RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547298.5

CS-208, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-208ENST00000547298 PIP4P1Q86T03 277 aa12.48□□□□□ -0.41
CS-208ENST00000547298 TMC8Q8IU68 726 aa12.48□□□□□ -0.41
CS-208ENST00000547298 C4orf19Q8IY42 314 aa12.48□□□□□ -0.41
CS-208ENST00000547298 YAF2Q8IY57 180 aa12.48□□□□□ -0.41
CS-208ENST00000547298 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa12.48□□□□□ -0.41
CS-208ENST00000547298 HHIPQ96QV1 700 aa12.48□□□□□ -0.41
CS-208ENST00000547298 MTRQ99707 1265 aa12.48□□□□□ -0.41
CS-208ENST00000547298 SLC8A2Q9UPR5 921 aa12.48□□□□□ -0.41
CS-208ENST00000547298 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
CS-208ENST00000547298 TBX3O15119 743 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-208ENST00000547298 RECQL4O94761 1208 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-208ENST00000547298 P4HBP07237 508 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
CS-208ENST00000547298 GLRA2P23416 452 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-208ENST00000547298 FAM193AP78312 1265 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-208ENST00000547298 SCAPQ12770 1279 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-208ENST00000547298 TWF1Q12792 350 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-208ENST00000547298 PPP2R5CQ13362 524 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-208ENST00000547298 UPP1Q16831 310 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-208ENST00000547298 UAP1L1Q3KQV9 507 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-208ENST00000547298 CREB3L3Q68CJ9 461 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-208ENST00000547298 PMS2CLQ68D20 193 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-208ENST00000547298 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
CS-208ENST00000547298 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
CS-208ENST00000547298 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
CS-208ENST00000547298 TMEM209Q96SK2 561 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-208ENST00000547298 GPR88Q9GZN0 384 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-208ENST00000547298 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
CS-208ENST00000547298 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
CS-208ENST00000547298 IGSF10Q6WRI0 2623 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-208ENST00000547298 PCNX2A6NKB5 2137 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-208ENST00000547298 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
CS-208ENST00000547298 SLC37A4O43826 429 aa12.46□□□□□ -0.41
CS-208ENST00000547298 ARPP19P56211 112 aa12.46□□□□□ -0.41
CS-208ENST00000547298 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
CS-208ENST00000547298 TFDP1Q14186 410 aa12.46□□□□□ -0.41
CS-208ENST00000547298 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa12.46□□□□□ -0.41
CS-208ENST00000547298 XKR9Q5GH70 373 aa12.46□□□□□ -0.41
CS-208ENST00000547298 IQCEQ6IPM2 695 aa12.46□□□□□ -0.41
CS-208ENST00000547298 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa12.46□□□□□ -0.41
CS-208ENST00000547298 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
CS-208ENST00000547298 GLIS3Q8NEA6 775 aa12.46□□□□□ -0.41
CS-208ENST00000547298 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
CS-208ENST00000547298 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
CS-208ENST00000547298 LXNQ9BS40 222 aa12.46□□□□□ -0.41
CS-208ENST00000547298 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
CS-208ENST00000547298 PDZD7Q9H5P4 517 aa12.46□□□□□ -0.41
CS-208ENST00000547298 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa12.46□□□□□ -0.41
CS-208ENST00000547298 ASAH2Q9NR71 780 aa12.46□□□□□ -0.41
CS-208ENST00000547298 RGL1Q9NZL6 768 aa12.46□□□□□ -0.41
CS-208ENST00000547298 EBF1Q9UH73 591 aa12.46□□□□□ -0.41
CS-208ENST00000547298 FBXL5Q9UKA1 691 aa12.46□□□□□ -0.41
CS-208ENST00000547298 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.42
CS-208ENST00000547298 BPTFQ12830 3046 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-208ENST00000547298 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-208ENST00000547298 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-208ENST00000547298 A0A1W2PRU2 124 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-208ENST00000547298 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
CS-208ENST00000547298 M0R2N6 131 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-208ENST00000547298 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
CS-208ENST00000547298 ATG13O75143 517 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-208ENST00000547298 RNF40O75150 1001 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-208ENST00000547298 C1QL1O75973 258 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-208ENST00000547298 VNN2O95498 520 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-208ENST00000547298 EGFP01133 1207 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-208ENST00000547298 EDN1P05305 212 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-208ENST00000547298 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
CS-208ENST00000547298 SEMA3BQ13214 749 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-208ENST00000547298 GLRA4Q5JXX5 417 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-208ENST00000547298 TPGS2Q68CL5 300 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-208ENST00000547298 NOSTRINQ8IVI9 506 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-208ENST00000547298 LEMD2Q8NC56 503 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-208ENST00000547298 FAM200AQ8TCP9 573 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-208ENST00000547298 BICD2Q8TD16 824 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-208ENST00000547298 DNAJC25Q9H1X3 360 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-208ENST00000547298 VPS54Q9P1Q0 977 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-208ENST00000547298 INVSQ9Y283 1065 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-208ENST00000547298 USP20Q9Y2K6 914 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-208ENST00000547298 NUP205Q92621 2012 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-208ENST00000547298 ABCA7Q8IZY2 2146 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-208ENST00000547298 CACNA1EQ15878 2313 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-208ENST00000547298 UPK3BL1B0FP48 263 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-208ENST00000547298 UPK3BL2E5RIL1 263 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-208ENST00000547298 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP12.44□□□□□ -0.42
CS-208ENST00000547298 PRAMEF12O95522 483 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-208ENST00000547298 PRB1P04280 392 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-208ENST00000547298 BCKDHBP21953 392 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-208ENST00000547298 RCAN1P53805 252 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-208ENST00000547298 KARSQ15046 597 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
CS-208ENST00000547298 GAREM2Q75VX8 874 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-208ENST00000547298 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
CS-208ENST00000547298 LRIG1Q96JA1 1093 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-208ENST00000547298 CRISPLD1Q9H336 500 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-208ENST00000547298 FZD8Q9H461 694 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-208ENST00000547298 SLC32A1Q9H598 525 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-208ENST00000547298 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-208ENST00000547298 KCNMB3Q9NPA1 279 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-208ENST00000547298 HPS4Q9NQG7 708 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-208ENST00000547298 OBP2AQ9NY56 170 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-208ENST00000547298 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
CS-208ENST00000547298 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms