RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028157.8

Gtf3c5-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c5, Length 2,739 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tmf1B9EKI3 1091 aa18.33■□□□□ 0.53
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ptch1Q61115 1434 aa18.33■□□□□ 0.52
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Slc4a1apE9PX68 744 aa18.33■□□□□ 0.52
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 L3mbtl2P59178 703 aa18.33■□□□□ 0.52
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Topbp1Q6ZQF0 1515 aa18.33■□□□□ 0.52
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 AatkQ80YE4 1365 aa18.32■□□□□ 0.52
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pola1P33609 1465 aa18.31■□□□□ 0.52
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sbno1Q689Z5 1390 aa18.31■□□□□ 0.52
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm156Q58A37 223 aa18.31■□□□□ 0.52
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Abca8aQ8K442 1620 aa18.3■□□□□ 0.52
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fan1Q69ZT1 1020 aa18.29■□□□□ 0.52
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Plch2A2AP18 1501 aa18.29■□□□□ 0.52
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gli2Q0VGT2 1544 aa18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Atp10aO54827 1508 aa18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Myo3aQ8K3H5 1613 aa18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cep152A2AUM9 1736 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa18.27■□□□□ 0.52
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fam184bQ0KK56 942 aa18.27■□□□□ 0.51
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Usp40Q8BWR4 1235 aa18.27■□□□□ 0.51
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa18.27■□□□□ 0.51
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mak16Q8BGS0 296 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rims1Q99NE5 1463 aa18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zfp444Q3TDV8 331 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 AglF8VPN4 1532 aa18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Adgrb3Q80ZF8 1522 aa18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ak9G3UYQ4 1894 aa18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Wdr43Q6ZQL4 677 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tex14Q7M6U3 1450 aa18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Depdc5P61460 1591 aa18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ehbp1l1Q99MS7 1716 aa18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Erbb3Q61526 1339 aa18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zmym4A2A791 1549 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Trpm1Q2TV84 1622 aa18.21■□□□□ 0.51
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cdk5rap2Q8K389 1822 aa18.21■□□□□ 0.51
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dip2cE9PWR4 1557 aa18.21■□□□□ 0.51
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cdc42bpgQ80UW5 1551 aa18.21■□□□□ 0.51
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Nphp4P59240 1425 aa18.2■□□□□ 0.5
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Kank1E9Q238 1360 aa18.19■□□□□ 0.5
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 RereQ80TZ9 1558 aa18.18■□□□□ 0.5
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Esx1O88933 382 aa18.18■□□□□ 0.5
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Stard8Q8K031 1019 aa18.18■□□□□ 0.5
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 AdgbG3UZ78 1657 aa18.17■□□□□ 0.5
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 AU022751B1B0V2 589 aa18.17■□□□□ 0.5
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Myom2Q14BI5 1463 aa18.17■□□□□ 0.5
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Efcab6Q6P1E8 1516 aa18.17■□□□□ 0.5
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Prdm2A2A7B5 1709 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tecpr2Q3UH45 1423 aa18.16■□□□□ 0.5
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Kcnh8P59111 1102 aa18.16■□□□□ 0.5
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa18.16■□□□□ 0.5
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Akap12Q9WTQ5 1684 aa18.14■□□□□ 0.49
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Yeats2Q3TUF7 1407 aa18.14■□□□□ 0.49
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Kif7B7ZNG0 1348 aa18.14■□□□□ 0.49
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ino80Q6ZPV2 1559 aa18.14■□□□□ 0.49
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 DnmbpQ6TXD4 1580 aa18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dcaf11Q91VU6 549 aa18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Kdm5aQ3UXZ9 1690 aa18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sipa1l1Q8C0T5 1782 aa18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Kiaa0556Q8C753 1610 aa18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cnga1P29974 684 aa18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Supt16hQ920B9 1047 aa18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Uggt1Q6P5E4 1551 aa18.1■□□□□ 0.49
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Talpid3E9PV87 1520 aa18.1■□□□□ 0.49
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cul9Q80TT8 1865 aa18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 CrbnQ8C7D2 445 aa18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Adgrl3Q80TS3 1537 aa18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Slc4a3P16283 1227 aa18.08■□□□□ 0.49
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Stag3O70576 1240 aa18.08■□□□□ 0.48
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Atf7ipQ7TT18 1306 aa18.08■□□□□ 0.48
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Knl1Q66JQ7 1612 aa18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Kif16bB1AVY7 1312 aa18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mroh1E0CZ22 1640 aa18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cfap65Q3V0B4 1847 aa18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Lrrc7Q80TE7 1490 aa18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 PalldQ9ET54 1408 aa18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Nlrp6Q91WS2 869 aa18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Plxnc1Q9QZC2 1574 aa18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Liat1Q810M6 228 aa18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Myom1Q62234 1667 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Skint5A7XUY5 1461 aa18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gprasp1Q5U4C1 1347 aa18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Adamts7Q68SA9 1657 aa18.02■□□□□ 0.47
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Slc52a2Q9D8F3 450 aa18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 IqubQ8CDK3 788 aa18■□□□□ 0.47
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ift172Q6VH22 1749 aa17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Stk26Q99JT2 416 aa17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Usp19Q3UJD6 1360 aa17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Prrc2bQ7TPM1 1486 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 MaddQ80U28 1577 aa17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ttc37F8VPK0 1563 aa17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 45.8 ms