RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000035227.7

Nicn1-201, Transcript of Nicolin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nicn1, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Pank3Q8R2W9 370 aa16.2■□□□□ 0.18
Nicn1-201ENSMUST00000035227 AdgbG3UZ78 1657 aa16.2■□□□□ 0.18
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Tubgcp6G5E8P0 1769 aa16.2■□□□□ 0.18
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Aplp2Q06335 707 aa16.19■□□□□ 0.18
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Rims1Q99NE5 1463 aa16.18■□□□□ 0.18
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Fan1Q69ZT1 1020 aa16.18■□□□□ 0.18
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Cep152A2AUM9 1736 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Tecpr2Q3UH45 1423 aa16.17■□□□□ 0.18
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Pola1P33609 1465 aa16.17■□□□□ 0.18
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Inpp5dQ9ES52 1191 aa16.16■□□□□ 0.18
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Efcab6Q6P1E8 1516 aa16.16■□□□□ 0.18
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Trpm1Q2TV84 1622 aa16.16■□□□□ 0.18
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Myo3aQ8K3H5 1613 aa16.16■□□□□ 0.18
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Ehbp1l1Q99MS7 1716 aa16.15■□□□□ 0.18
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Ttc37F8VPK0 1563 aa16.15■□□□□ 0.18
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Akap12Q9WTQ5 1684 aa16.15■□□□□ 0.18
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Tmf1B9EKI3 1091 aa16.15■□□□□ 0.18
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Sbno1Q689Z5 1390 aa16.15■□□□□ 0.18
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Talpid3E9PV87 1520 aa16.14■□□□□ 0.17
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Usp40Q8BWR4 1235 aa16.14■□□□□ 0.17
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa16.14■□□□□ 0.17
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Synj2Q9D2G5 1434 aa16.14■□□□□ 0.17
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Ino80Q6ZPV2 1559 aa16.14■□□□□ 0.17
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Myom2Q14BI5 1463 aa16.14■□□□□ 0.17
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Slc4a1apE9PX68 744 aa16.13■□□□□ 0.17
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa16.13■□□□□ 0.17
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Zscan10Q3URR7 782 aa16.12■□□□□ 0.17
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Stard8Q8K031 1019 aa16.12■□□□□ 0.17
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Gm38655A0A286YDK6 273 aa16.12■□□□□ 0.17
Nicn1-201ENSMUST00000035227 SafbD3YXK2 937 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Nphp4P59240 1425 aa16.1■□□□□ 0.17
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Cul9Q80TT8 1865 aa16.1■□□□□ 0.17
Nicn1-201ENSMUST00000035227 AU022751B1B0V2 589 aa16.1■□□□□ 0.17
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Hecw2Q6I6G8 1578 aa16.09■□□□□ 0.17
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Prdm2A2A7B5 1709 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Cdk5rap2Q8K389 1822 aa16.08■□□□□ 0.17
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Knl1Q66JQ7 1612 aa16.08■□□□□ 0.16
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa16.08■□□□□ 0.16
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Fam184bQ0KK56 942 aa16.08■□□□□ 0.16
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa16.08■□□□□ 0.16
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa16.08■□□□□ 0.16
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Adamts7Q68SA9 1657 aa16.08■□□□□ 0.16
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Cfap65Q3V0B4 1847 aa16.07■□□□□ 0.16
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Q7TT23 1179 aa16.07■□□□□ 0.16
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Calr4Q3TQS0 420 aa16.06■□□□□ 0.16
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Ofd1Q80Z25 1017 aa16.06■□□□□ 0.16
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Skint5A7XUY5 1461 aa16.06■□□□□ 0.16
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Zscan21Q07231 555 aa16.06■□□□□ 0.16
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Mroh1E0CZ22 1640 aa16.05■□□□□ 0.16
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Uggt1Q6P5E4 1551 aa16.04■□□□□ 0.16
Nicn1-201ENSMUST00000035227 DnmbpQ6TXD4 1580 aa16.04■□□□□ 0.16
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Plxnc1Q9QZC2 1574 aa16.03■□□□□ 0.16
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Afap1Q80YS6 731 aa16.02■□□□□ 0.16
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Hfm1D3Z4R1 1434 aa16.01■□□□□ 0.15
Nicn1-201ENSMUST00000035227 P3h3Q8CG70 732 aa16.01■□□□□ 0.15
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Slc52a2Q9D8F3 450 aa16.01■□□□□ 0.15
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Tex14Q7M6U3 1450 aa16.01■□□□□ 0.15
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Zmym4A2A791 1549 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Stag3O70576 1240 aa16■□□□□ 0.15
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Sipa1l1Q8C0T5 1782 aa15.99■□□□□ 0.15
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa15.99■□□□□ 0.15
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Lrrc7Q80TE7 1490 aa15.99■□□□□ 0.15
Nicn1-201ENSMUST00000035227 PalldQ9ET54 1408 aa15.99■□□□□ 0.15
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Prrc2bQ7TPM1 1486 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Rsph4aQ8BYM7 716 aa15.98■□□□□ 0.15
Nicn1-201ENSMUST00000035227 NpatQ8BMA5 1420 aa15.98■□□□□ 0.15
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Mak16Q8BGS0 296 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
Nicn1-201ENSMUST00000035227 IqubQ8CDK3 788 aa15.97■□□□□ 0.15
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa15.96■□□□□ 0.15
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Myom1Q62234 1667 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Kdm5aQ3UXZ9 1690 aa15.95■□□□□ 0.14
Nicn1-201ENSMUST00000035227 CenpbP27790 599 aa15.95■□□□□ 0.14
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Cnga1P29974 684 aa15.95■□□□□ 0.14
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Kif7B7ZNG0 1348 aa15.95■□□□□ 0.14
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Qser1A2BIE1 1698 aa15.94■□□□□ 0.14
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Dcaf11Q91VU6 549 aa15.94■□□□□ 0.14
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Atp1b4Q99ME6 356 aa15.94■□□□□ 0.14
Nicn1-201ENSMUST00000035227 PtprmP28828 1452 aa15.94■□□□□ 0.14
Nicn1-201ENSMUST00000035227 L3mbtl2P59178 703 aa15.92■□□□□ 0.14
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Zfp444Q3TDV8 331 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Shq1Q7TMX5 569 aa15.92■□□□□ 0.14
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Stk26Q99JT2 416 aa15.92■□□□□ 0.14
Nicn1-201ENSMUST00000035227 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
Nicn1-201ENSMUST00000035227 MaddQ80U28 1577 aa15.91■□□□□ 0.14
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Arhgap23Q69ZH9 1483 aa15.91■□□□□ 0.14
Nicn1-201ENSMUST00000035227 InsrP15208 1372 aa15.9■□□□□ 0.14
Nicn1-201ENSMUST00000035227 CenpjQ569L8 1344 aa15.9■□□□□ 0.14
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Esx1O88933 382 aa15.9■□□□□ 0.14
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Ift172Q6VH22 1749 aa15.89■□□□□ 0.13
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Gprasp1Q5U4C1 1347 aa15.89■□□□□ 0.13
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa15.89■□□□□ 0.13
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Atf7ipQ7TT18 1306 aa15.88■□□□□ 0.13
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Naip7Q9JIB3 1402 aa15.88■□□□□ 0.13
Nicn1-201ENSMUST00000035227 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.3 ms