RNA–Protein interactions for RNA: YML016C

PPZ1, Transcript of Serine/threonine protein phosphatase Z, isoform of Ppz2p, yeast

Gene PPZ1, Length 2,079 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PPZ1	YML016C	HIT1	P46973	164 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	ATG27	P46989	271 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	UFD1	P53044	361 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	GIM3	P53900	129 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	CAB5	Q03941	241 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	RDR1	Q08904	546 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	RAX2	Q12465	1220 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	YMR084W	A2P2R3	262 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	STE7	P06784	515 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	ATP5	P09457	212 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	PCL1	P24867	279 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	CPR4	P25334	318 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	UMP1	P38293	148 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	BDH1	P39714	382 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	RCE1	Q03530	315 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	UPS3	Q04006	179 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	FSH2	Q05015	223 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	FRQ1	Q06389	190 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	REX3	Q12090	404 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	YDL211C	Q12121	372 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	ERV2	Q12284	196 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	AHC1	Q12433	566 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	IZH2	Q12442	317 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	MSB2	P32334	1306 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.38	□□□□□ -1.87	not detected
PPZ1	YML016C	YLL053C	P0CD98	152 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	PAU19	P0CE85	124 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	PAU21	P0CE86	164 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	PAU22	P0CE87	164 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	PAU3	P25610	124 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	SSH4	P32343	579 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	TIM12	P32830	109 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	DAD2	P36162	133 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	ELO1	P39540	310 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	YEA4	P40004	342 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	YIL067C	P40514	678 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	BRR6	P53062	197 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	YDR366C	P87287	132 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	FRE7	Q12333	620 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	YLR118C	Q12354	227 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	YLR111W	Q12528	110 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	COA2	Q3E823	68 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	COA6	Q3E846	104 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	CHO1	P08456	276 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	HAP3	P13434	144 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	SPO13	P23624	291 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	LSB5	P25369	354 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	HMT1	P38074	348 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	ANS1	P38832	159 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	HSP10	P38910	106 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	SLZ1	P40167	298 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	PHS1	P40857	217 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	PAU5	P43575	122 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	BNA1	P47096	177 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	YGR066C	P53242	292 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	ATC1	Q04005	294 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	TVP18	Q04767	167 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	YDL242W	Q07746	117 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	SUL2	Q12325	893 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	SCS22	Q6Q595	175 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	YSR3	P23501	404 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	ERG3	P32353	365 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	TRS65	P32893	560 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	AIM29	P36154	155 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	IRC22	P40006	225 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	GWT1	P47026	490 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	THI74	Q04083	370 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	YML096W	Q04489	525 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	ATG10	Q07879	167 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	RFU1	Q08003	200 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	MSW1	P04803	379 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	OPI3	P05375	206 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PPZ1	YML016C	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87

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