605 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.02■■□□□ 1.12
N4BP3-201ENST00000274605 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
N4BP3-201ENST00000274605 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
N4BP3-201ENST00000274605 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
N4BP3-201ENST00000274605 ANO2Q9NQ90 1003 aa22■■□□□ 1.11
N4BP3-201ENST00000274605 TPM3P06753 285 aa22■■□□□ 1.11
N4BP3-201ENST00000274605 PRM3Q9NNZ6 103 aa21.99■■□□□ 1.11
N4BP3-201ENST00000274605 APPP05067 770 aa21.99■■□□□ 1.11
N4BP3-201ENST00000274605 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa21.99■■□□□ 1.11
N4BP3-201ENST00000274605 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
N4BP3-201ENST00000274605 RUNDC1Q96C34 613 aa21.97■■□□□ 1.11
N4BP3-201ENST00000274605 NUTM2GQ5VZR2 741 aa21.97■■□□□ 1.11
N4BP3-201ENST00000274605 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.97■■□□□ 1.11
N4BP3-201ENST00000274605 RUFY2Q8WXA3 655 aa21.97■■□□□ 1.11
N4BP3-201ENST00000274605 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa21.96■■□□□ 1.11
N4BP3-201ENST00000274605 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa21.96■■□□□ 1.11
N4BP3-201ENST00000274605 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
N4BP3-201ENST00000274605 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa21.96■■□□□ 1.11
N4BP3-201ENST00000274605 GGNBP2Q9H3C7 697 aa21.96■■□□□ 1.11
N4BP3-201ENST00000274605 TSPYL4Q9UJ04 414 aa21.96■■□□□ 1.11
N4BP3-201ENST00000274605 OSCARQ8IYS5 282 aa21.96■■□□□ 1.11
N4BP3-201ENST00000274605 CABP2Q9NPB3 220 aa21.96■■□□□ 1.11
N4BP3-201ENST00000274605 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.95■■□□□ 1.1
N4BP3-201ENST00000274605 BECN2A8MW95 431 aa21.95■■□□□ 1.1
N4BP3-201ENST00000274605 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.95■■□□□ 1.1
N4BP3-201ENST00000274605 CEP89Q96ST8 783 aa21.94■■□□□ 1.1
N4BP3-201ENST00000274605 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.94■■□□□ 1.1
N4BP3-201ENST00000274605 REC8O95072 547 aa21.94■■□□□ 1.1
N4BP3-201ENST00000274605 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
N4BP3-201ENST00000274605 PRDM2Q13029 1718 aa21.94■■□□□ 1.1
N4BP3-201ENST00000274605 KIF7Q2M1P5 1343 aa21.94■■□□□ 1.1
N4BP3-201ENST00000274605 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.93■■□□□ 1.1
N4BP3-201ENST00000274605 TMEM132EQ6IEE7 984 aa21.93■■□□□ 1.1
N4BP3-201ENST00000274605 DDX58O95786 925 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
N4BP3-201ENST00000274605 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP21.93■■□□□ 1.1
N4BP3-201ENST00000274605 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
N4BP3-201ENST00000274605 FBXW7Q969H0 707 aa21.93■■□□□ 1.1
N4BP3-201ENST00000274605 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
N4BP3-201ENST00000274605 VPS37DQ86XT2 251 aa21.92■■□□□ 1.1
N4BP3-201ENST00000274605 IGF1RP08069 1367 aa21.91■■□□□ 1.1
N4BP3-201ENST00000274605 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
N4BP3-201ENST00000274605 LNPKQ9C0E8 428 aa21.91■■□□□ 1.1
N4BP3-201ENST00000274605 TRIM29Q14134 588 aa21.91■■□□□ 1.1
N4BP3-201ENST00000274605 FOSBP53539 338 aa21.9■■□□□ 1.1
N4BP3-201ENST00000274605 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
N4BP3-201ENST00000274605 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
N4BP3-201ENST00000274605 CCDC7Q96M83 1385 aa21.9■■□□□ 1.1
N4BP3-201ENST00000274605 AMOTL1Q8IY63 956 aa21.9■■□□□ 1.1
N4BP3-201ENST00000274605 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.9■■□□□ 1.1
N4BP3-201ENST00000274605 TRIM34Q9BYJ4 488 aa21.9■■□□□ 1.1
N4BP3-201ENST00000274605 GSE1Q14687 1217 aa21.9■■□□□ 1.1
N4BP3-201ENST00000274605 PANK1Q8TE04 598 aa21.9■■□□□ 1.1
N4BP3-201ENST00000274605 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
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N4BP3-201ENST00000274605 CPLX1O14810 134 aa21.89■■□□□ 1.09
N4BP3-201ENST00000274605 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
N4BP3-201ENST00000274605 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP21.89■■□□□ 1.09
N4BP3-201ENST00000274605 GNAI1P63096 354 aa21.88■■□□□ 1.09
N4BP3-201ENST00000274605 USP35Q9P2H5 1018 aa21.88■■□□□ 1.09
N4BP3-201ENST00000274605 WWC1Q8IX03 1113 aa21.88■■□□□ 1.09
N4BP3-201ENST00000274605 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
N4BP3-201ENST00000274605 ROCK1Q13464 1354 aa21.87■■□□□ 1.09
N4BP3-201ENST00000274605 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
N4BP3-201ENST00000274605 NFXL1Q6ZNB6 911 aa21.86■■□□□ 1.09
N4BP3-201ENST00000274605 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa21.85■■□□□ 1.09
N4BP3-201ENST00000274605 RIC3Q7Z5B4 369 aa21.85■■□□□ 1.09
N4BP3-201ENST00000274605 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
N4BP3-201ENST00000274605 TPM2P07951 284 aa21.85■■□□□ 1.09
N4BP3-201ENST00000274605 TRDNQ13061 729 aa21.84■■□□□ 1.09
N4BP3-201ENST00000274605 ZNF592Q92610 1267 aa21.84■■□□□ 1.09
N4BP3-201ENST00000274605 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
N4BP3-201ENST00000274605 BICD2Q8TD16 824 aa21.84■■□□□ 1.09
N4BP3-201ENST00000274605 NLRP2Q9NX02 1062 aa21.84■■□□□ 1.09
N4BP3-201ENST00000274605 NEUROD6Q96NK8 337 aa21.84■■□□□ 1.09
N4BP3-201ENST00000274605 RNF20Q5VTR2 975 aa21.83■■□□□ 1.09
N4BP3-201ENST00000274605 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
N4BP3-201ENST00000274605 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
N4BP3-201ENST00000274605 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa21.83■■□□□ 1.09
N4BP3-201ENST00000274605 TPM1P09493 284 aa21.83■■□□□ 1.08
N4BP3-201ENST00000274605 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
N4BP3-201ENST00000274605 ATF3P18847 181 aa21.82■■□□□ 1.08
N4BP3-201ENST00000274605 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.82■■□□□ 1.081e-6■■■■■ 30.9
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N4BP3-201ENST00000274605 CUX1P39880 1505 aa21.82■■□□□ 1.08
N4BP3-201ENST00000274605 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21.81■■□□□ 1.08
N4BP3-201ENST00000274605 SMC3Q9UQE7 1217 aa21.8■■□□□ 1.08
N4BP3-201ENST00000274605 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.8■■□□□ 1.08
N4BP3-201ENST00000274605 MTHFSP49914 203 aa21.8■■□□□ 1.08
N4BP3-201ENST00000274605 NLRP6P59044 892 aa21.8■■□□□ 1.08
N4BP3-201ENST00000274605 CHMP5Q9NZZ3 219 aa21.79■■□□□ 1.08
N4BP3-201ENST00000274605 FYB1O15117 783 aa21.79■■□□□ 1.08
N4BP3-201ENST00000274605 MIA2Q96PC5 1412 aa21.78■■□□□ 1.08
N4BP3-201ENST00000274605 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
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