RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 EPHB4P54760 987 aa21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 DMTNQ08495 405 aa21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 EEF1DP3Q658K8 133 aa21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 GDF3Q9NR23 364 aa21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 SRRDQ9UH36 339 aa21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 HPCAL4Q9UM19 191 aa21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3-211ENST00000539589 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 PGK1P00558 417 aa21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 PHKA2P46019 1235 aa21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 C11orf63Q6NUN7 778 aa21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 EMBQ6PCB8 327 aa21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 RUFY4Q6ZNE9 571 aa21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 ACP6Q9NPH0 428 aa21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 MED4Q9NPJ6 270 aa21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC188H7C350 402 aa21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 SEPT4O43236 478 aa21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 HLA-DRAP01903 254 aa21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 GLI1P08151 1106 aa21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 TNFSF9P41273 254 aa21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 PIK3CAP42336 1068 aa21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 MCL1Q07820 350 aa21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 BIRC3Q13489 604 aa21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 PTPRJQ12913 1337 aa21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM170AA1A519 330 aa21.69■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 GUCY2DQ02846 1103 aa21.69■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM187BQ17R55 369 aa21.69■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 ATF7IP2Q5U623 682 aa21.69■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 KLHL7Q8IXQ5 586 aa21.69■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 EPB41L5Q9HCM4 733 aa21.69■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa21.69■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 THSD7BQ9C0I4 1608 aa21.69■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 GPR25O00155 361 aa21.68■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 KRIT1O00522 736 aa21.68■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 MTA2O94776 668 aa21.68■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP21.68■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM62Q0P6H9 643 aa21.68■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP21.68■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM71BQ8TC56 605 aa21.68■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 ELMO3Q96BJ8 720 aa21.68■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 CGRRF1Q99675 332 aa21.68■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 TCHPQ9BT92 498 aa21.68■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 CARD9Q9H257 536 aa21.68■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 ALG6Q9Y672 507 aa21.68■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 TREHO43280 583 aa21.68■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 PAK2Q13177 524 aa21.68■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 GNASQ5JWF2 1037 aa21.68■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 NLRP7Q8WX94 980 aa21.68■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 ADAMTS10Q9H324 1103 aa21.68■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 CDHR5Q9HBB8 845 aa21.68■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 RAD51CO43502 376 aa21.67■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 ADAMTS4O75173 837 aa21.67■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 HOXC8P31273 242 aa21.67■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 BPIFB4P59827 614 aa21.67■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 CLUL1Q15846 466 aa21.67■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 MPZL3Q6UWV2 235 aa21.67■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 AP1M1Q9BXS5 423 aa21.67■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 GTF3C4Q9UKN8 822 aa21.67■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 TNFSF13BQ9Y275 285 aa21.67■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa21.67■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 OGTO15294 1046 aa21.67■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 GPR32O75388 356 aa21.67■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 CYP1A2P05177 515 aa21.67■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 CYP2C9P11712 490 aa21.67■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 NKX3-2P78367 333 aa21.67■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 NNTQ13423 1086 aa21.67■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 KIZQ2M2Z5 673 aa21.67■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 ACAD10Q6JQN1 1059 aa21.67■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF677Q86XU0 584 aa21.67■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 CEP120Q8N960 986 aa21.67■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 CAVIN3Q969G5 261 aa21.67■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 RPS6KC1Q96S38 1066 aa21.67■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa21.67■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 VNN1O95497 513 aa21.66■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 RARBP10826 455 aa21.66■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 CXCL17Q6UXB2 119 aa21.66■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 BRSK2Q8IWQ3 736 aa21.66■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 UBL4BQ8N7F7 174 aa21.66■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF653Q96CK0 615 aa21.66■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 CPB2Q96IY4 423 aa21.66■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 KATNAL1Q9BW62 490 aa21.66■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 CDT1Q9H211 546 aa21.66■■□□□ 1.06
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