RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000030117.4

Smu1-201, Transcript of WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Smu1, Length 2,418 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1-201ENSMUST00000030117 Plekhh1Q80TI1 1356 aa23.4■■□□□ 1.34
Smu1-201ENSMUST00000030117 Robo2Q7TPD3 1470 aa23.39■■□□□ 1.34
Smu1-201ENSMUST00000030117 Fam184bQ0KK56 942 aa23.39■■□□□ 1.33
Smu1-201ENSMUST00000030117 EspnQ9ET47 871 aa23.39■■□□□ 1.33
Smu1-201ENSMUST00000030117 Dbr1Q923B1 550 aa23.38■■□□□ 1.33
Smu1-201ENSMUST00000030117 Atf7ipQ7TT18 1306 aa23.37■■□□□ 1.33
Smu1-201ENSMUST00000030117 AI481877A2ALV5 1481 aa23.37■■□□□ 1.33
Smu1-201ENSMUST00000030117 Pdcd11Q6NS46 1862 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
Smu1-201ENSMUST00000030117 Hecw1Q8K4P8 1604 aa23.36■■□□□ 1.33
Smu1-201ENSMUST00000030117 Prdm16A2A935 1275 aa23.36■■□□□ 1.33
Smu1-201ENSMUST00000030117 Kdm2aP59997 1161 aa23.34■■□□□ 1.33
Smu1-201ENSMUST00000030117 DaxxO35613 739 aa23.34■■□□□ 1.33
Smu1-201ENSMUST00000030117 Chmp5Q9D7S9 219 aa23.33■■□□□ 1.33
Smu1-201ENSMUST00000030117 Apbb1Q9QXJ1 710 aa23.33■■□□□ 1.33
Smu1-201ENSMUST00000030117 Erich6D3Z6S9 713 aa23.32■■□□□ 1.32
Smu1-201ENSMUST00000030117 Pola1P33609 1465 aa23.32■■□□□ 1.32
Smu1-201ENSMUST00000030117 Cdc42bpbQ7TT50 1713 aa23.32■■□□□ 1.32
Smu1-201ENSMUST00000030117 Abcc3B2RX12 1523 aa23.31■■□□□ 1.32
Smu1-201ENSMUST00000030117 Nsd2Q8BVE8 1365 aa23.31■■□□□ 1.32
Smu1-201ENSMUST00000030117 NudcO35685 332 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
Smu1-201ENSMUST00000030117 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa23.31■■□□□ 1.32
Smu1-201ENSMUST00000030117 Map3k5O35099 1380 aa23.3■■□□□ 1.32
Smu1-201ENSMUST00000030117 Sart3Q9JLI8 962 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
Smu1-201ENSMUST00000030117 Irx3P81067 507 aa23.3■■□□□ 1.32
Smu1-201ENSMUST00000030117 Gtf3c3Q3TMP1 882 aa23.3■■□□□ 1.32
Smu1-201ENSMUST00000030117 Zmym3Q9JLM4 1370 aa23.29■■□□□ 1.32
Smu1-201ENSMUST00000030117 Fgd6Q69ZL1 1399 aa23.28■■□□□ 1.32
Smu1-201ENSMUST00000030117 4933416C03RikQ3V063 378 aa23.28■■□□□ 1.32
Smu1-201ENSMUST00000030117 Smc5Q8CG46 1101 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
Smu1-201ENSMUST00000030117 Gm14025A2AP89 1413 aa23.27■■□□□ 1.32
Smu1-201ENSMUST00000030117 Dnai1Q8C0M8 701 aa23.27■■□□□ 1.32
Smu1-201ENSMUST00000030117 Abcc6Q9R1S7 1498 aa23.27■■□□□ 1.32
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ccdc30Q8BVF4 654 aa23.27■■□□□ 1.31
Smu1-201ENSMUST00000030117 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
Smu1-201ENSMUST00000030117 Neurod2Q62414 383 aa23.25■■□□□ 1.31
Smu1-201ENSMUST00000030117 Nlrp6Q91WS2 869 aa23.25■■□□□ 1.31
Smu1-201ENSMUST00000030117 Kif7B7ZNG0 1348 aa23.25■■□□□ 1.31
Smu1-201ENSMUST00000030117 AnkarA2RT91 1465 aa23.25■■□□□ 1.31
Smu1-201ENSMUST00000030117 Sall3Q62255 1320 aa23.25■■□□□ 1.31
Smu1-201ENSMUST00000030117 Col17a1Q07563 1470 aa23.25■■□□□ 1.31
Smu1-201ENSMUST00000030117 Usp19Q3UJD6 1360 aa23.25■■□□□ 1.31
Smu1-201ENSMUST00000030117 ShprhQ7TPQ3 1674 aa23.24■■□□□ 1.31
Smu1-201ENSMUST00000030117 Os9Q8K2C7 672 aa23.23■■□□□ 1.31
Smu1-201ENSMUST00000030117 Kif1bQ60575 1816 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ppm1gQ61074 542 aa23.21■■□□□ 1.31
Smu1-201ENSMUST00000030117 Mre11Q61216 706 aa23.21■■□□□ 1.31
Smu1-201ENSMUST00000030117 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa23.21■■□□□ 1.31
Smu1-201ENSMUST00000030117 Dcaf11Q91VU6 549 aa23.21■■□□□ 1.31
Smu1-201ENSMUST00000030117 Gm20521D3Z5F7 333 aa23.2■■□□□ 1.3
Smu1-201ENSMUST00000030117 NhsB1AV60 1647 aa23.2■■□□□ 1.3
Smu1-201ENSMUST00000030117 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa23.2■■□□□ 1.3
Smu1-201ENSMUST00000030117 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa23.2■■□□□ 1.3
Smu1-201ENSMUST00000030117 Uggt2E9Q4X2 1504 aa23.19■■□□□ 1.3
Smu1-201ENSMUST00000030117 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa23.17■■□□□ 1.3
Smu1-201ENSMUST00000030117 Golga2Q921M4 999 aa23.16■■□□□ 1.3
Smu1-201ENSMUST00000030117 Tspyl2Q7TQI8 677 aa23.15■■□□□ 1.3
Smu1-201ENSMUST00000030117 Abcc1O35379 1528 aa23.15■■□□□ 1.3
Smu1-201ENSMUST00000030117 Kdm5aQ3UXZ9 1690 aa23.14■■□□□ 1.3
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
Smu1-201ENSMUST00000030117 Abca17E9PX95 1733 aa23.14■■□□□ 1.3
Smu1-201ENSMUST00000030117 Atp10dQ8K2X1 1416 aa23.13■■□□□ 1.29
Smu1-201ENSMUST00000030117 Trim30dE9PWL0 497 aa23.12■■□□□ 1.29
Smu1-201ENSMUST00000030117 Abca8bQ8K440 1620 aa23.12■■□□□ 1.29
Smu1-201ENSMUST00000030117 Usp40Q8BWR4 1235 aa23.11■■□□□ 1.29
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ipo8Q7TMY7 1010 aa23.11■■□□□ 1.29
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ak7Q9D2H2 614 aa23.11■■□□□ 1.29
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ralbp1Q62172 648 aa23.1■■□□□ 1.29
Smu1-201ENSMUST00000030117 Kiaa1107Q80TK0 1369 aa23.1■■□□□ 1.29
Smu1-201ENSMUST00000030117 Uspl1Q3ULM6 1089 aa23.09■■□□□ 1.29
Smu1-201ENSMUST00000030117 Eif2s2Q99L45 331 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
Smu1-201ENSMUST00000030117 Kidins220E9Q9B7 1793 aa23.09■■□□□ 1.29
Smu1-201ENSMUST00000030117 Gas2l2Q5SSG4 860 aa23.09■■□□□ 1.29
Smu1-201ENSMUST00000030117 Stard8Q8K031 1019 aa23.09■■□□□ 1.29
Smu1-201ENSMUST00000030117 Xrn1P97789 1719 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
Smu1-201ENSMUST00000030117 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
Smu1-201ENSMUST00000030117 Fan1Q69ZT1 1020 aa23.08■■□□□ 1.28
Smu1-201ENSMUST00000030117 4930567H17RikQ3V0K5 233 aa23.07■■□□□ 1.28
Smu1-201ENSMUST00000030117 Pank1Q8K4K6 548 aa23.07■■□□□ 1.28
Smu1-201ENSMUST00000030117 Stk24Q99KH8 431 aa23.07■■□□□ 1.28
Smu1-201ENSMUST00000030117 Cep152A2AUM9 1736 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
Smu1-201ENSMUST00000030117 Hsp90ab1P11499 724 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
Smu1-201ENSMUST00000030117 Kif3bQ61771 747 aa23.06■■□□□ 1.28
Smu1-201ENSMUST00000030117 ErbinQ80TH2 1402 aa23.06■■□□□ 1.28
Smu1-201ENSMUST00000030117 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa23.06■■□□□ 1.28
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ttc21bQ0HA38 1315 aa23.04■■□□□ 1.28
Smu1-201ENSMUST00000030117 Gprasp1Q5U4C1 1347 aa23.04■■□□□ 1.28
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ccdc183A2AJB1 534 aa23.03■■□□□ 1.28
Smu1-201ENSMUST00000030117 Tmc1Q8R4P5 757 aa23.03■■□□□ 1.28
Smu1-201ENSMUST00000030117 Nphp4P59240 1425 aa23.03■■□□□ 1.28
Smu1-201ENSMUST00000030117 Plcd4Q8K3R3 807 aa23.02■■□□□ 1.28
Smu1-201ENSMUST00000030117 Myo3aQ8K3H5 1613 aa23.02■■□□□ 1.28
Smu1-201ENSMUST00000030117 Myo5cE9Q1F5 1742 aa23.02■■□□□ 1.28
Smu1-201ENSMUST00000030117 Znf521Q6KAS7 1311 aa23.02■■□□□ 1.28
Smu1-201ENSMUST00000030117 Cnga1P29974 684 aa23■■□□□ 1.27
Smu1-201ENSMUST00000030117 Trim58Q5NCC9 485 aa23■■□□□ 1.27
Smu1-201ENSMUST00000030117 Myom1Q62234 1667 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
Smu1-201ENSMUST00000030117 Map4k4P97820 1233 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ppp1r9bQ6R891 817 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
Smu1-201ENSMUST00000030117 Pdlim2Q8R1G6 349 aa22.99■■□□□ 1.27
Smu1-201ENSMUST00000030117 Myom2Q14BI5 1463 aa22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 121.2 ms