RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019577.9

Gipc1-201, Transcript of PDZ domain-containing protein GIPC1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gipc1, Length 1,522 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Dip2bQ3UH60 1574 aa32,44■■■□□ 2,78
Gipc1-201ENSMUST00000019577 MlecQ6ZQI3 291 aaKnown RBP32,44■■■□□ 2,78
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Kif13aQ9EQW7 1749 aa32,42■■■□□ 2,78
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP32,42■■■□□ 2,78
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Ercc6l2Q9JIM3 1537 aa32,42■■■□□ 2,78
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Dapk1Q80YE7 1442 aa32,41■■■□□ 2,78
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Rims1Q99NE5 1463 aa32,41■■■□□ 2,78
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Itsn1Q9Z0R4 1714 aa32,4■■■□□ 2,78
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Kdm5aQ3UXZ9 1690 aa32,4■■■□□ 2,78
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Cep152A2AUM9 1736 aaKnown RBP32,39■■■□□ 2,78
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Plxnc1Q9QZC2 1574 aa32,39■■■□□ 2,77
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Wdr66E9Q743 1299 aa32,38■■■□□ 2,77
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Prrc2bQ7TPM1 1486 aaKnown RBP32,36■■■□□ 2,77
Gipc1-201ENSMUST00000019577 MyclP10166 368 aa32,34■■■□□ 2,77
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Naip7Q9JIB3 1402 aa32,34■■■□□ 2,77
Gipc1-201ENSMUST00000019577 PtprmP28828 1452 aa32,33■■■□□ 2,77
Gipc1-201ENSMUST00000019577 RalgapbQ8BQZ4 1484 aa32,33■■■□□ 2,77
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Rundc1Q0VDN7 615 aa32,32■■■□□ 2,76
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Chd2E9PZM4 1827 aaKnown RBP32,31■■■□□ 2,76
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Bcl9Q9D219 1425 aa32,3■■■□□ 2,76
Gipc1-201ENSMUST00000019577 4930407I10RikD3Z5T8 1512 aa32,29■■■□□ 2,76
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Card11Q8CIS0 1159 aa32,28■■■□□ 2,76
Gipc1-201ENSMUST00000019577 AU022751B1B0V2 589 aa32,27■■■□□ 2,76
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Myom1Q62234 1667 aaKnown RBP32,26■■■□□ 2,75
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Kdm2aP59997 1161 aa32,26■■■□□ 2,75
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Myo3aQ8K3H5 1613 aa32,25■■■□□ 2,75
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP32,23■■■□□ 2,75
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Os9Q8K2C7 672 aa32,22■■■□□ 2,75
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Zc3h13E9Q784 1729 aaKnown RBP32,22■■■□□ 2,75
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Gm20521D3Z5F7 333 aa32,21■■■□□ 2,75
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Gemin5Q8BX17 1502 aaKnown RBP32,19■■■□□ 2,74
Gipc1-201ENSMUST00000019577 ClspnQ80YR7 1315 aa32,19■■■□□ 2,74
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Slc52a2Q9D8F3 450 aa32,18■■■□□ 2,74
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Cdk5rap2Q8K389 1822 aa32,17■■■□□ 2,74
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP32,16■■■□□ 2,74
Gipc1-201ENSMUST00000019577 PplQ9R269 1755 aa32,16■■■□□ 2,74
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Sin3aQ60520 1274 aaKnown RBP32,13■■■□□ 2,73
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Fan1Q69ZT1 1020 aa32,13■■■□□ 2,73
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Txndc2Q6P902 515 aa32,12■■■□□ 2,73
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Topaz1E5FYH1 1653 aa32,12■■■□□ 2,73
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Eif2ak4Q9QZ05 1648 aa32,11■■■□□ 2,73
Gipc1-201ENSMUST00000019577 GphnQ8BUV3 769 aaKnown RBP32,1■■■□□ 2,73
Gipc1-201ENSMUST00000019577 P3h3Q8CG70 732 aa32,1■■■□□ 2,73
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Arhgef28P97433 1693 aa32,1■■■□□ 2,73
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Stard8Q8K031 1019 aa32,08■■■□□ 2,73
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Atp1b4Q99ME6 356 aa32,08■■■□□ 2,73
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP32,07■■■□□ 2,72
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Psme1P97371 249 aa32,06■■■□□ 2,72
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Sipa1l1Q8C0T5 1782 aa32,06■■■□□ 2,72
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Ncoa1P70365 1447 aa32,05■■■□□ 2,72
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Shq1Q7TMX5 569 aa32,04■■■□□ 2,72
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Rock2P70336 1388 aa32,03■■■□□ 2,72
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Setd1aE9PYH6 1716 aa32,02■■■□□ 2,72
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Nphp4P59240 1425 aa32,01■■■□□ 2,71
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Lrrc7Q80TE7 1490 aa32,01■■■□□ 2,71
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Sall2Q9QX96 1004 aa32■■■□□ 2,71
Gipc1-201ENSMUST00000019577 DnmbpQ6TXD4 1580 aa32■■■□□ 2,71
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Srcin1Q9QWI6 1250 aa32■■■□□ 2,71
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP31,99■■■□□ 2,71
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Usp40Q8BWR4 1235 aa31,99■■■□□ 2,71
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Dip2aQ8BWT5 1523 aa31,99■■■□□ 2,71
Gipc1-201ENSMUST00000019577 MaddQ80U28 1577 aa31,99■■■□□ 2,71
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Brwd3A2AHJ4 1799 aa31,98■■■□□ 2,71
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Gm13695A2AK44 830 aa31,98■■■□□ 2,71
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa31,96■■■□□ 2,71
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Q9D9H8 365 aa31,95■■■□□ 2,71
Gipc1-201ENSMUST00000019577 PalldQ9ET54 1408 aa31,95■■■□□ 2,71
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Lmtk3Q5XJV6 1424 aa31,93■■■□□ 2,7
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP31,93■■■□□ 2,7
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Pola1P33609 1465 aa31,92■■■□□ 2,7
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Slit3Q9WVB4 1523 aa31,92■■■□□ 2,7
Gipc1-201ENSMUST00000019577 IqubQ8CDK3 788 aa31,91■■■□□ 2,7
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Ift172Q6VH22 1749 aa31,9■■■□□ 2,7
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Rimbp3Q3V0F0 1606 aa31,87■■■□□ 2,69
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Zbtb4Q5F293 982 aa31,86■■■□□ 2,69
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Stag3O70576 1240 aa31,85■■■□□ 2,69
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa31,84■■■□□ 2,69
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Plekhg5Q66T02 1073 aa31,83■■■□□ 2,69
Gipc1-201ENSMUST00000019577 PzpQ61838 1495 aa31,83■■■□□ 2,69
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Stk26Q99JT2 416 aa31,82■■■□□ 2,68
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Asxl2Q8BZ32 1370 aa31,82■■■□□ 2,68
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Scaf11E9PZM7 1456 aaKnown RBP31,81■■■□□ 2,68
Gipc1-201ENSMUST00000019577 IghaA0A0A6YXW6 389 aa31,8■■■□□ 2,68
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Plekhg1F6S200 1446 aa31,8■■■□□ 2,68
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Utp14aQ640M1 767 aaKnown RBP31,78■■■□□ 2,68
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Pik3r4Q8VD65 1358 aa31,78■■■□□ 2,68
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Rims2Q9EQZ7 1530 aa31,76■■■□□ 2,67
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Phlpp1Q8CHE4 1687 aa31,73■■■□□ 2,67
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Cep170bQ80U49 1574 aa31,72■■■□□ 2,67
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Arap3Q8R5G7 1538 aa31,72■■■□□ 2,67
Gipc1-201ENSMUST00000019577 CenpjQ569L8 1344 aa31,69■■■□□ 2,66
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa31,69■■■□□ 2,66
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Pcgf6Q99NA9 353 aa31,69■■■□□ 2,66
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Cps1Q8C196 1500 aa31,69■■■□□ 2,66
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa31,67■■■□□ 2,66
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Slc24a1Q91WD8 1130 aa31,64■■■□□ 2,66
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Sbno1Q689Z5 1390 aa31,63■■■□□ 2,65
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Med1Q925J9 1575 aa31,62■■■□□ 2,65
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Scn4aQ9ER60 1841 aa31,59■■■□□ 2,65
Gipc1-201ENSMUST00000019577 InsrP15208 1372 aa31,59■■■□□ 2,65
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10,4 ms