RNA–Protein interactions for RNA: YGR246C

BRF1, Transcript of TFIIIB B-related factor, yeast

Gene BRF1, Length 1,791 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BRF1	YGR246C	YDL086W	Q07505	273 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	YAL064W-B	O13512	126 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	SPO7	P18410	259 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	YBL010C	P32788	280 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	SEF1	P34228	1148 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	XBP1	P40489	647 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	CIN5	P40917	295 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	HXT14	P42833	540 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	SNO3	P43544	222 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	PKP2	P53170	491 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	YGR126W	P53274	230 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	SNO1	Q03144	224 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	THI74	Q04083	370 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	FIT1	Q04433	528 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	CTS2	Q06350	511 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	COX19	Q3E731	98 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	UBA3	Q99344	299 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	VPS63	O13549	108 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	YCR006C	P25350	157 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	4.63	□□□□□ -1.67	not detected
BRF1	YGR246C	YEA4	P40004	342 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	CFD1	P40558	293 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	IRC24	P40580	263 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	MOB2	P43563	287 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	YJR056C	P47115	236 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	SSN8	P47821	323 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	YGR045C	P53229	120 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	MRPL22	P53881	309 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	HHT1	P61830	136 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	YPL039W	Q03080	316 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	FRE7	Q12333	620 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	AGA2	P32781	87 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	ERV15	P38312	142 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	OM14	P38325	134 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	AVT4	P50944	713 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	VPS28	Q02767	242 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	TMA23	Q03525	211 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	TRI1	Q05024	226 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	ASM4	Q05166	528 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	MDM30	Q05930	598 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	SWM1	Q12379	170 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	YLR302C	O13544	120 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	CDC7	P06243	507 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	RMD6	P39975	231 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	NSE4	P43124	402 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	CTK2	P46962	323 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	GWT1	P47026	490 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	YNR066C	P53752	436 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	FYV6	P53913	173 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	YMR253C	Q04835	414 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	SNF5	P18480	905 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	SIP1	P32578	815 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	CLB6	P32943	380 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	RIB5	P38145	238 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	YBR096W	P38256	230 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	SLM6	P38343	150 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	YBR292C	P38357	123 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	YPS6	P40583	537 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	RSM23	Q01163	450 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
BRF1	YGR246C	YDR102C	Q03864	110 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	BLM10	P43583	2143 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	COX1	P00401	534 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	PEX4	P29340	183 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	MRPL4	P36517	319 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	SDH4	P37298	181 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	SLM1	P40485	686 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	DAN1	P47178	298 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	PGU1	P47180	361 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	PEF1	P53238	335 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	YNR048W	P53740	393 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	DIA1	P54005	336 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	ADD37	Q03233	198 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	YMR279C	Q03263	540 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.59	□□□□□ -1.67	not detected
BRF1	YGR246C	COX5B	P00425	151 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BRF1	YGR246C	YCR101C	P25607	182 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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