RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa10.55□□□□□ -0.72
CS-217ENST00000550044 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
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CS-217ENST00000550044 GLMNQ92990 594 aa10.55□□□□□ -0.72
CS-217ENST00000550044 CCDC51Q96ER9 411 aa10.55□□□□□ -0.72
CS-217ENST00000550044 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
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CS-217ENST00000550044 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
CS-217ENST00000550044 ADPGKQ9BRR6 497 aa10.55□□□□□ -0.72
CS-217ENST00000550044 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa10.55□□□□□ -0.72
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CS-217ENST00000550044 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa10.55□□□□□ -0.72
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CS-217ENST00000550044 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
CS-217ENST00000550044 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP10.54□□□□□ -0.72
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CS-217ENST00000550044 NPR3P17342 541 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-217ENST00000550044 LAG3P18627 525 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-217ENST00000550044 NMT1P30419 496 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
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CS-217ENST00000550044 BCAR1P56945 870 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-217ENST00000550044 OSTNP61366 133 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-217ENST00000550044 NUCB2P80303 420 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-217ENST00000550044 STRN3Q13033 797 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-217ENST00000550044 ST3GAL2Q16842 350 aa10.54□□□□□ -0.72
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CS-217ENST00000550044 RESP18Q5W5W9 173 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-217ENST00000550044 HACE1Q8IYU2 909 aa10.54□□□□□ -0.72
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CS-217ENST00000550044 CASP10Q92851 521 aa10.54□□□□□ -0.72
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CS-217ENST00000550044 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
CS-217ENST00000550044 RTP3Q9BQQ7 232 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-217ENST00000550044 TCHPQ9BT92 498 aa10.54□□□□□ -0.72
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CS-217ENST00000550044 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
CS-217ENST00000550044 CXCL16Q9H2A7 254 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-217ENST00000550044 ADAM7Q9H2U9 754 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-217ENST00000550044 SEMA4AQ9H3S1 761 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-217ENST00000550044 UBN1Q9NPG3 1134 aa10.54□□□□□ -0.72
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CS-217ENST00000550044 TBC1D7Q9P0N9 293 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-217ENST00000550044 DNAJB4Q9UDY4 337 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-217ENST00000550044 FBXL21Q9UKT6 434 aa10.54□□□□□ -0.72
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CS-217ENST00000550044 GDAQ9Y2T3 454 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-217ENST00000550044 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa10.54□□□□□ -0.72
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CS-217ENST00000550044 K7ENM7 598 aa10.53□□□□□ -0.72
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CS-217ENST00000550044 HARSP12081 509 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
CS-217ENST00000550044 MTHFRP42898 656 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-217ENST00000550044 SCNN1GP51170 649 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-217ENST00000550044 ZNF131P52739 623 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-217ENST00000550044 NCKAP1LP55160 1127 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-217ENST00000550044 ITIH3Q06033 890 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-217ENST00000550044 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
CS-217ENST00000550044 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
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CS-217ENST00000550044 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-217ENST00000550044 SIX5Q8N196 739 aa10.53□□□□□ -0.72
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CS-217ENST00000550044 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
CS-217ENST00000550044 RUBCNQ92622 972 aa10.53□□□□□ -0.72
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CS-217ENST00000550044 BICD1Q96G01 975 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-217ENST00000550044 SPG21Q9NZD8 308 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-217ENST00000550044 KANSL3Q9P2N6 904 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-217ENST00000550044 TNFSF13BQ9Y275 285 aa10.53□□□□□ -0.72
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CS-217ENST00000550044 MYH15Q9Y2K3 1946 aa10.52□□□□□ -0.72
CS-217ENST00000550044 H0YCG3 227 aa10.52□□□□□ -0.73
CS-217ENST00000550044 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
CS-217ENST00000550044 SIAH2O43255 324 aa10.52□□□□□ -0.73
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CS-217ENST00000550044 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP10.52□□□□□ -0.73
CS-217ENST00000550044 AFMP43652 599 aa10.52□□□□□ -0.73
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CS-217ENST00000550044 ADALQ6DHV7 355 aa10.52□□□□□ -0.73
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