RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000172142.7

Nisch-222, Transcript of Nischarin, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nisch, Length 2,780 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nisch-222ENSMUST00000172142 AI481877A2ALV5 1481 aa29,87■■■□□ 2,37
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Nisch-222ENSMUST00000172142 Chmp5Q9D7S9 219 aa29,83■■■□□ 2,37
Nisch-222ENSMUST00000172142 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP29,83■■■□□ 2,37
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Nisch-222ENSMUST00000172142 Plekhh1Q80TI1 1356 aa29,82■■■□□ 2,36
Nisch-222ENSMUST00000172142 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa29,82■■■□□ 2,36
Nisch-222ENSMUST00000172142 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa29,81■■■□□ 2,36
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gtf3c3Q3TMP1 882 aa29,81■■■□□ 2,36
Nisch-222ENSMUST00000172142 Rnf17Q99MV7 1640 aa29,81■■■□□ 2,36
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Nisch-222ENSMUST00000172142 Kdm2aP59997 1161 aa29,8■■■□□ 2,36
Nisch-222ENSMUST00000172142 Fam184bQ0KK56 942 aa29,8■■■□□ 2,36
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm32742A0A1B0GT42 1604 aa29,8■■■□□ 2,36
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Nisch-222ENSMUST00000172142 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa29,8■■■□□ 2,36
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Nisch-222ENSMUST00000172142 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa29,76■■■□□ 2,35
Nisch-222ENSMUST00000172142 Adgrl3Q80TS3 1537 aa29,76■■■□□ 2,35
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Nisch-222ENSMUST00000172142 Atf7ipQ7TT18 1306 aa29,73■■■□□ 2,35
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Nisch-222ENSMUST00000172142 Neurod2Q62414 383 aa29,7■■■□□ 2,35
Nisch-222ENSMUST00000172142 Neurl4Q5NCX5 1563 aa29,7■■■□□ 2,35
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Nisch-222ENSMUST00000172142 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP29,7■■■□□ 2,35
Nisch-222ENSMUST00000172142 Col17a1Q07563 1470 aa29,69■■■□□ 2,34
Nisch-222ENSMUST00000172142 Cfap74Q3UY96 1578 aa29,68■■■□□ 2,34
Nisch-222ENSMUST00000172142 Cdc42bpbQ7TT50 1713 aa29,67■■■□□ 2,34
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Nisch-222ENSMUST00000172142 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa29,67■■■□□ 2,34
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ccdc30Q8BVF4 654 aa29,66■■■□□ 2,34
Nisch-222ENSMUST00000172142 Smc5Q8CG46 1101 aaKnown RBP29,66■■■□□ 2,34
Nisch-222ENSMUST00000172142 Kidins220E9Q9B7 1793 aa29,66■■■□□ 2,34
Nisch-222ENSMUST00000172142 Zfyve16Q80U44 1528 aa29,66■■■□□ 2,34
Nisch-222ENSMUST00000172142 Nsd2Q8BVE8 1365 aa29,65■■■□□ 2,34
Nisch-222ENSMUST00000172142 Tulp4Q9JIL5 1547 aa29,64■■■□□ 2,33
Nisch-222ENSMUST00000172142 Kif7B7ZNG0 1348 aa29,63■■■□□ 2,33
Nisch-222ENSMUST00000172142 Zmym3Q9JLM4 1370 aa29,63■■■□□ 2,33
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm20521D3Z5F7 333 aa29,62■■■□□ 2,33
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Nisch-222ENSMUST00000172142 Abcc6Q9R1S7 1498 aa29,52■■■□□ 2,32
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Nisch-222ENSMUST00000172142 Usp19Q3UJD6 1360 aa29,5■■■□□ 2,31
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Nisch-222ENSMUST00000172142 4930567H17RikQ3V0K5 233 aa29,49■■■□□ 2,31
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Nisch-222ENSMUST00000172142 Eif2s2Q99L45 331 aaKnown RBP29,49■■■□□ 2,31
Nisch-222ENSMUST00000172142 AnkarA2RT91 1465 aa29,49■■■□□ 2,31
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ralbp1Q62172 648 aa29,48■■■□□ 2,31
Nisch-222ENSMUST00000172142 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa29,47■■■□□ 2,31
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Nisch-222ENSMUST00000172142 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP29,47■■■□□ 2,31
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Nisch-222ENSMUST00000172142 Stk24Q99KH8 431 aa29,41■■■□□ 2,3
Nisch-222ENSMUST00000172142 Fan1Q69ZT1 1020 aa29,41■■■□□ 2,3
Nisch-222ENSMUST00000172142 Pank1Q8K4K6 548 aa29,41■■■□□ 2,3
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP29,4■■■□□ 2,3
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Nisch-222ENSMUST00000172142 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa29,39■■■□□ 2,3
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Nisch-222ENSMUST00000172142 Lemd3Q9WU40 921 aa29,37■■■□□ 2,29
Nisch-222ENSMUST00000172142 Tmc1Q8R4P5 757 aa29,36■■■□□ 2,29
Nisch-222ENSMUST00000172142 Xrn1P97789 1719 aaKnown RBP29,36■■■□□ 2,29
Nisch-222ENSMUST00000172142 Trim58Q5NCC9 485 aa29,35■■■□□ 2,29
Nisch-222ENSMUST00000172142 Uggt2E9Q4X2 1504 aa29,34■■■□□ 2,29
Nisch-222ENSMUST00000172142 ErbinQ80TH2 1402 aa29,34■■■□□ 2,29
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gas2l2Q5SSG4 860 aa29,34■■■□□ 2,29
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