RNA–Protein interactions for RNA: YGL073W

HSF1, Transcript of Trimeric heat shock transcription factor, yeast

Gene HSF1, Length 2,502 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HSF1	YGL073W	TAO3	P40468	2376 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	YAL064W-B	O13512	126 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	MRS4	P23500	304 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	LSB5	P25369	354 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	YER010C	P40011	234 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	GET2	P40056	285 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	MSY1	P48527	492 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	PAU4	P53427	120 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	BSC5	P53755	489 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	YNL165W	P53891	406 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	YDL242W	Q07746	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	YPL264C	Q08980	353 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	YOR015W	Q12169	119 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	FRE8	Q12209	686 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	YOP1	Q12402	180 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	COA6	Q3E846	104 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	YCR006C	P25350	157 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	AHT1	P29589	182 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	RPB7	P34087	171 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	SNO3	P43544	222 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	YJL016W	P47072	561 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	AIM24	P47127	394 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	TDA6	Q06466	467 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	SWM1	Q12379	170 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	DCN1	Q12395	269 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	FLO9	P39712	1322 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	CDC50	P25656	391 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	SCM4	P32564	187 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	REC114	P32841	428 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	MNS1	P32906	549 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	FLO5	P38894	1075 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	PEX7	P39108	375 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	YND1	P40009	630 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	YGL114W	P53134	725 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	CYT2	Q00873	224 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	ACS1	Q01574	713 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	YDC1	Q02896	317 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	TPP1	Q03796	238 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	DAP1	Q12091	152 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	AGC1	Q12482	902 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	HUT1	Q12520	339 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
HSF1	YGL073W	ERV1	P27882	189 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	YUH1	P35127	236 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	MRPL28	P36527	147 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	HSP10	P38910	106 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	PGU1	P47180	361 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	RFU1	Q08003	200 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	RAX2	Q12465	1220 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	FIG1	P38224	298 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	PAU5	P43575	122 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	YJR115W	P47152	169 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	NIS1	P53939	407 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	YDR102C	Q03864	110 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	YDR387C	Q04162	555 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	COX1	P00401	534 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	COX5B	P00425	151 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	SPS4	P09937	338 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	PAU1	P0CE88	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	PAU14	P0CE89	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	PAU6	P0CE90	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	PAU18	P0CE91	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	PAU8	P0CE92	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	PAU11	P0CE93	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	PAU13	P38725	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	SKO1	Q02100	647 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	PAU10	Q03050	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	GIS1	Q03833	894 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	PAU20	Q08322	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	PAU9	Q3E770	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	MRPL44	P19956	98 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	CWP1	P28319	239 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	DAL3	P32459	195 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	COX15	P40086	486 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	CFD1	P40558	293 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	TRS23	Q03784	219 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	FCY22	Q12119	530 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HSF1	YGL073W	YLL053C	P0CD98	152 aa		4.84	□□□□□ -1.64
HSF1	YGL073W	PCL1	P24867	279 aa		4.84	□□□□□ -1.64
HSF1	YGL073W	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.64
HSF1	YGL073W	CPR5	P35176	225 aa		4.84	□□□□□ -1.64
HSF1	YGL073W	EDS1	P38073	919 aa		4.84	□□□□□ -1.64
HSF1	YGL073W	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.64
HSF1	YGL073W	YOR186W	Q08560	144 aa		4.84	□□□□□ -1.64

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