RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601392.5

CELF4-222, Transcript of CUGBP Elav-like family member 4, human

TSL 1 (best)

Gene CELF4, Length 989 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CELF4-222	ENST00000601392	CYP3A5	P20815	502 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	WNT7B	P56706	349 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	OSTN	P61366	133 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	FIBCD1	Q8N539	461 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	TAF4B	Q92750	862 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	SNX27	Q96L92	541 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	PANX2	Q96RD6	677 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	ADAM2	Q99965	735 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	SIX2	Q9NPC8	291 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	GCNT4	Q9P109	453 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	THEG	Q9P2T0	379 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	COL4A6	Q14031	1691 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392		C9IYK1	514 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	ENPP3	O14638	875 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	INPPL1	O15357	1258 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	MFAP3L	O75121	409 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	ITGA4	P13612	1032 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	UCHL3	P15374	230 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	ATIC	P31939	592 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	CASP14	P31944	242 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	TC2N	Q8N9U0	490 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	SAMD11	Q96NU1	681 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	DNAJC7	Q99615	494 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	GAN	Q9H2C0	597 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	PTPRJ	Q12913	1337 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	MGEA5	O60502	916 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	PHACTR2	O75167	634 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	RECQL4	O94761	1208 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	FECH	P22830	423 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	KRT9	P35527	623 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	GCNT1	Q02742	428 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	WDR44	Q5JSH3	913 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	JADE1	Q6IE81	842 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	CXorf38	Q8TB03	319 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	BAP1	Q92560	729 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	FAM212A	Q96EL1	285 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	STK33	Q9BYT3	514 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	RNF39	Q9H2S5	420 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	PARP2	Q9UGN5	583 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	TTC3	P53804	2025 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	NRDC	O43847	1150 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	VNN1	O95497	513 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	HLA-DRA	P01903	254 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	PAX3	P23760	479 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	CTNNB1	P35222	781 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	KLK7	P49862	253 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	MFAP3	P55082	362 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	RBP5	P82980	135 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	CDK17	Q00537	523 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	BIRC3	Q13489	604 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	NCOA4	Q13772	614 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	PTPRO	Q16827	1216 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21

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