RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047793.5

Hoxd1-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd1, Length 1,862 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 AnkarA2RT91 1465 aa28■■■□□ 2.07
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Uggt2E9Q4X2 1504 aa27.99■■■□□ 2.07
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Adamtsl3G3UXC7 1706 aa27.99■■■□□ 2.07
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Erich6D3Z6S9 713 aa27.98■■■□□ 2.07
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cyb5rlB1AS42 316 aa27.98■■■□□ 2.07
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Yeats2Q3TUF7 1407 aa27.98■■■□□ 2.07
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa27.97■■■□□ 2.07
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Iqgap3F8VQ29 1632 aa27.96■■■□□ 2.07
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ttc21bQ0HA38 1315 aa27.96■■■□□ 2.07
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Adamts13Q769J6 1426 aa27.94■■■□□ 2.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mroh3A0A1D5RM54 893 aa27.93■■■□□ 2.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Exoc6Q8R313 802 aa27.93■■■□□ 2.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Abcc6Q9R1S7 1498 aa27.93■■■□□ 2.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc24a1Q91WD8 1130 aa27.92■■■□□ 2.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trpm1Q2TV84 1622 aa27.91■■■□□ 2.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tulp4Q9JIL5 1547 aa27.91■■■□□ 2.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Prdm2A2A7B5 1709 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rock2P70336 1388 aa27.9■■■□□ 2.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa27.89■■■□□ 2.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 NpatQ8BMA5 1420 aa27.88■■■□□ 2.05
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa27.87■■■□□ 2.05
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 ErbinQ80TH2 1402 aa27.87■■■□□ 2.05
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Setd1aE9PYH6 1716 aa27.86■■■□□ 2.05
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Abca8aQ8K442 1620 aa27.86■■■□□ 2.05
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Akap12Q9WTQ5 1684 aa27.86■■■□□ 2.05
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cfap65Q3V0B4 1847 aa27.85■■■□□ 2.05
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ehbp1l1Q99MS7 1716 aa27.83■■■□□ 2.05
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zmym4A2A791 1549 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mink1Q9JM52 1308 aa27.82■■■□□ 2.04
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cep152A2AUM9 1736 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ercc6l2Q9JIM3 1537 aa27.79■■■□□ 2.04
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Liat1Q810M6 228 aa27.78■■■□□ 2.04
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sall3Q62255 1320 aa27.78■■■□□ 2.04
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PtprmP28828 1452 aa27.78■■■□□ 2.04
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 MyclP10166 368 aa27.77■■■□□ 2.04
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Talpid3E9PV87 1520 aa27.77■■■□□ 2.04
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Stk24Q99KH8 431 aa27.76■■■□□ 2.04
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Adgrb3Q80ZF8 1522 aa27.76■■■□□ 2.03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Safb2Q80YR5 991 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Efcab6Q6P1E8 1516 aa27.75■■■□□ 2.03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ino80Q6ZPV2 1559 aa27.75■■■□□ 2.03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Adamts7Q68SA9 1657 aa27.73■■■□□ 2.03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tecpr2Q3UH45 1423 aa27.72■■■□□ 2.03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ofd1Q80Z25 1017 aa27.68■■■□□ 2.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Knl1Q66JQ7 1612 aa27.66■■■□□ 2.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 AatkQ80YE4 1365 aa27.66■■■□□ 2.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rims1Q99NE5 1463 aa27.65■■■□□ 2.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kdm2aP59997 1161 aa27.65■■■□□ 2.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Os9Q8K2C7 672 aa27.64■■■□□ 2.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Myom2Q14BI5 1463 aa27.63■■■□□ 2.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kank1E9Q238 1360 aa27.63■■■□□ 2.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Egfem1Q8C088 590 aa27.63■■■□□ 2.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tubgcp6G5E8P0 1769 aa27.62■■■□□ 2.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zbtb4Q5F293 982 aa27.61■■■□□ 2.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cdk5rap2Q8K389 1822 aa27.61■■■□□ 2.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Myo3aQ8K3H5 1613 aa27.59■■■□□ 2.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Uggt1Q6P5E4 1551 aa27.59■■■□□ 2.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm20521D3Z5F7 333 aa27.59■■■□□ 2.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ipo9Q91YE6 1041 aa27.57■■■□□ 2
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Plxnc1Q9QZC2 1574 aa27.57■■■□□ 2
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pola1P33609 1465 aa27.57■■■□□ 2
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 L3mbtl2P59178 703 aa27.55■■■□□ 2
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ccdc27Q3V036 639 aa27.55■■■□□ 2
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pak3Q61036 559 aa27.55■■■□□ 2
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Srcin1Q9QWI6 1250 aa27.55■■■□□ 2
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa27.55■■■□□ 2
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rsph4aQ8BYM7 716 aa27.54■■■□□ 2
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 P3h3Q8CG70 732 aa27.54■■■□□ 2
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ccdc9Q8VC31 543 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mroh1E0CZ22 1640 aa27.53■■■□□ 2
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 TnikP83510 1323 aa27.52■■■□□ 2
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sipa1l1Q8C0T5 1782 aa27.52■■■□□ 2
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Afap1Q80YS6 731 aa27.51■■□□□ 1.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Stard8Q8K031 1019 aa27.5■■□□□ 1.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Skint5A7XUY5 1461 aa27.48■■□□□ 1.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hfm1D3Z4R1 1434 aa27.47■■□□□ 1.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fan1Q69ZT1 1020 aa27.47■■□□□ 1.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nphp4P59240 1425 aa27.45■■□□□ 1.99
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Myom1Q62234 1667 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 DnmbpQ6TXD4 1580 aa27.45■■□□□ 1.98
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa27.44■■□□□ 1.98
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sbno1Q689Z5 1390 aa27.43■■□□□ 1.98
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 RictorQ6QI06 1708 aa27.42■■□□□ 1.98
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Usp40Q8BWR4 1235 aa27.42■■□□□ 1.98
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 4930407I10RikD3Z5T8 1512 aa27.41■■□□□ 1.98
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PrxO55103 1391 aa27.4■■□□□ 1.98
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Prkrip1Q9CWV6 186 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zscan21Q07231 555 aa27.38■■□□□ 1.97
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ttc41Q692V3 1318 aa27.38■■□□□ 1.97
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 AU022751B1B0V2 589 aa27.38■■□□□ 1.97
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mak16Q8BGS0 296 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 36.5 ms