RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564105.5

CTU2-204, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CTU2, Length 1,586 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-204ENST00000564105 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 TUSC3Q13454 348 aa20.63■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 TRIM65Q6PJ69 517 aa20.63■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 VSTM4Q8IW00 320 aa20.63■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 AGAP1Q9UPQ3 857 aa20.63■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 EYSQ5T1H1 3165 aa20.63■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 TSC2P49815 1807 aa20.63■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 CLSTN1O94985 981 aa20.63■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 LRPAP1P30533 357 aa20.63■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 MYL6P60660 151 aa20.63■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 C9orf57Q5W0N0 161 aa20.63■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 DEFB123Q8N688 67 aa20.63■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 PI4K2AQ9BTU6 479 aa20.63■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP20.63■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa20.63■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 ANO9A1A5B4 782 aa20.62■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 CASTOR2A6NHX0 329 aa20.62■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 DDHD2O94830 711 aa20.62■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 CDC25BP30305 580 aa20.62■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 C9orf50Q5SZB4 431 aa20.62■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 TMC6Q7Z403 805 aa20.62■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 ZNF280BQ86YH2 543 aa20.62■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 CCDC150Q8NCX0 1101 aa20.62■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 NEK11Q8NG66 645 aa20.62■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 SLC9A7Q96T83 725 aa20.62■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 IMPG2Q9BZV3 1241 aa20.62■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 CACNG4Q9UBN1 327 aa20.62■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 ITIH6Q6UXX5 1313 aa20.61■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 PIRO00625 290 aa20.61■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 PPEF2O14830 753 aa20.61■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 CLCNKBP51801 687 aa20.61■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 DSC1Q08554 894 aa20.61■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 LRMPQ12912 555 aa20.61■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 SHHQ15465 462 aa20.61■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa20.61■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 WDR44Q5JSH3 913 aa20.61■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa20.61■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 DRC7Q8IY82 874 aa20.61■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 LRRC43Q8N309 656 aa20.61■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 ELMO3Q96BJ8 720 aa20.61■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 SIX2Q9NPC8 291 aa20.61■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 PLCB1Q9NQ66 1216 aa20.61■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa20.6■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP20.6■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 ASS1P00966 412 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 ATICP31939 592 aa20.6■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 RPL9P32969 192 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 APBA1Q02410 837 aa20.6■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 ZNF699Q32M78 642 aa20.6■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 RASIP1Q5U651 963 aa20.6■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 SPOPLQ6IQ16 392 aa20.6■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa20.6■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 COLGALT2Q8IYK4 626 aa20.6■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 HPDLQ96IR7 371 aa20.6■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 UROC1Q96N76 676 aa20.6■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 NT5C1BQ96P26 610 aa20.6■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa20.6■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 MYO9BQ13459 2157 aa20.6■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 PODXLO00592 558 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 B4GALT3O60512 393 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 GJB5O95377 273 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 NOP14P78316 857 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 MYO1EQ12965 1108 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 UPP1Q16831 310 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 LRRC52Q8N7C0 313 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 TAF4BQ92750 862 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 TATDN2Q93075 761 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 ZNF560Q96MR9 790 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 YME1L1Q96TA2 773 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 PAAF1Q9BRP4 392 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 ZBED2Q9BTP6 218 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 XYLT2Q9H1B5 865 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 APEX2Q9UBZ4 518 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 DNAJB4Q9UDY4 337 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 NOL4O94818 638 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 RABGGTAQ92696 567 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 NUP58Q9BVL2 599 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 GANQ9H2C0 597 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 MTMR10Q9NXD2 777 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 HCSTQ9UBK5 93 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 NUB1Q9Y5A7 615 aa20.59■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 UNC80Q8N2C7 3258 aa20.58■□□□□ 0.89
CTU2-204ENST00000564105 EPHB6O15197 1021 aa20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.1 ms