RNA–Protein interactions for RNA: YJL192C

SOP4, Transcript of ER-membrane protein, yeastyeast

Gene SOP4, Length 705 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SOP4YJL192C YGR149WP48236 432 aa3.35□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C RMD9P53140 646 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C YGR042WP53227 271 aa3.35□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C TRM112P53738 135 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C CSL4P53859 292 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C DIG2Q03373 323 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C YML018CQ03730 393 aa3.35□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C RFU1Q08003 200 aa3.35□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C CSM4Q08955 156 aa3.35□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C FCF2Q12035 217 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C ORT1Q12375 292 aa3.35□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C YLR146W-AQ2V2P1 62 aa3.35□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C YDL007C-AQ2V2Q0 85 aa3.35□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C DET1Q99288 334 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C STE7P06784 515 aa3.34□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C QCR2P07257 368 aa3.34□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C YSR3P23501 404 aa3.34□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C SUA7P29055 345 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C MDH3P32419 343 aaKnown RBP RIP-Chip data3.34□□□□□ -1.87not detected
SOP4YJL192C YKL187CP34231 750 aa3.34□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C YKL075CP36083 450 aa3.34□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C UMP1P38293 148 aa3.34□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C SSH1P38353 490 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C YPT35P38815 214 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C YHR127WP38833 243 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C FLO5P38894 1075 aa3.34□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C YIR016WP40572 265 aa3.34□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C SMD3P43321 101 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C ATG27P46989 271 aa3.34□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C FLC3P53121 802 aa3.34□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C ADD37Q03233 198 aa3.34□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C THI74Q04083 370 aa3.34□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C MRPL1Q04599 285 aa3.34□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C YML053CQ04978 212 aa3.34□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C RRT7Q07829 113 aa3.34□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C YOR365CQ08844 703 aa3.34□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C REX3Q12090 404 aa3.34□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C YCT1Q12235 531 aa3.34□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C MCT1Q12283 360 aa3.34□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C SRN2Q99176 213 aa3.34□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C COX5BP00425 151 aa3.33□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C MSW1P04803 379 aa3.33□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C GDH1P07262 454 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C RPS25BP0C0T4 108 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C YER190C-BP0CX94 160 aa3.33□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C YEL077W-AP0CX95 160 aa3.33□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C YGR296C-BP0CX96 160 aa3.33□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C YPL283W-BP0CX97 160 aa3.33□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C YPR204C-AP0CX98 160 aa3.33□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C YFL068WP0CX99 160 aa3.33□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C YLL066W-AP0CY00 160 aa3.33□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C YLL067W-AP0CY01 160 aa3.33□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C PDX1P16451 410 aa3.33□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C GEX1P25596 615 aa3.33□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C IDH2P28241 369 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C UTR5P32630 166 aa3.33□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C ALK2P32789 676 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C DRE2P36152 348 aa3.33□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C GEX2P36173 615 aa3.33□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C MRPL11P36521 249 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C CBP4P37267 147 aa3.33□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C HEM14P40012 539 aa3.33□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C YIL161WP40449 235 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C YFR020WP43600 232 aa3.33□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C GWT1P47026 490 aa3.33□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C IKS1P47042 667 aa3.33□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C GPI14P47088 403 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C UBP8P50102 471 aa3.33□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C YNR066CP53752 436 aa3.33□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C RNH201P53942 307 aa3.33□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C CTF19Q02732 369 aa3.33□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C PIR1Q03178 341 aa3.33□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C YMR082CQ04276 118 aa3.33□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C GMC1Q04399 608 aa3.33□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C YPR114WQ06107 315 aa3.33□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C NMA1Q06178 401 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C SNA4Q07549 140 aa3.33□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C VAM3Q12241 283 aa3.33□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C SUL2Q12325 893 aa3.33□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C RPS25AQ3E792 108 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C FLO9P39712 1322 aa3.33□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C RIP1P08067 215 aa3.32□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C DAL82P21705 255 aa3.32□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C YCR007CP25354 239 aa3.32□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C MTR2P34232 184 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C YBR096WP38256 230 aa3.32□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C IML3P38265 245 aa3.32□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C PFS1P38872 237 aa3.32□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C YER188WP40103 239 aa3.32□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C APQ12P40532 138 aa3.32□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C CDC40P40968 455 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C ZIM17P42844 174 aa3.32□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C YJR011CP47086 261 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C EAF6P47128 113 aa3.32□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C BXI1P48558 297 aa3.32□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C ERG25P53045 309 aa3.32□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C PAU4P53427 120 aa3.32□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C YDR366CP87287 132 aa3.32□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C ROY1Q04847 553 aa3.32□□□□□ -1.88
SOP4YJL192C RTN1Q04947 295 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
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