RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000092167.6

Ptprb-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprb, Length 11,911 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Zscan10Q3URR7 782 aa11.33□□□□□ -0.6
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Cux1P53564 1515 aa11.33□□□□□ -0.6
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Gabpb2P81069 414 aa11.33□□□□□ -0.6
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Bicd2Q921C5 820 aa11.32□□□□□ -0.6
Ptprb-201ENSMUST00000092167 WrnO09053 1401 aa11.32□□□□□ -0.6
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Ciz1Q8VEH2 845 aa11.32□□□□□ -0.6
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Gm21190A0A0G2JGJ6 266 aa11.32□□□□□ -0.6
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Bcl2l13P59017 434 aa11.32□□□□□ -0.6
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Kri1Q8VDQ9 704 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Ccdc30Q8BVF4 654 aa11.32□□□□□ -0.6
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Mad1l1Q9WTX8 717 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Usp16Q99LG0 825 aa11.32□□□□□ -0.6
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Dixdc1Q80Y83 711 aa11.31□□□□□ -0.6
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Q9D2X8 372 aa11.31□□□□□ -0.6
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Noc3lQ8VI84 807 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Hdgfl1Q2VPR5 283 aa11.31□□□□□ -0.6
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Hnrnpul1Q8VDM6 859 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Gripap1Q8VD04 806 aa11.31□□□□□ -0.6
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Kif16bB1AVY7 1312 aa11.3□□□□□ -0.6
Ptprb-201ENSMUST00000092167 KinQ8K339 391 aa11.3□□□□□ -0.6
Ptprb-201ENSMUST00000092167 HdgfP51859 237 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Fnbp4Q6ZQ03 1031 aa11.3□□□□□ -0.6
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Ric3Q8BPM6 367 aa11.3□□□□□ -0.6
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Trim58Q5NCC9 485 aa11.3□□□□□ -0.6
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Plcd4Q8K3R3 807 aa11.3□□□□□ -0.6
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Zfp644E9QA22 1323 aa11.3□□□□□ -0.6
Ptprb-201ENSMUST00000092167 PogkQ80TC5 607 aa11.3□□□□□ -0.6
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Stard8Q8K031 1019 aa11.3□□□□□ -0.6
Ptprb-201ENSMUST00000092167 BcanQ61361 883 aa11.29□□□□□ -0.6
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Rabep1O35551 862 aa11.29□□□□□ -0.6
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Ftsj3Q9DBE9 838 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Tpm4Q6IRU2 248 aa11.29□□□□□ -0.6
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Tdrd9Q14BI7 1383 aa11.29□□□□□ -0.6
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Kif4P33174 1231 aa11.29□□□□□ -0.6
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Stk3Q9JI10 497 aa11.29□□□□□ -0.6
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Ddx11Q6AXC6 880 aa11.29□□□□□ -0.6
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Ipo4Q8VI75 1082 aa11.29□□□□□ -0.6
Ptprb-201ENSMUST00000092167 4933402E13RikQ9D4D2 429 aa11.29□□□□□ -0.6
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Rnf214Q8BFU3 668 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Rec8Q8C5S7 591 aa11.28□□□□□ -0.6
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Dhx16G3X8X0 1044 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.6
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Ralbp1Q62172 648 aa11.27□□□□□ -0.6
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Znf704Q9ERQ3 566 aa11.27□□□□□ -0.61
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Tpm1P58771 284 aa11.27□□□□□ -0.61
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Usp48Q3V0C5 1052 aa11.27□□□□□ -0.61
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Pknox2Q8BG99 474 aa11.27□□□□□ -0.61
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Kcnh8P59111 1102 aa11.27□□□□□ -0.61
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Smc3Q9CW03 1217 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Cplx1P63040 134 aa11.26□□□□□ -0.61
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Nek4Q9Z1J2 792 aa11.26□□□□□ -0.61
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Chrna2Q91X60 512 aa11.26□□□□□ -0.61
Ptprb-201ENSMUST00000092167 ErbinQ80TH2 1402 aa11.26□□□□□ -0.61
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Babam1Q3UI43 333 aa11.26□□□□□ -0.61
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Ccp110Q7TSH4 1004 aa11.26□□□□□ -0.61
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Ppm1fQ8CGA0 452 aa11.26□□□□□ -0.61
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Ccdc183A2AJB1 534 aa11.26□□□□□ -0.61
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Shroom4Q1W617 1475 aa11.26□□□□□ -0.61
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Prm3Q62100 101 aa11.25□□□□□ -0.61
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Rbm25B2RY56 838 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Taf3Q5HZG4 932 aa11.25□□□□□ -0.61
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Ttll13A4Q9F6 804 aa11.25□□□□□ -0.61
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Tpm2P58774 284 aa11.25□□□□□ -0.61
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Pnmal2G3X9N3 661 aa11.24□□□□□ -0.61
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Chmp7Q8R1T1 451 aa11.24□□□□□ -0.61
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa11.24□□□□□ -0.61
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Q7TT23 1179 aa11.24□□□□□ -0.61
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Q8C5K5 320 aa11.24□□□□□ -0.61
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Map7d2A2AG50 781 aa11.24□□□□□ -0.61
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Znf710Q3U288 666 aa11.24□□□□□ -0.61
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Plekhh1Q80TI1 1356 aa11.23□□□□□ -0.61
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Ncoa2Q61026 1462 aa11.23□□□□□ -0.61
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa11.23□□□□□ -0.61
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Gpatch3Q8BIY1 525 aa11.23□□□□□ -0.61
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Ccdc43Q9CR29 222 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Srek1Q8BZX4 494 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
Ptprb-201ENSMUST00000092167 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Gtf2f1Q3THK3 508 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Arhgap5P97393 1501 aa11.22□□□□□ -0.61
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Zfp444Q3TDV8 331 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Glipr1l2Q9CQ35 332 aa11.22□□□□□ -0.61
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Gsto1O09131 240 aa11.21□□□□□ -0.61
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Mphosph10Q810V0 681 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Sv2bQ8BG39 683 aa11.21□□□□□ -0.61
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Prkrip1Q9CWV6 186 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Cyp46a1Q9WVK8 500 aa11.21□□□□□ -0.61
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Hook1Q8BIL5 728 aa11.21□□□□□ -0.62
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Ttll5Q8CHB8 1328 aa11.21□□□□□ -0.62
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Cfdp1O88271 295 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Rnf20Q5DTM8 973 aa11.21□□□□□ -0.62
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Fyb1O35601 819 aa11.2□□□□□ -0.62
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Smc4Q8CG47 1286 aa11.2□□□□□ -0.62
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Podxl2Q8CAE9 603 aa11.2□□□□□ -0.62
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Sytl4Q9R0Q1 673 aa11.2□□□□□ -0.62
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Rbm10Q99KG3 930 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Rad54l2Q99NG0 1466 aa11.2□□□□□ -0.62
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
Ptprb-201ENSMUST00000092167 CrcpO35427 148 aa11.2□□□□□ -0.62
Ptprb-201ENSMUST00000092167 Znhit6Q3UFB2 460 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 13.5 ms