RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519674.1

TRPS1-209, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-209ENST00000519674 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 PFKPQ01813 784 aa8.98□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 MTFR1Q15390 333 aa8.98□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 ACSBG2Q5FVE4 666 aa8.98□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 MIIPQ5JXC2 388 aa8.98□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 DEPDC1Q5TB30 811 aa8.98□□□□□ -0.97
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TRPS1-209ENST00000519674 CENPPQ6IPU0 288 aa8.98□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 CCDC174Q6PII3 467 aa8.98□□□□□ -0.97
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TRPS1-209ENST00000519674 TAOK1Q7L7X3 1001 aa8.98□□□□□ -0.97
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TRPS1-209ENST00000519674 USP33Q8TEY7 942 aa8.98□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 CKAP2Q8WWK9 683 aa8.98□□□□□ -0.97
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TRPS1-209ENST00000519674 PSMG1O95456 288 aa8.97□□□□□ -0.97
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TRPS1-209ENST00000519674 CLRN2A0PK11 232 aa8.97□□□□□ -0.97
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TRPS1-209ENST00000519674 MFSD5Q6N075 450 aa8.96□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 C14orf80Q86SX3 495 aa8.96□□□□□ -0.97
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TRPS1-209ENST00000519674 SH3PXD2BA1X283 911 aa8.96□□□□□ -0.98
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TRPS1-209ENST00000519674 EHHADHQ08426 723 aa8.96□□□□□ -0.98
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TRPS1-209ENST00000519674 FBXO11Q86XK2 927 aa8.96□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa8.96□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP8.96□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 DNAJC19Q96DA6 116 aa8.96□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 MIPEPQ99797 713 aa8.96□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 STK33Q9BYT3 514 aa8.96□□□□□ -0.98
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