RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000038107.8

Cited2-201, Transcript of Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Cited2, Length 1,979 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2-201ENSMUST00000038107 Trpm1Q2TV84 1622 aa31.77■■■□□ 2.68
Cited2-201ENSMUST00000038107 Kdm2aP59997 1161 aa31.77■■■□□ 2.68
Cited2-201ENSMUST00000038107 AatkQ80YE4 1365 aa31.76■■■□□ 2.67
Cited2-201ENSMUST00000038107 Prdm2A2A7B5 1709 aaKnown RBP31.75■■■□□ 2.67
Cited2-201ENSMUST00000038107 Cul9Q80TT8 1865 aa31.74■■■□□ 2.67
Cited2-201ENSMUST00000038107 Pola1P33609 1465 aa31.74■■■□□ 2.67
Cited2-201ENSMUST00000038107 Rims1Q99NE5 1463 aa31.74■■■□□ 2.67
Cited2-201ENSMUST00000038107 Tecpr2Q3UH45 1423 aa31.74■■■□□ 2.67
Cited2-201ENSMUST00000038107 Efcab6Q6P1E8 1516 aa31.74■■■□□ 2.67
Cited2-201ENSMUST00000038107 Srcin1Q9QWI6 1250 aa31.72■■■□□ 2.67
Cited2-201ENSMUST00000038107 Ino80Q6ZPV2 1559 aa31.7■■■□□ 2.67
Cited2-201ENSMUST00000038107 Yeats2Q3TUF7 1407 aa31.69■■■□□ 2.66
Cited2-201ENSMUST00000038107 Gm20521D3Z5F7 333 aa31.68■■■□□ 2.66
Cited2-201ENSMUST00000038107 Talpid3E9PV87 1520 aa31.67■■■□□ 2.66
Cited2-201ENSMUST00000038107 Aplp2Q06335 707 aa31.67■■■□□ 2.66
Cited2-201ENSMUST00000038107 Myom2Q14BI5 1463 aa31.67■■■□□ 2.66
Cited2-201ENSMUST00000038107 Myo3aQ8K3H5 1613 aa31.67■■■□□ 2.66
Cited2-201ENSMUST00000038107 PrxO55103 1391 aa31.67■■■□□ 2.66
Cited2-201ENSMUST00000038107 Os9Q8K2C7 672 aa31.67■■■□□ 2.66
Cited2-201ENSMUST00000038107 Sbno1Q689Z5 1390 aa31.66■■■□□ 2.66
Cited2-201ENSMUST00000038107 Synj2Q9D2G5 1434 aa31.64■■■□□ 2.66
Cited2-201ENSMUST00000038107 Hecw2Q6I6G8 1578 aa31.63■■■□□ 2.65
Cited2-201ENSMUST00000038107 Pank3Q8R2W9 370 aa31.63■■■□□ 2.65
Cited2-201ENSMUST00000038107 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa31.62■■■□□ 2.65
Cited2-201ENSMUST00000038107 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP31.61■■■□□ 2.65
Cited2-201ENSMUST00000038107 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa31.61■■■□□ 2.65
Cited2-201ENSMUST00000038107 Adamts7Q68SA9 1657 aa31.61■■■□□ 2.65
Cited2-201ENSMUST00000038107 Cdk5rap2Q8K389 1822 aa31.61■■■□□ 2.65
Cited2-201ENSMUST00000038107 Stard8Q8K031 1019 aa31.59■■■□□ 2.65
Cited2-201ENSMUST00000038107 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP31.56■■■□□ 2.64
Cited2-201ENSMUST00000038107 Tmf1B9EKI3 1091 aa31.56■■■□□ 2.64
Cited2-201ENSMUST00000038107 Fan1Q69ZT1 1020 aa31.56■■■□□ 2.64
Cited2-201ENSMUST00000038107 Nphp4P59240 1425 aa31.56■■■□□ 2.64
Cited2-201ENSMUST00000038107 Cfap65Q3V0B4 1847 aa31.55■■■□□ 2.64
Cited2-201ENSMUST00000038107 Knl1Q66JQ7 1612 aa31.55■■■□□ 2.64
Cited2-201ENSMUST00000038107 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa31.55■■■□□ 2.64
Cited2-201ENSMUST00000038107 Inpp5dQ9ES52 1191 aa31.55■■■□□ 2.64
Cited2-201ENSMUST00000038107 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP31.55■■■□□ 2.64
Cited2-201ENSMUST00000038107 Usp40Q8BWR4 1235 aa31.53■■■□□ 2.64
Cited2-201ENSMUST00000038107 Zscan10Q3URR7 782 aa31.52■■■□□ 2.64
Cited2-201ENSMUST00000038107 Plxnc1Q9QZC2 1574 aa31.51■■■□□ 2.64
Cited2-201ENSMUST00000038107 Uggt1Q6P5E4 1551 aa31.51■■■□□ 2.63
Cited2-201ENSMUST00000038107 DnmbpQ6TXD4 1580 aa31.51■■■□□ 2.63
Cited2-201ENSMUST00000038107 Mroh1E0CZ22 1640 aa31.49■■■□□ 2.63
Cited2-201ENSMUST00000038107 Sipa1l1Q8C0T5 1782 aa31.49■■■□□ 2.63
Cited2-201ENSMUST00000038107 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa31.48■■■□□ 2.63
Cited2-201ENSMUST00000038107 Slc4a1apE9PX68 744 aa31.48■■■□□ 2.63
Cited2-201ENSMUST00000038107 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa31.48■■■□□ 2.63
Cited2-201ENSMUST00000038107 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa31.47■■■□□ 2.63
Cited2-201ENSMUST00000038107 Zmym4A2A791 1549 aaKnown RBP31.46■■■□□ 2.63
Cited2-201ENSMUST00000038107 AU022751B1B0V2 589 aa31.45■■■□□ 2.63
Cited2-201ENSMUST00000038107 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP31.45■■■□□ 2.62
Cited2-201ENSMUST00000038107 Fam184bQ0KK56 942 aa31.44■■■□□ 2.62
Cited2-201ENSMUST00000038107 Skint5A7XUY5 1461 aa31.42■■■□□ 2.62
Cited2-201ENSMUST00000038107 SafbD3YXK2 937 aaKnown RBP31.38■■■□□ 2.61
Cited2-201ENSMUST00000038107 Myom1Q62234 1667 aaKnown RBP31.38■■■□□ 2.61
Cited2-201ENSMUST00000038107 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP31.37■■■□□ 2.61
Cited2-201ENSMUST00000038107 Zscan21Q07231 555 aa31.37■■■□□ 2.61
Cited2-201ENSMUST00000038107 Calr4Q3TQS0 420 aa31.37■■■□□ 2.61
Cited2-201ENSMUST00000038107 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP31.36■■■□□ 2.61
Cited2-201ENSMUST00000038107 Tex14Q7M6U3 1450 aa31.36■■■□□ 2.61
Cited2-201ENSMUST00000038107 Ofd1Q80Z25 1017 aa31.36■■■□□ 2.61
Cited2-201ENSMUST00000038107 Hfm1D3Z4R1 1434 aa31.35■■■□□ 2.61
Cited2-201ENSMUST00000038107 Q7TT23 1179 aa31.35■■■□□ 2.61
Cited2-201ENSMUST00000038107 Gm38655A0A286YDK6 273 aa31.34■■■□□ 2.61
Cited2-201ENSMUST00000038107 Lrrc7Q80TE7 1490 aa31.33■■■□□ 2.61
Cited2-201ENSMUST00000038107 Kdm5aQ3UXZ9 1690 aa31.33■■■□□ 2.61
Cited2-201ENSMUST00000038107 Rsph4aQ8BYM7 716 aa31.33■■■□□ 2.61
Cited2-201ENSMUST00000038107 Slc52a2Q9D8F3 450 aa31.33■■■□□ 2.61
Cited2-201ENSMUST00000038107 PalldQ9ET54 1408 aa31.32■■■□□ 2.61
Cited2-201ENSMUST00000038107 Dnajc5gQ8C632 165 aa31.31■■■□□ 2.6
Cited2-201ENSMUST00000038107 Ift172Q6VH22 1749 aa31.29■■■□□ 2.6
Cited2-201ENSMUST00000038107 NpatQ8BMA5 1420 aa31.29■■■□□ 2.6
Cited2-201ENSMUST00000038107 Qser1A2BIE1 1698 aa31.28■■■□□ 2.6
Cited2-201ENSMUST00000038107 Prrc2bQ7TPM1 1486 aaKnown RBP31.28■■■□□ 2.6
Cited2-201ENSMUST00000038107 Afap1Q80YS6 731 aa31.26■■■□□ 2.6
Cited2-201ENSMUST00000038107 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa31.25■■■□□ 2.59
Cited2-201ENSMUST00000038107 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP31.24■■■□□ 2.59
Cited2-201ENSMUST00000038107 Stag3O70576 1240 aa31.24■■■□□ 2.59
Cited2-201ENSMUST00000038107 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa31.24■■■□□ 2.59
Cited2-201ENSMUST00000038107 PtprmP28828 1452 aa31.23■■■□□ 2.59
Cited2-201ENSMUST00000038107 MaddQ80U28 1577 aa31.23■■■□□ 2.59
Cited2-201ENSMUST00000038107 Mak16Q8BGS0 296 aaKnown RBP31.22■■■□□ 2.59
Cited2-201ENSMUST00000038107 Arhgap23Q69ZH9 1483 aa31.22■■■□□ 2.59
Cited2-201ENSMUST00000038107 Plppr3Q7TPB0 716 aa31.21■■■□□ 2.59
Cited2-201ENSMUST00000038107 IqubQ8CDK3 788 aa31.21■■■□□ 2.59
Cited2-201ENSMUST00000038107 CenpbP27790 599 aa31.18■■■□□ 2.58
Cited2-201ENSMUST00000038107 P3h3Q8CG70 732 aa31.17■■■□□ 2.58
Cited2-201ENSMUST00000038107 Kif7B7ZNG0 1348 aa31.17■■■□□ 2.58
Cited2-201ENSMUST00000038107 Kif13aQ9EQW7 1749 aa31.16■■■□□ 2.58
Cited2-201ENSMUST00000038107 InsrP15208 1372 aa31.16■■■□□ 2.58
Cited2-201ENSMUST00000038107 RictorQ6QI06 1708 aa31.13■■■□□ 2.57
Cited2-201ENSMUST00000038107 Itsn1Q9Z0R4 1714 aa31.13■■■□□ 2.57
Cited2-201ENSMUST00000038107 Dcaf11Q91VU6 549 aa31.12■■■□□ 2.57
Cited2-201ENSMUST00000038107 CenpjQ569L8 1344 aa31.12■■■□□ 2.57
Cited2-201ENSMUST00000038107 Gprasp1Q5U4C1 1347 aa31.12■■■□□ 2.57
Cited2-201ENSMUST00000038107 Atf7ipQ7TT18 1306 aa31.11■■■□□ 2.57
Cited2-201ENSMUST00000038107 Naip7Q9JIB3 1402 aa31.1■■■□□ 2.57
Cited2-201ENSMUST00000038107 Shq1Q7TMX5 569 aa31.08■■■□□ 2.57
Cited2-201ENSMUST00000038107 Cnga1P29974 684 aa31.08■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 94.8 ms