RNA–Protein interactions for RNA: YHR167W

THP2, Transcript of Subunit of the THO and TREX complexes, yeast

Gene THP2, Length 786 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
THP2	YHR167W	UTR1	P21373	530 aa		2.68	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	MDH2	P22133	377 aa		2.68	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	SMP1	P38128	452 aa		2.68	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	NVJ1	P38881	321 aa		2.68	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	RTT105	P40063	208 aa		2.68	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	YCH1	P42937	148 aa		2.68	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	BNA6	P43619	295 aa		2.68	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	RPE1	P46969	238 aa		2.68	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	YGL101W	P53144	215 aa		2.68	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	MNT4	P53745	580 aa		2.68	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	YDR209C	Q03480	137 aa		2.68	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	OST6	Q03723	332 aa		2.68	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	YMR252C	Q04814	134 aa		2.68	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	DCR2	Q05924	578 aa		2.68	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	GAS2	Q06135	555 aa		2.68	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	SIA1	Q12212	622 aa		2.68	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	RAX2	Q12465	1220 aa		2.68	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	YOS9	Q99220	542 aa		2.68	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		2.67	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	TFS1	P14306	219 aa		2.67	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	GPX1	P36014	167 aa		2.67	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.67	□□□□□ -1.98	not detected
THP2	YHR167W	YKL071W	P36086	256 aa		2.67	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	DTR1	P38125	572 aa		2.67	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	MOB2	P43563	287 aa		2.67	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	IGO1	P53897	168 aa		2.67	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	PET191	Q02772	108 aa		2.67	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	MRX11	Q03079	207 aa		2.67	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	YPL039W	Q03080	316 aa		2.67	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	ELP6	Q04868	273 aa		2.67	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	MRX8	Q05473	314 aa		2.67	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	COQ10	Q08058	207 aa		2.67	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	REX3	Q12090	404 aa		2.67	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	MCP1	Q12106	302 aa		2.67	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	FAB1	P34756	2278 aa		2.67	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	REP1	P03871	373 aa		2.66	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	HXT2	P23585	541 aa		2.66	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	MAL32	P38158	584 aa		2.66	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	PEX18	P38855	283 aa		2.66	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	HPA3	P39979	161 aa		2.66	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	DLS1	P40366	167 aa		2.66	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	STB1	P42845	420 aa		2.66	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	LOH1	P47055	219 aa		2.66	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	YGR042W	P53227	271 aa		2.66	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	MAL12	P53341	584 aa		2.66	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	BNA7	Q04066	261 aa		2.66	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	YLR173W	Q06247	608 aa		2.66	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	YDL180W	Q12301	547 aa		2.66	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	SUS1	Q6WNK7	96 aa		2.66	□□□□□ -1.98
THP2	YHR167W	SIR2	P06700	562 aa		2.65	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	PHO80	P20052	293 aa		2.65	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	2.65	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	COS8	P38723	381 aa		2.65	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	SER2	P42941	309 aa		2.65	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	MNN5	P46982	586 aa		2.65	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	DOC1	P53068	250 aa		2.65	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	NRK1	P53915	240 aa		2.65	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	RSM10	Q03201	203 aa		2.65	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	GPI17	Q04080	534 aa		2.65	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	YPR127W	Q06494	345 aa		2.65	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	YPL278C	Q08990	100 aa		2.65	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	APC2	Q12440	853 aa		2.65	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	YOR343C	Q12484	108 aa		2.65	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		2.65	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	COX5B	P00425	151 aa		2.64	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	STP22	P25604	385 aa		2.64	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	AHC2	P25649	128 aa		2.64	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	EHD3	P28817	500 aa		2.64	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	SUR1	P33300	382 aa		2.64	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	RCN1	P36054	211 aa		2.64	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	PAU24	P38155	120 aa		2.64	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	FIG1	P38224	298 aa		2.64	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	2.64	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	ALP1	P38971	573 aa		2.64	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	YER184C	P39961	794 aa		2.64	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	RRT13	P40042	185 aa		2.64	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	YER121W	P40076	114 aa		2.64	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	DDI1	P40087	428 aa		2.64	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	AIM20	P40451	204 aa		2.64	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	UBC13	P52490	153 aa		2.64	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	PAU12	P53343	120 aa		2.64	□□□□□ -1.99

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