RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 RCN1Q15293 331 aa21.75■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 C2CD6Q53TS8 623 aa21.75■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 SEMA4DQ92854 862 aa21.75■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 MROH7Q68CQ1 1323 aa21.75■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP21.75■■□□□ 1.072e-7■■■□□ 15.6
PMS1-222ENST00000639501 RALAP11233 206 aa21.75■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 RCN2Q14257 317 aa21.75■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 SLFN13Q68D06 897 aa21.75■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa21.75■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 CLNKQ7Z7G1 428 aa21.75■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 GLIS1Q8NBF1 620 aa21.75■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 ATL2Q8NHH9 583 aa21.75■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 GRK7Q8WTQ7 553 aa21.75■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 CCDC77Q9BR77 488 aa21.75■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 TMEM117Q9H0C3 514 aa21.75■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 SEL1LQ9UBV2 794 aa21.75■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 A0A1W2PPM1 405 aa21.74■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 BMP3P12645 472 aa21.74■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 AMNQ9BXJ7 453 aa21.74■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 TUFT1Q9NNX1 390 aa21.74■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 SAYSD1Q9NPB0 183 aa21.74■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 STK24Q9Y6E0 443 aa21.74■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 A0A1B0GVG6 124 aa21.74■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 K7ENM7 598 aa21.74■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 ECE2O60344 883 aa21.74■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 CA4P22748 312 aa21.74■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 CNGA1P29973 690 aa21.74■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 ADSSP30520 456 aa21.74■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 MAPK4P31152 587 aa21.74■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 CDR2Q01850 454 aa21.74■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 SNX30Q5VWJ9 437 aa21.74■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 PCNX4Q63HM2 1172 aa21.74■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 IRGCQ6NXR0 463 aa21.74■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 SLF2Q8IX21 1173 aa21.74■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 SPIRE2Q8WWL2 714 aa21.74■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 CAMKK2Q96RR4 588 aa21.74■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 KRT15P19012 456 aa21.73■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 VHLP40337 213 aa21.73■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 MXI1P50539 228 aa21.73■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 P3H1Q32P28 736 aa21.73■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 ACSBG2Q5FVE4 666 aa21.73■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 RELL1Q8IUW5 271 aa21.73■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 SHC3Q92529 594 aa21.73■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 PLVAPQ9BX97 442 aa21.73■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 DCTN4Q9UJW0 460 aa21.73■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 GRIN3BO60391 1043 aa21.73■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 RASSF2P50749 326 aa21.73■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 OVGP1Q12889 678 aa21.73■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 MAPK6Q16659 721 aa21.73■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa21.73■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 ZNF365Q70YC5 407 aa21.73■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 RFWD2Q8NHY2 731 aa21.73■■□□□ 1.07
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PMS1-222ENST00000639501 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa21.73■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP21.73■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 ATP9AO75110 1047 aa21.72■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 PSMD10O75832 226 aa21.72■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 ABHD2P08910 425 aa21.72■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 FDX1P10109 184 aa21.72■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 MAN1A1P33908 653 aa21.72■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 UBXN2AP68543 259 aa21.72■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 GTF2IP78347 998 aa21.72■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 DEFB132Q7Z7B7 95 aa21.72■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 FBXO11Q86XK2 927 aa21.72■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 ZFPM1Q8IX07 1006 aa21.72■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 KIFAP3Q92845 792 aa21.72■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 ARL8BQ9NVJ2 186 aa21.72■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 F5H6K3 240 aa21.72■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 TYROBPO43914 113 aa21.72■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 ADRB2P07550 413 aa21.72■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 KLRC2P26717 231 aa21.72■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 CETN1Q12798 172 aa21.72■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 CCDC6Q16204 474 aa21.72■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 SLC45A4Q5BKX6 768 aa21.72■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 STOML1Q9UBI4 398 aa21.72■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 LRCH1Q9Y2L9 728 aa21.72■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 GOLGA8IPA6NC78 632 aa21.71■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 GOLGA8JA6NMD2 632 aa21.71■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 C2CD2LO14523 706 aa21.71■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa21.71■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 NFIAQ12857 509 aa21.71■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 LVRNQ6Q4G3 990 aa21.71■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 MTHFD1LQ6UB35 978 aa21.71■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 DTX3LQ8TDB6 740 aa21.71■■□□□ 1.07
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