RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263434.5

PTPRH-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type H, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRH, Length 3,343 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRH-201ENST00000263434 USP35Q9P2H5 1018 aa19.96■□□□□ 0.79
PTPRH-201ENST00000263434 C8orf34Q49A92 452 aa19.96■□□□□ 0.79
PTPRH-201ENST00000263434 SLFN5Q08AF3 891 aa19.94■□□□□ 0.78
PTPRH-201ENST00000263434 ARHGEF5Q12774 1597 aa19.94■□□□□ 0.78
PTPRH-201ENST00000263434 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
PTPRH-201ENST00000263434 PANK1Q8TE04 598 aa19.94■□□□□ 0.78
PTPRH-201ENST00000263434 COG6Q9Y2V7 657 aa19.94■□□□□ 0.78
PTPRH-201ENST00000263434 GSE1Q14687 1217 aa19.93■□□□□ 0.78
PTPRH-201ENST00000263434 CFAP70Q5T0N1 1121 aa19.93■□□□□ 0.78
PTPRH-201ENST00000263434 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
PTPRH-201ENST00000263434 BCL2L13Q9BXK5 485 aa19.92■□□□□ 0.78
PTPRH-201ENST00000263434 IGHDP01880 384 aa19.91■□□□□ 0.78
PTPRH-201ENST00000263434 ARXQ96QS3 562 aa19.91■□□□□ 0.78
PTPRH-201ENST00000263434 TTC37Q6PGP7 1564 aa19.91■□□□□ 0.78
PTPRH-201ENST00000263434 CDCA8Q53HL2 280 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRH-201ENST00000263434 WDR7Q9Y4E6 1490 aa19.89■□□□□ 0.78
PTPRH-201ENST00000263434 MYO5CQ9NQX4 1742 aa19.89■□□□□ 0.78
PTPRH-201ENST00000263434 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRH-201ENST00000263434 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
PTPRH-201ENST00000263434 CLUAP1Q96AJ1 413 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRH-201ENST00000263434 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
PTPRH-201ENST00000263434 PREX2Q70Z35 1606 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRH-201ENST00000263434 KIF3BO15066 747 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRH-201ENST00000263434 ZNF521Q96K83 1311 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRH-201ENST00000263434 SEC24BO95487 1268 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRH-201ENST00000263434 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP19.85■□□□□ 0.77
PTPRH-201ENST00000263434 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRH-201ENST00000263434 TNNQ9UQP3 1299 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRH-201ENST00000263434 CARD14Q9BXL6 1004 aa19.84■□□□□ 0.77
PTPRH-201ENST00000263434 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa19.83■□□□□ 0.77
PTPRH-201ENST00000263434 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
PTPRH-201ENST00000263434 E9PSI1 815 aa19.81■□□□□ 0.76
PTPRH-201ENST00000263434 TRAK1Q9UPV9 953 aa19.81■□□□□ 0.76
PTPRH-201ENST00000263434 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
PTPRH-201ENST00000263434 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
PTPRH-201ENST00000263434 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa19.8■□□□□ 0.76
PTPRH-201ENST00000263434 UNC13BO14795 1591 aa19.8■□□□□ 0.76
PTPRH-201ENST00000263434 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRH-201ENST00000263434 MORC1Q86VD1 984 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRH-201ENST00000263434 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
PTPRH-201ENST00000263434 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
PTPRH-201ENST00000263434 DUOX2Q9NRD8 1548 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRH-201ENST00000263434 ERCC6L2Q5T890 1561 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRH-201ENST00000263434 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
PTPRH-201ENST00000263434 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRH-201ENST00000263434 WWC1Q8IX03 1113 aa19.77■□□□□ 0.75
PTPRH-201ENST00000263434 IQGAP3Q86VI3 1631 aa19.77■□□□□ 0.75
PTPRH-201ENST00000263434 MAST1Q9Y2H9 1570 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRH-201ENST00000263434 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP19.76■□□□□ 0.75
PTPRH-201ENST00000263434 TMEM132EQ6IEE7 984 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRH-201ENST00000263434 INSRP06213 1382 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRH-201ENST00000263434 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
PTPRH-201ENST00000263434 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
PTPRH-201ENST00000263434 TCP11L2Q8N4U5 519 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRH-201ENST00000263434 RLBP1P12271 317 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRH-201ENST00000263434 POGKQ9P215 609 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRH-201ENST00000263434 CGNL1Q0VF96 1302 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRH-201ENST00000263434 PIK3C2GO75747 1445 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRH-201ENST00000263434 ATP10AO60312 1499 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRH-201ENST00000263434 UGGT1Q9NYU2 1555 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRH-201ENST00000263434 LAMC1P11047 1609 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRH-201ENST00000263434 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRH-201ENST00000263434 MADDQ8WXG6 1647 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRH-201ENST00000263434 KANK1Q14678 1352 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRH-201ENST00000263434 PLCH2O75038 1416 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRH-201ENST00000263434 MTHFSP49914 203 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRH-201ENST00000263434 USP19O94966 1318 aa19.68■□□□□ 0.74
PTPRH-201ENST00000263434 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP19.68■□□□□ 0.74
PTPRH-201ENST00000263434 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP19.68■□□□□ 0.74
PTPRH-201ENST00000263434 PDE3AQ14432 1141 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRH-201ENST00000263434 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRH-201ENST00000263434 SCAPERQ9BY12 1400 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRH-201ENST00000263434 RARSP54136 660 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
PTPRH-201ENST00000263434 BECN1Q14457 450 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRH-201ENST00000263434 PLXNC1O60486 1568 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRH-201ENST00000263434 GGT6Q6P531 493 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRH-201ENST00000263434 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
PTPRH-201ENST00000263434 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
PTPRH-201ENST00000263434 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
PTPRH-201ENST00000263434 NSD3Q9BZ95 1437 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRH-201ENST00000263434 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
PTPRH-201ENST00000263434 SYNMO15061 1565 aa19.65■□□□□ 0.74
PTPRH-201ENST00000263434 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
PTPRH-201ENST00000263434 CLTCL1P53675 1640 aa19.64■□□□□ 0.74
PTPRH-201ENST00000263434 RUNDC1Q96C34 613 aa19.64■□□□□ 0.73
PTPRH-201ENST00000263434 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa19.63■□□□□ 0.73
PTPRH-201ENST00000263434 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
PTPRH-201ENST00000263434 IQGAP1P46940 1657 aa19.63■□□□□ 0.73
PTPRH-201ENST00000263434 ERVK-7P63135 1459 aa19.63■□□□□ 0.73
PTPRH-201ENST00000263434 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
PTPRH-201ENST00000263434 ABCC2Q92887 1545 aa19.61■□□□□ 0.73
PTPRH-201ENST00000263434 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
PTPRH-201ENST00000263434 CHD1O14646 1710 aa19.61■□□□□ 0.73
PTPRH-201ENST00000263434 STK26Q9P289 416 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRH-201ENST00000263434 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
PTPRH-201ENST00000263434 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRH-201ENST00000263434 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
PTPRH-201ENST00000263434 CFAP53Q96M91 514 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRH-201ENST00000263434 MYOM1P52179 1685 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRH-201ENST00000263434 CABP2Q9NPB3 220 aa19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms