RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028964.13

Rbck1-201, Transcript of RanBP-type and C3HC4-type zinc finger-containing protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rbck1, Length 2,252 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Irx3P81067 507 aa20.62■□□□□ 0.89
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Gtf3c3Q3TMP1 882 aa20.62■□□□□ 0.89
Rbck1-201ENSMUST00000028964 PrxO55103 1391 aa20.62■□□□□ 0.89
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Sbno1Q689Z5 1390 aa20.61■□□□□ 0.89
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Cd109Q8R422 1442 aa20.6■□□□□ 0.89
Rbck1-201ENSMUST00000028964 OvosQ3UU35 1456 aa20.6■□□□□ 0.89
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Atp7aQ64430 1491 aa20.6■□□□□ 0.89
Rbck1-201ENSMUST00000028964 AglF8VPN4 1532 aa20.59■□□□□ 0.89
Rbck1-201ENSMUST00000028964 ChgaP26339 463 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Pank3Q8R2W9 370 aa20.59■□□□□ 0.89
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa20.57■□□□□ 0.88
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Nkx1-2P42580 305 aa20.57■□□□□ 0.88
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Ttc37F8VPK0 1563 aa20.57■□□□□ 0.88
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Zscan10Q3URR7 782 aa20.56■□□□□ 0.88
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Kif16bB1AVY7 1312 aa20.55■□□□□ 0.88
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Tmf1B9EKI3 1091 aa20.55■□□□□ 0.88
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Xrn1P97789 1719 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Ptch1Q61115 1434 aa20.55■□□□□ 0.88
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Atf7ipQ7TT18 1306 aa20.55■□□□□ 0.88
Rbck1-201ENSMUST00000028964 EspnQ9ET47 871 aa20.54■□□□□ 0.88
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Nos1Q9Z0J4 1429 aa20.54■□□□□ 0.88
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Adamts13Q769J6 1426 aa20.53■□□□□ 0.88
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Plekhh1Q80TI1 1356 aa20.53■□□□□ 0.88
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Kif3bQ61771 747 aa20.53■□□□□ 0.88
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Inpp5dQ9ES52 1191 aa20.53■□□□□ 0.88
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Rwdd1Q9CQK7 243 aa20.52■□□□□ 0.88
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Pde4cQ3UEI1 686 aa20.51■□□□□ 0.87
Rbck1-201ENSMUST00000028964 CanxP35564 591 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Mre11Q61216 706 aa20.49■□□□□ 0.87
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Abca17E9PX95 1733 aa20.49■□□□□ 0.87
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa20.48■□□□□ 0.87
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa20.48■□□□□ 0.87
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa20.48■□□□□ 0.87
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Atp10aO54827 1508 aa20.47■□□□□ 0.87
Rbck1-201ENSMUST00000028964 DaxxO35613 739 aa20.47■□□□□ 0.87
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Esx1O88933 382 aa20.47■□□□□ 0.87
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Ppm1gQ61074 542 aa20.47■□□□□ 0.87
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Pola1P33609 1465 aa20.46■□□□□ 0.87
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Robo2Q7TPD3 1470 aa20.46■□□□□ 0.87
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Amer1Q7TS75 1132 aa20.46■□□□□ 0.87
Rbck1-201ENSMUST00000028964 ShprhQ7TPQ3 1674 aa20.46■□□□□ 0.87
Rbck1-201ENSMUST00000028964 AnkarA2RT91 1465 aa20.46■□□□□ 0.87
Rbck1-201ENSMUST00000028964 NudcO35685 332 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa20.46■□□□□ 0.87
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Dnai1Q8C0M8 701 aa20.46■□□□□ 0.87
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa20.46■□□□□ 0.87
Rbck1-201ENSMUST00000028964 4933416C03RikQ3V063 378 aa20.45■□□□□ 0.86
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Znf518aB2RRF6 1478 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Dip2cE9PWR4 1557 aa20.44■□□□□ 0.86
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Kiaa0556Q8C753 1610 aa20.43■□□□□ 0.86
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Kif1bQ60575 1816 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Chmp5Q9D7S9 219 aa20.42■□□□□ 0.86
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Smc5Q8CG46 1101 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
Rbck1-201ENSMUST00000028964 B4galnt3Q6L8S8 986 aa20.41■□□□□ 0.86
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Tulp4Q9JIL5 1547 aa20.41■□□□□ 0.86
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Yeats2Q3TUF7 1407 aa20.41■□□□□ 0.86
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Edc4Q3UJB9 1406 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
Rbck1-201ENSMUST00000028964 RereQ80TZ9 1558 aa20.41■□□□□ 0.86
Rbck1-201ENSMUST00000028964 CrbnQ8C7D2 445 aa20.41■□□□□ 0.86
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Sart3Q9JLI8 962 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Fndc1E9Q043 1732 aa20.4■□□□□ 0.86
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Fgd1P52734 960 aa20.39■□□□□ 0.86
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Tmc1Q8R4P5 757 aa20.39■□□□□ 0.86
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Zbtb4Q5F293 982 aa20.39■□□□□ 0.85
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Fam184bQ0KK56 942 aa20.38■□□□□ 0.85
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Gli2Q0VGT2 1544 aa20.38■□□□□ 0.85
Rbck1-201ENSMUST00000028964 AdgbG3UZ78 1657 aa20.37■□□□□ 0.85
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa20.37■□□□□ 0.85
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Synj2Q9D2G5 1434 aa20.37■□□□□ 0.85
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Mroh3A0A1D5RM54 893 aa20.37■□□□□ 0.85
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Dnajc5P60904 198 aa20.37■□□□□ 0.85
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Srcin1Q9QWI6 1250 aa20.37■□□□□ 0.85
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Nsd2Q8BVE8 1365 aa20.37■□□□□ 0.85
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Myo5cE9Q1F5 1742 aa20.36■□□□□ 0.85
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Slc4a1apE9PX68 744 aa20.36■□□□□ 0.85
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Cdc42bpgQ80UW5 1551 aa20.35■□□□□ 0.85
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Hecw2Q6I6G8 1578 aa20.34■□□□□ 0.85
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Erich6D3Z6S9 713 aa20.33■□□□□ 0.85
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Pdlim2Q8R1G6 349 aa20.33■□□□□ 0.85
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Topbp1Q6ZQF0 1515 aa20.32■□□□□ 0.84
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Plcd4Q8K3R3 807 aa20.32■□□□□ 0.84
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Cul9Q80TT8 1865 aa20.32■□□□□ 0.84
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Uggt2E9Q4X2 1504 aa20.31■□□□□ 0.84
Rbck1-201ENSMUST00000028964 AampJ3QN89 436 aa20.31■□□□□ 0.84
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Abca6Q8K441 1624 aa20.31■□□□□ 0.84
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Usp19Q3UJD6 1360 aa20.3■□□□□ 0.84
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Ccdc30Q8BVF4 654 aa20.3■□□□□ 0.84
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Dbr1Q923B1 550 aa20.3■□□□□ 0.84
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Kdm5aQ3UXZ9 1690 aa20.29■□□□□ 0.84
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Ipo8Q7TMY7 1010 aa20.29■□□□□ 0.84
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa20.29■□□□□ 0.84
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Abcc6Q9R1S7 1498 aa20.29■□□□□ 0.84
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Ttc21bQ0HA38 1315 aa20.27■□□□□ 0.84
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Ipo4Q8VI75 1082 aa20.27■□□□□ 0.83
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Cfap65Q3V0B4 1847 aa20.26■□□□□ 0.83
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Stard8Q8K031 1019 aa20.26■□□□□ 0.83
Rbck1-201ENSMUST00000028964 Ralbp1Q62172 648 aa20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10.1 ms