RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020657.12

Ube2b-201, Transcript of Ubiquitin-conjugating enzyme E2 B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ube2b, Length 1,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Rims1Q99NE5 1463 aa28.68■■■□□ 2.18
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Ube2b-201ENSMUST00000020657 Calr4Q3TQS0 420 aa28.42■■■□□ 2.14
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Fam184bQ0KK56 942 aa28.41■■■□□ 2.14
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Ube2b-201ENSMUST00000020657 AU022751B1B0V2 589 aa28.3■■■□□ 2.12
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Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa28.22■■■□□ 2.11
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Ube2b-201ENSMUST00000020657 PtprmP28828 1452 aa28.11■■■□□ 2.09
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Afap1Q80YS6 731 aa28.11■■■□□ 2.09
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Kank1E9Q238 1360 aa28.09■■■□□ 2.09
Ube2b-201ENSMUST00000020657 KdrP35918 1367 aa28.09■■■□□ 2.09
Ube2b-201ENSMUST00000020657 RictorQ6QI06 1708 aa28.08■■■□□ 2.08
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Dnajc5P60904 198 aa28.07■■■□□ 2.08
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Zfp444Q3TDV8 331 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
Ube2b-201ENSMUST00000020657 P3h3Q8CG70 732 aa28.07■■■□□ 2.08
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Anp32aO35381 247 aa28.06■■■□□ 2.08
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Dcaf11Q91VU6 549 aa28.06■■■□□ 2.08
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Ube2b-201ENSMUST00000020657 Itsn1Q9Z0R4 1714 aa28.05■■■□□ 2.08
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