RNA–Protein interactions for RNA: YPL060C-A

YPL060C-A, Transcript of TyA Gag protein, yeastyeast

Gene YPL060C-A, Length 3,315 nt, Biotype pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL060C-AYPL060C-A ANT1Q06497 328 aa-0.48□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A MSA1Q08471 629 aa-0.48□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A CCA1P21269 546 aa-0.48□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A HMT1P38074 348 aa-0.48□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A YBR209WP38311 105 aa-0.48□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A AGX1P43567 385 aa-0.48□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A MET31Q03081 177 aa-0.48□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A EMI1Q04406 187 aa-0.48□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A SEC14P24280 304 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A POT1P27796 417 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.49□□□□□ -2.49not detected
YPL060C-AYPL060C-A AEP1P32493 518 aa-0.49□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A BLI1P35727 113 aa-0.49□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A YHL049CP38722 271 aa-0.49□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A YML096WQ04489 525 aa-0.49□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A HEM25Q07534 307 aa-0.49□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A HRD1Q08109 551 aa-0.49□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A YOR268CQ08734 132 aa-0.49□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A SMT3Q12306 101 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A PTM1P32857 523 aa-0.49□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A RPT5P33297 434 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A CSG2P35206 410 aa-0.49□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A TOS8P53147 276 aa-0.49□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A YAL064W-BO13512 126 aa-0.49□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A MRPL28P36527 147 aa-0.49□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A RIB1P38066 345 aa-0.49□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A PEX32P38292 413 aa-0.49□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A YHR127WP38833 243 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A LAP3Q01532 483 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.49□□□□□ -2.49not detected
YPL060C-AYPL060C-A MDY2Q12285 212 aa-0.49□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A SNC2P33328 115 aa-0.5□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A SRY1P36007 326 aa-0.5□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A VAB2P40003 282 aa-0.5□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A YFL051CP43552 160 aa-0.5□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A OST3P48439 350 aa-0.5□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A UTP6Q02354 440 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A CUE4Q04201 117 aaPredicted RBP-0.5□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A VAM10Q08474 114 aa-0.5□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A HIS2P38635 335 aa-0.5□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A HYR1P40581 163 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A YPT32P51996 222 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A YER189WP40104 122 aa-0.51□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A OKP1P53298 406 aa-0.51□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A MCH2P36032 473 aa-0.51□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A OPY1P38271 328 aa-0.51□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A RTT105P40063 208 aa-0.51□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A TIR3P40552 269 aa-0.51□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A OST6Q03723 332 aa-0.51□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A YLR422WQ06409 1932 aa-0.51□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A GCN1P33892 2672 aaKnown RBP-0.51□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A DDI2P0CH63 225 aa-0.51□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A DDI3P0CH64 225 aa-0.51□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A YBR063CP38083 404 aa-0.51□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A LSM5P40089 93 aaKnown RBP-0.51□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A MGA1P53050 456 aa-0.51□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A TRM12Q04235 462 aa-0.51□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A YPR174CQ06616 221 aaPredicted RBP-0.51□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A Q0255P03881 472 aa-0.52□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A PRE1P22141 198 aaKnown RBP-0.52□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A SVP26P38869 228 aa-0.52□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A AIM20P40451 204 aa-0.52□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A HAM1P47119 197 aaKnown RBP-0.52□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A BCP1Q06338 283 aa-0.52□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A YCT1Q12235 531 aa-0.52□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A CKS1P20486 150 aaKnown RBP-0.52□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A PRS4P38063 326 aaPredicted RBP-0.52□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A HSM3P38348 480 aa-0.52□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A YKL162CP36052 402 aa-0.53□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A MRX3P38172 270 aa-0.53□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A CDC40P40968 455 aaPredicted RBP-0.53□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A RPL24AP04449 155 aaKnown RBP-0.53□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A PET494P07390 489 aaPredicted RBP-0.53□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A GCD2P12754 651 aaPredicted RBP-0.53□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A UPS2P35200 230 aa-0.53□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A YGL185CP53100 379 aa-0.53□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A GTR2P53290 341 aa-0.53□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A ATC1Q04005 294 aa-0.53□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A PRM3Q08931 133 aa-0.53□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A AIM45Q12480 344 aaKnown RBP-0.53□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A IRA1P18963 3092 aa-0.53□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A BEM2P39960 2167 aaKnown RBP-0.53□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A YLR462WO13556 202 aa-0.53□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A YEL075CP39972 122 aa-0.53□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A CAT5P41735 233 aa-0.53□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A USE1P53146 245 aa-0.53□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A GMC2Q06201 188 aa-0.53□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A ERP4Q12450 207 aa-0.53□□□□□ -2.49
YPL060C-AYPL060C-A COX5AP00424 153 aa-0.54□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A POF1P25576 258 aa-0.54□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A INA22P40576 216 aa-0.54□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A PDR17P53844 350 aa-0.54□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A YNL122CP53921 115 aaPredicted RBP-0.54□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A RNH1Q04740 348 aa-0.54□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A PML1Q07930 204 aaPredicted RBP-0.54□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A MDM32Q12171 622 aa-0.54□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A PRX1P34227 261 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A BIG1P38813 335 aa-0.54□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A VPS45P38932 577 aa-0.54□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A CIN5P40917 295 aa-0.54□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A SNZ2P53824 298 aa-0.54□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A YOL107WQ12239 342 aa-0.54□□□□□ -2.5
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