RNA–Protein interactions for RNA: tT(UGU)Q1

tT(UGU)Q1, Transcript of Mitochondrial threonine tRNA (tRNA-Thr), yeastyeast

Gene tT(UGU)Q1, Length 76 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 DOC1P53068 250 aa1.06□□□□□ -2.24
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 PRM8P53174 237 aa1.06□□□□□ -2.24
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 NUP49Q02199 472 aa1.06□□□□□ -2.24
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 GAS3Q03655 524 aa1.06□□□□□ -2.24
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 YDR248CQ03786 193 aa1.06□□□□□ -2.24
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 RPL28P02406 149 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 RPL2AP0CX45 254 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 RPL2BP0CX46 254 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 FPR1P20081 114 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 YET1P35723 206 aa1.05□□□□□ -2.24
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 SKG1P36169 355 aa1.05□□□□□ -2.24
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 RTR1P40084 226 aaPredicted RBP1.05□□□□□ -2.24
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 FAR7P43592 221 aa1.05□□□□□ -2.24
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 SWP1Q02795 286 aa1.05□□□□□ -2.24
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 CYR1P08678 2026 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 TIM9O74700 87 aa1.04□□□□□ -2.24
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 BMH2P34730 273 aaKnown RBP1.04□□□□□ -2.24
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 APS1P35181 156 aa1.04□□□□□ -2.24
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 MRPL17P36528 281 aa1.04□□□□□ -2.24
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 UMP1P38293 148 aa1.04□□□□□ -2.24
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 GAA1P39012 614 aa1.04□□□□□ -2.24
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 RPL13BP40212 199 aaKnown RBP1.04□□□□□ -2.24
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 YNR077CP53758 84 aa1.04□□□□□ -2.24
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 MZM1Q03429 123 aaPredicted RBP1.04□□□□□ -2.24
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 RPL13AQ12690 199 aaPredicted RBP1.04□□□□□ -2.24
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 TSC3Q3E790 80 aa1.04□□□□□ -2.24
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 YBR121C-AP0C5L4 52 aa1.03□□□□□ -2.24
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 NHP6BP11633 99 aaKnown RBP1.03□□□□□ -2.24
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 SNC2P33328 115 aa1.03□□□□□ -2.24
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 UPS2P35200 230 aa1.03□□□□□ -2.24
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 RTC3P38804 111 aaPredicted RBP1.03□□□□□ -2.24
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 GVP36P40531 326 aaKnown RBP1.03□□□□□ -2.24
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 OTU1P43558 301 aa1.03□□□□□ -2.24
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 EAF6P47128 113 aa1.03□□□□□ -2.24
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 SAY1P53324 424 aa1.03□□□□□ -2.24
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 YKL183C-AQ3E765 70 aa1.03□□□□□ -2.24
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 SEY1Q99287 776 aa1.03□□□□□ -2.24
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 MET5P47169 1442 aa1.03□□□□□ -2.24
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 QCR8P08525 94 aa1.02□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 GPA2P10823 449 aa1.02□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 GCN3P14741 305 aa1.02□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 PBN1P25580 416 aa1.02□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 SEC17P32602 292 aa1.02□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 TCA17P32613 152 aa1.02□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 TMA19P35691 167 aaKnown RBP1.02□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 UTP30P36144 274 aaKnown RBP1.02□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 TCD1P38756 429 aa1.02□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 ERG28P40030 148 aa1.02□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 PDR18P53756 1333 aa1.02□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 TUS1Q06412 1307 aa1.02□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 MCP1Q12106 302 aa1.02□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 JLP1Q12358 412 aa1.02□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 IDH1P28834 360 aaKnown RBP RIP-Chip data1.01□□□□□ -2.25not detected
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 CBT1P36038 271 aaPredicted RBP1.01□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 RMD6P39975 231 aa1.01□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 YRB1P41920 201 aaKnown RBP1.01□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 ADO1P47143 340 aaKnown RBP1.01□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 MGA1P53050 456 aa1.01□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 ANT1Q06497 328 aa1.01□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 FSF1Q12029 327 aaKnown RBP1.01□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 KSS1P14681 368 aa1□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 STE18P18852 110 aa1□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 COQ1P18900 473 aa1□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 TFC1P32367 649 aa1□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 PRP18P33411 251 aaPredicted RBP1□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 PRX1P34227 261 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 YBR209WP38311 105 aa1□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 SIP3P38717 1229 aa1□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 AST2P39945 430 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 YNL194CP40169 301 aa1□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 ERJ5P43613 295 aaPredicted RBP1□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 IRC18P47056 224 aa1□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 RAD17P48581 401 aa1□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 YGR050CP53231 118 aa1□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 PDR17P53844 350 aa1□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 GPM2Q12008 311 aa1□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 YPL162CQ12042 273 aa1□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 YHR214C-EQ8TGK0 99 aa1□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 YFR032C-BQ8TGU2 87 aa1□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 NCB2Q92317 146 aa1□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 YDR157WA0A023PZE8 133 aa0.99□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 CPA1P07258 411 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 SEC4P07560 215 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 URA5P13298 226 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 BET1P22804 142 aa0.99□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 PTM1P32857 523 aa0.99□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 MSS2P40990 351 aa0.99□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 POP3P53833 195 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 YDR274CP87283 123 aa0.99□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 PET191Q02772 108 aa0.99□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 YDR249CQ03787 373 aa0.99□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 RIO1Q12196 484 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 RUD3Q12234 484 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 CDC33P07260 213 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 MGM101P32787 269 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 YBR285WP38354 144 aa0.98□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 GCN20P43535 752 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 KNH1P50112 268 aa0.98□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 ATG40Q99325 256 aa0.98□□□□□ -2.25
tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 YLR236CA0A023PZG4 107 aa0.97□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 50.7 ms